61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1261 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  681    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  49.84 
 
 
326 aa  292  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  50.49 
 
 
328 aa  278  9e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  49.66 
 
 
298 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  43.15 
 
 
365 aa  252  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  46.82 
 
 
322 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  41.14 
 
 
329 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  40.82 
 
 
329 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  43.41 
 
 
263 aa  189  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  40.93 
 
 
244 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  46.49 
 
 
339 aa  155  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  41.36 
 
 
334 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  39.8 
 
 
328 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  38.36 
 
 
328 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  33.9 
 
 
258 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  33.2 
 
 
244 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  32.95 
 
 
264 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  35.48 
 
 
243 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  33.05 
 
 
258 aa  113  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  35.47 
 
 
232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  34.84 
 
 
249 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  32.11 
 
 
256 aa  106  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  30.74 
 
 
253 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  31.82 
 
 
256 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  34.14 
 
 
245 aa  97.8  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  33.06 
 
 
246 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  34.26 
 
 
241 aa  97.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  28.45 
 
 
245 aa  95.9  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  28.45 
 
 
245 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  35.37 
 
 
263 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  33.05 
 
 
261 aa  89.7  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  29.31 
 
 
234 aa  89.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  29.31 
 
 
254 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  30.74 
 
 
235 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  29.2 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  31.12 
 
 
244 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  27.59 
 
 
245 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  27.5 
 
 
237 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0380  hypothetical protein  53.15 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.421494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  27.54 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0771  protein of unknown function DUF1624  26.51 
 
 
254 aa  64.3  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.627513  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  27.13 
 
 
270 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  25.54 
 
 
428 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  25.96 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  27.93 
 
 
418 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  25.86 
 
 
437 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  25.54 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  25.11 
 
 
424 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  27.95 
 
 
388 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  25.44 
 
 
388 aa  49.3  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  25.57 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  27.65 
 
 
392 aa  47  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  25 
 
 
414 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  26.13 
 
 
388 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  25.23 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  26.19 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  26.72 
 
 
264 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  24.19 
 
 
382 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  25.7 
 
 
401 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  26.82 
 
 
382 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>