49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0289 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  100 
 
 		 399 aa  806    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  38.54 
 
 		 401 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  38.92 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  37.6 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  35.03 
 
 		 408 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  36.82 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  36.53 
 
 		 388 aa  229  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  35.57 
 
 		 414 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  35.47 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  37.21 
 
 		 382 aa  225  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  37.68 
 
 		 388 aa  225  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  37.16 
 
 		 388 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  36.36 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  35.05 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  31.62 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  37.21 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  36.81 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  35.5 
 
 		 382 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  36.19 
 
 		 398 aa  200  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  39.51 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  36.39 
 
 		 401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  35.69 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  34.77 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  36.7 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  36.73 
 
 		 429 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  40.51 
 
 		 392 aa  195  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  36.75 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  35.69 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  33.97 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  35.61 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  40.12 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  36.71 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  34.28 
 
 		 437 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  35.61 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  40.88 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  35.05 
 
 		 421 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  34.76 
 
 		 418 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  37.85 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  33.25 
 
 		 392 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  34.25 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  36.96 
 
 		 384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  32.95 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  36.15 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  27.25 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  25.93 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  26.25 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  25.56 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  23.64 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  27.8 
 
 		 254 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>