44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2952 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  518  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  71.49 
 
 
256 aa  342  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  70.68 
 
 
256 aa  338  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  63.33 
 
 
244 aa  294  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  62.11 
 
 
258 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  61.25 
 
 
243 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  55.24 
 
 
258 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  34.92 
 
 
326 aa  121  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  34.11 
 
 
322 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  34.98 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  30.04 
 
 
244 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  32.6 
 
 
365 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  35.24 
 
 
298 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  31.58 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  27.06 
 
 
253 aa  95.5  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  35.11 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  29.84 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  28.27 
 
 
229 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  28.57 
 
 
246 aa  87  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  29.84 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  30.99 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  22.54 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  28.75 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  31.4 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  29.27 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  35.06 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  35.06 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  20.65 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  22 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  33.62 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  24.69 
 
 
234 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  25.1 
 
 
237 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  25.59 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  24.69 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  33.04 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  23.9 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  31.75 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  24.61 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  29.92 
 
 
244 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  24.17 
 
 
264 aa  46.2  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  21.92 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  25.98 
 
 
382 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  28.57 
 
 
382 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>