48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4226 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  100 
 
 		 389 aa  764    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  80.72 
 
 		 389 aa  599  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  53.93 
 
 		 388 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  26.46 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  27.78 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  27.02 
 
 		 388 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  28.61 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  28.74 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  29.97 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  26.02 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  26.41 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  27.48 
 
 		 407 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  29.04 
 
 		 405 aa  86.3  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  25.24 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  24.78 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  26.84 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  26.88 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  26.23 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  26.62 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  28.66 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  27.17 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  24.2 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  24.01 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  25.24 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  24.63 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  28.62 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  28.49 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  28.57 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  24.51 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  25.58 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  26.58 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  27.54 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  24.92 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  28.7 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  26.74 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  27.14 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  26.18 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  24.61 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  27.59 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  30.81 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  27.74 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  28.07 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  23.39 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  28.78 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  25.93 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  27.41 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  29.55 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  28.87 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>