49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5634 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  811    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  44.5 
 
 		 414 aa  307  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  41.48 
 
 		 398 aa  296  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  44.44 
 
 		 388 aa  295  9e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  40.9 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  39.45 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  41.56 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  40.35 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  37.78 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  38.19 
 
 		 388 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  39.8 
 
 		 382 aa  249  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  36.54 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  45.51 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  38.18 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  39.49 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  38.54 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  37.5 
 
 		 426 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  37.5 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  40.15 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  37.98 
 
 		 428 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  39.95 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  37.08 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  38.99 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  36.79 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  38.64 
 
 		 405 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  44.48 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  36.34 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  37.71 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  39.95 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  41.08 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  40.32 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  40.15 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  42.39 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  41.14 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  35.43 
 
 		 429 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  44.2 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  39.24 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  35.68 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  40.15 
 
 		 384 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  40.15 
 
 		 384 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  37.32 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  34.63 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  31.44 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  27.95 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  25.18 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  25.31 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  27.56 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  27.03 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  25.45 
 
 		 355 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>