157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0111 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0111  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 		 353 aa  734    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03505  conserved hypothetical protein  44.66 
 
 		 380 aa  282  7.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  26.75 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  23.98 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  25.82 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0526  D-alanine--D-alanine ligase  28.75 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000337974  hitchhiker  0.0000125004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  25.93 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  26.67 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  25.32 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  25 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  25.51 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  25.74 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  25.51 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  25.51 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  25.74 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  25.74 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  25.74 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  25.78 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2858  D-alanine--D-alanine ligase  24.62 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000136858  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  25.6 
 
 		 743 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3371  D-alanine/D-alanine ligase  27.81 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0642922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  25.51 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1749  D-alanine--D-alanine ligase  27.23 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  25.78 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2030  D-alanine--D-alanine ligase  27.85 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.24983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  24.19 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  24.79 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  25.74 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  24.63 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  24.63 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  24.63 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4976  D-alanine/D-alanine ligase  23.53 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  26.8 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2222  hypothetical protein  24.43 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  24.02 
 
 		 313 aa  55.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  27.35 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  24.76 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  25.31 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  22.88 
 
 		 319 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  24.26 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  23.16 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  26.69 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  25 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  26.69 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  22.93 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  24.61 
 
 		 304 aa  53.5  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  24.08 
 
 		 305 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  23.11 
 
 		 663 aa  52.8  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  28.41 
 
 		 893 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  24.89 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  23.67 
 
 		 310 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.56 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  22.67 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1640  D-alanine--D-alanine ligase  23.63 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  25.32 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  24.9 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  24.4 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  23.49 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  26.91 
 
 		 303 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  23.64 
 
 		 336 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0139  D-alanine--D-alanine ligase  25.26 
 
 		 285 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.517972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  24 
 
 		 315 aa  50.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  26.51 
 
 		 303 aa  50.4  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  22.69 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  25.64 
 
 		 319 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  30.68 
 
 		 423 aa  50.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  21.58 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  25.64 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1747  D-alanine--D-alanine ligase  27.84 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2190  D-alanine--D-alanine ligase  24.89 
 
 		 311 aa  49.7  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.10394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  29.92 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  24.5 
 
 		 302 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  28.57 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.35 
 
 		 422 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0944  D-alanine--D-alanine ligase  26.04 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000259534  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  23.63 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  21.81 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  24.89 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  21.81 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5406  D-alanine--D-alanine ligase  22.69 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  23.63 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6426  D-alanine/D-alanine ligase  31.43 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1501  hypothetical protein  26.6 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  23.63 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  23.67 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  26.75 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.83 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  23.83 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3167  D-alanine--D-alanine ligase  25.42 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  25.85 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2198  D-alanine/D-alanine ligase  24.75 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0703567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0729  D-alanyl-alanine synthetase A  25.31 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2426  D-alanine--D-alanine ligase  24.14 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142396  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0201  D-alanyl-alanine synthetase A  20.23 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  26.19 
 
 		 410 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  24.89 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1784  D-alanine--D-alanine ligase  29.17 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  28 
 
 		 881 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  24.79 
 
 		 310 aa  46.2  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>