43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1864 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  100 
 
 
329 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  86.32 
 
 
329 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  51.23 
 
 
322 aa  298  7e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  45.74 
 
 
365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  44.27 
 
 
326 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  43.65 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  42.35 
 
 
298 aa  222  9e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  40.82 
 
 
335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  40.84 
 
 
263 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  34.77 
 
 
244 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  34.58 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  34.2 
 
 
328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  34.52 
 
 
328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  33.55 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  33.75 
 
 
339 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  32.37 
 
 
244 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  29.44 
 
 
258 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  28.02 
 
 
258 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  29.05 
 
 
256 aa  97.1  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  33.06 
 
 
243 aa  96.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  29.11 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  32.07 
 
 
232 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  28.46 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  30.83 
 
 
249 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  30.62 
 
 
246 aa  89.4  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  37.07 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  27.24 
 
 
245 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  32.26 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  29.75 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  24.8 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  31.89 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  28.99 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  28.33 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  28.96 
 
 
261 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  31.76 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  25.52 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  29.08 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  27.31 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  29.46 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0771  protein of unknown function DUF1624  27.02 
 
 
254 aa  65.1  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.627513  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0380  hypothetical protein  49.07 
 
 
336 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.421494 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  24.78 
 
 
254 aa  55.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  25.29 
 
 
270 aa  52.8  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>