More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6475 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3888  hypothetical protein  55.56 
 
 		 631 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1801  hypothetical protein  64.16 
 
 		 625 aa  823    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6475  hypothetical protein  100 
 
 		 628 aa  1276    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.574703  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0295  hypothetical protein  50.87 
 
 		 629 aa  618  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3656  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  45.32 
 
 		 637 aa  573  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.317383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4220  hypothetical protein  47.04 
 
 		 628 aa  557  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60080  hypothetical protein  44.39 
 
 		 643 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581559  hitchhiker  0.0000000248833 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5468  pathogenesis-related protein  33.76 
 
 		 639 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1438  pathogenesis-related protein  33.23 
 
 		 650 aa  291  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0692667  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2719  pathogenesis-related protein  31.72 
 
 		 639 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2418  putative ATP-dependent DNA helicase  32 
 
 		 622 aa  273  8.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.197345  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4971  DNA helicase II  32.79 
 
 		 585 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2792  DNA helicase II  32.79 
 
 		 585 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.336571 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4906  pathogenesis-related protein  29.97 
 
 		 649 aa  200  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.827624  normal  0.119775 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2850  hypothetical protein  27.91 
 
 		 579 aa  170  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0207  hypothetical protein  28.43 
 
 		 578 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0682  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.78 
 
 		 634 aa  150  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3806  DNA helicase II  28.09 
 
 		 588 aa  147  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939631  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  31.61 
 
 		 634 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 627 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.48 
 
 		 932 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  27.87 
 
 		 706 aa  75.1  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0596  hypothetical protein  36.36 
 
 		 707 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  27.88 
 
 		 726 aa  70.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  27.11 
 
 		 668 aa  66.6  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  28.42 
 
 		 708 aa  67  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.75 
 
 		 772 aa  65.1  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  25.4 
 
 		 724 aa  64.3  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.81 
 
 		 762 aa  64.3  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 		 702 aa  64.3  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0402  UvrD/REP helicase  25.29 
 
 		 712 aa  63.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  23.73 
 
 		 783 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  22.56 
 
 		 735 aa  62.4  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  25.17 
 
 		 678 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  25.18 
 
 		 671 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.9 
 
 		 817 aa  62.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  25.18 
 
 		 671 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.07 
 
 		 658 aa  62  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  25.4 
 
 		 724 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  25.26 
 
 		 696 aa  62  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.21 
 
 		 737 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  24.69 
 
 		 666 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  27.38 
 
 		 736 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  25.24 
 
 		 724 aa  61.6  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.35 
 
 		 715 aa  61.6  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  25.71 
 
 		 725 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.82 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  27.34 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.71 
 
 		 781 aa  60.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  25.7 
 
 		 712 aa  60.5  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.74 
 
 		 694 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  22.33 
 
 		 724 aa  60.1  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.27 
 
 		 640 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  22.97 
 
 		 946 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  26.04 
 
 		 688 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  26.13 
 
 		 723 aa  59.7  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.87 
 
 		 747 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.73 
 
 		 730 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  26.64 
 
 		 771 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  24.42 
 
 		 665 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  22.97 
 
 		 946 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  23.71 
 
 		 723 aa  58.5  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.94 
 
 		 785 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.13 
 
 		 742 aa  58.9  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  26.27 
 
 		 1134 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.52 
 
 		 751 aa  58.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  25.52 
 
 		 753 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  25.52 
 
 		 751 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.52 
 
 		 751 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.52 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.52 
 
 		 751 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  28.62 
 
 		 689 aa  58.2  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 1132 aa  58.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  27.13 
 
 		 1060 aa  57.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.52 
 
 		 747 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.91 
 
 		 753 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.91 
 
 		 753 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  24.39 
 
 		 743 aa  57.4  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0340  UvrD/REP helicase  23.73 
 
 		 951 aa  57.4  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  24.6 
 
 		 674 aa  57  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0868  putative ATP-dependent DNA helicase  24.82 
 
 		 676 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  24.43 
 
 		 720 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.87 
 
 		 802 aa  56.6  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  30.28 
 
 		 1232 aa  56.6  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  24.43 
 
 		 720 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  22.38 
 
 		 625 aa  56.6  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  24.43 
 
 		 720 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  26.65 
 
 		 668 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  25.08 
 
 		 681 aa  56.6  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  25.5 
 
 		 702 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.22 
 
 		 743 aa  56.6  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  24.43 
 
 		 720 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  24.43 
 
 		 720 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0798  putative ATP-dependent DNA helicase  24.82 
 
 		 676 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0871  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.87 
 
 		 1180 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  25.08 
 
 		 721 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02629  hypothetical protein  32.87 
 
 		 1180 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4241  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 		 907 aa  56.2  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000158675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2966  exonuclease V subunit beta  32.87 
 
 		 1180 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  27.46 
 
 		 725 aa  55.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>