229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2418 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2418  putative ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 622 aa  1263    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.197345  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2719  pathogenesis-related protein  40.5 
 
 		 639 aa  475  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5468  pathogenesis-related protein  39.14 
 
 		 639 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1438  pathogenesis-related protein  37.6 
 
 		 650 aa  438  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0692667  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3656  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.17 
 
 		 637 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.317383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4220  hypothetical protein  32.69 
 
 		 628 aa  287  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3888  hypothetical protein  30.65 
 
 		 631 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1801  hypothetical protein  30.4 
 
 		 625 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6475  hypothetical protein  32 
 
 		 628 aa  280  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.574703  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4906  pathogenesis-related protein  33.23 
 
 		 649 aa  279  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.827624  normal  0.119775 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0295  hypothetical protein  31.16 
 
 		 629 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60080  hypothetical protein  28.94 
 
 		 643 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581559  hitchhiker  0.0000000248833 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4971  DNA helicase II  27.47 
 
 		 585 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2792  DNA helicase II  27.47 
 
 		 585 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.336571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2850  hypothetical protein  23.79 
 
 		 579 aa  143  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0207  hypothetical protein  22.31 
 
 		 578 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  29.92 
 
 		 634 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0682  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.38 
 
 		 634 aa  125  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  30.06 
 
 		 627 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3806  DNA helicase II  22.32 
 
 		 588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939631  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0596  hypothetical protein  24.73 
 
 		 707 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  25.07 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  24.63 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  24.05 
 
 		 658 aa  60.8  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.32 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 735 aa  58.2  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1873  UvrD/REP helicase  23.18 
 
 		 591 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.100548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3542  UvrD/REP helicase  24.57 
 
 		 672 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.634729 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3574  UvrD/REP helicase  23.36 
 
 		 646 aa  57.4  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  20.95 
 
 		 682 aa  56.2  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  25.36 
 
 		 625 aa  56.2  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.6 
 
 		 751 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.6 
 
 		 751 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.65 
 
 		 837 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  24.39 
 
 		 714 aa  55.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5487  putative ATP-dependent DNA helicase Rep  22.7 
 
 		 591 aa  55.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  22.9 
 
 		 725 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0675  UvrD/REP helicase  25.6 
 
 		 599 aa  54.3  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771705 
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  23.3 
 
 		 765 aa  53.9  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 		 768 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  21.96 
 
 		 726 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  23.79 
 
 		 736 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  22.68 
 
 		 698 aa  53.5  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  23.77 
 
 		 728 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  24.56 
 
 		 723 aa  53.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  22.03 
 
 		 726 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  24.56 
 
 		 723 aa  53.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  23.93 
 
 		 659 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.92 
 
 		 658 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.94 
 
 		 830 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.22 
 
 		 765 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.91 
 
 		 669 aa  52.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  24.83 
 
 		 719 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  23.26 
 
 		 807 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3742  UvrD/REP helicase  19.93 
 
 		 1142 aa  53.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.404574  normal  0.909717 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  25.87 
 
 		 724 aa  52.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  23.49 
 
 		 678 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.47 
 
 		 797 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  20.92 
 
 		 1244 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 		 620 aa  52  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0406  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.61 
 
 		 670 aa  51.2  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1645  UvrD/REP helicase  23.46 
 
 		 606 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.417198  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  24 
 
 		 849 aa  51.2  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  24.23 
 
 		 659 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.3 
 
 		 1016 aa  51.2  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  19.44 
 
 		 1127 aa  50.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0039  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 		 599 aa  50.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.830062  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  24.41 
 
 		 724 aa  50.8  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  23 
 
 		 662 aa  50.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4106  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.3 
 
 		 685 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  23 
 
 		 662 aa  50.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3913  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.3 
 
 		 670 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4012  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.3 
 
 		 670 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  23.49 
 
 		 634 aa  50.4  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.24 
 
 		 677 aa  50.4  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.57 
 
 		 670 aa  50.4  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0990  UvrD/REP helicase  25.9 
 
 		 674 aa  50.4  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.771752  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3990  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.3 
 
 		 670 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3407  UvrD/REP helicase  22.18 
 
 		 604 aa  50.4  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0218597  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.33 
 
 		 677 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.26 
 
 		 639 aa  50.1  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  23.33 
 
 		 677 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  22.41 
 
 		 735 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  25 
 
 		 670 aa  50.4  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  25 
 
 		 772 aa  49.7  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.94 
 
 		 759 aa  49.3  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  21.77 
 
 		 797 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2573  hypothetical protein  26.27 
 
 		 260 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000474072  normal  0.0702383 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.4 
 
 		 671 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  20.84 
 
 		 1089 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.73 
 
 		 729 aa  49.7  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  22.07 
 
 		 741 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4251  UvrD/REP helicase  22.5 
 
 		 715 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2446  UvrD/REP helicase  21.46 
 
 		 1141 aa  49.7  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.18 
 
 		 663 aa  48.5  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  24.56 
 
 		 742 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  23.08 
 
 		 674 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.17 
 
 		 747 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2555  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.08 
 
 		 671 aa  48.5  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614472  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.02 
 
 		 730 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>