35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0771 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0771  protein of unknown function DUF1624  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.627513  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  31.33 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  29.83 
 
 		 234 aa  88.6  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  30.08 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  27.02 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  28 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  26.67 
 
 		 329 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  25.78 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  27.02 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  30.13 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  28.63 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  29.46 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  28.14 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  27.38 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  26.46 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  26.19 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  25.4 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  26.51 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  26.24 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  26.51 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  26.12 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  26.09 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  26.09 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  26.36 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  24.9 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  35.56 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  22.22 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  24.6 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  25.2 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  25.9 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  23.64 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  22.58 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  26.17 
 
 		 241 aa  42  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>