49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3286 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  86.84 
 
 
418 aa  709    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  862    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  92.82 
 
 
437 aa  756    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  96.82 
 
 
428 aa  776    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  95.31 
 
 
424 aa  788    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  75.38 
 
 
388 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  75.75 
 
 
401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  76.73 
 
 
401 aa  568  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  72.97 
 
 
401 aa  564  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  46.94 
 
 
388 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  48.85 
 
 
388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  46.55 
 
 
388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  46.23 
 
 
382 aa  312  9e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  47.57 
 
 
407 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  49.62 
 
 
388 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  44.95 
 
 
402 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  46.8 
 
 
405 aa  300  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  46.94 
 
 
429 aa  299  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  49.11 
 
 
382 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  44.5 
 
 
382 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  48.85 
 
 
388 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  44.72 
 
 
382 aa  289  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  52.55 
 
 
384 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  47.06 
 
 
382 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  43.83 
 
 
397 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  48.86 
 
 
398 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  47.31 
 
 
421 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  52.3 
 
 
384 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  44.02 
 
 
385 aa  259  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  44.67 
 
 
387 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  45.38 
 
 
392 aa  249  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  37.74 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  36.7 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  37.47 
 
 
388 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  34.4 
 
 
398 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  33.26 
 
 
414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  38.06 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  32.63 
 
 
408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  35.69 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  35.53 
 
 
388 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  33.33 
 
 
407 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  34.9 
 
 
440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  31.6 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  27.99 
 
 
375 aa  113  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  29.23 
 
 
383 aa  89.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  25.49 
 
 
389 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  26.48 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  27.16 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  25.56 
 
 
246 aa  44.3  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>