44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2615 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  645    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  51.23 
 
 		 329 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  51.82 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  48.92 
 
 		 365 aa  291  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  48.76 
 
 		 326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  48.11 
 
 		 328 aa  271  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  48.63 
 
 		 298 aa  252  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  46.82 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  47.35 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  40.08 
 
 		 244 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  39.59 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  39.75 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  40.38 
 
 		 334 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  40.28 
 
 		 339 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  35 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  37.39 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  34 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  36.94 
 
 		 232 aa  115  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  32.51 
 
 		 256 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  34.15 
 
 		 243 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  32.22 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  36.36 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  30.2 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  32.53 
 
 		 246 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  28.21 
 
 		 245 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  32.42 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  29.49 
 
 		 245 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  35.17 
 
 		 241 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  30.25 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  33.05 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  27.35 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  29.46 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  29.27 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  33.2 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  30.67 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  30.21 
 
 		 229 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  25 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  24.79 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  26.18 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0771  protein of unknown function DUF1624  27.02 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.627513  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  27.6 
 
 		 264 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0380  hypothetical protein  44.35 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.421494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>