50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1906 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  768    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  90.58 
 
 		 382 aa  687    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  59.74 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  59.47 
 
 		 388 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  61.21 
 
 		 388 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  61.9 
 
 		 388 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  59.57 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  58.24 
 
 		 405 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  59.84 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  61.38 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  60.05 
 
 		 421 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  62.33 
 
 		 384 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  62.86 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  55.24 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  54.01 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  51.99 
 
 		 402 aa  368  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  48.68 
 
 		 382 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  49.74 
 
 		 388 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  48.54 
 
 		 397 aa  319  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  49.48 
 
 		 401 aa  311  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  48.19 
 
 		 401 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  48.78 
 
 		 398 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  48.43 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  46.37 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  46.23 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  46.4 
 
 		 437 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  46.12 
 
 		 424 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  47.33 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  49.73 
 
 		 385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  52.9 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  42.26 
 
 		 401 aa  259  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  50.16 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  35.53 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  39.4 
 
 		 398 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  34.17 
 
 		 398 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  35.46 
 
 		 388 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  35.24 
 
 		 408 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  40.32 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  38.2 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  36.26 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  36.14 
 
 		 388 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  32.68 
 
 		 407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  29.72 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  28.39 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  28.24 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  28.74 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  28.21 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  26.8 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  29.49 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  28.7 
 
 		 244 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>