210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0207 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3806  DNA helicase II  55.14 
 
 		 588 aa  638    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939631  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0207  hypothetical protein  100 
 
 		 578 aa  1197    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2850  hypothetical protein  77.34 
 
 		 579 aa  961    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4971  DNA helicase II  33.86 
 
 		 585 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2792  DNA helicase II  33.86 
 
 		 585 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.336571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1801  hypothetical protein  32.01 
 
 		 625 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0295  hypothetical protein  28.04 
 
 		 629 aa  174  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6475  hypothetical protein  28.43 
 
 		 628 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.574703  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3656  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.35 
 
 		 637 aa  167  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.317383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4220  hypothetical protein  26.57 
 
 		 628 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60080  hypothetical protein  27.39 
 
 		 643 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581559  hitchhiker  0.0000000248833 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5468  pathogenesis-related protein  27.64 
 
 		 639 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1438  pathogenesis-related protein  26 
 
 		 650 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0692667  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2719  pathogenesis-related protein  26.28 
 
 		 639 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2418  putative ATP-dependent DNA helicase  21.73 
 
 		 622 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.197345  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3888  hypothetical protein  33.59 
 
 		 631 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  27.75 
 
 		 634 aa  124  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0682  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.9 
 
 		 634 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  29.75 
 
 		 627 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1043  hypothetical protein  60.44 
 
 		 109 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0596  hypothetical protein  24.81 
 
 		 707 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4906  pathogenesis-related protein  28.79 
 
 		 649 aa  76.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.827624  normal  0.119775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  26.74 
 
 		 620 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  25.78 
 
 		 616 aa  62.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1873  UvrD/REP helicase  22.43 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.100548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2919  UvrD/REP helicase  26.09 
 
 		 621 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  21.64 
 
 		 666 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  23.03 
 
 		 742 aa  60.5  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.82 
 
 		 670 aa  58.5  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.96 
 
 		 757 aa  58.2  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  25.74 
 
 		 845 aa  57.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3681  helicase, putative  28.57 
 
 		 552 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3574  UvrD/REP helicase  23.23 
 
 		 646 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.85 
 
 		 768 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  22.46 
 
 		 735 aa  55.8  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.75 
 
 		 797 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.9 
 
 		 785 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.55 
 
 		 741 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  27.45 
 
 		 1032 aa  55.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 679 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.61 
 
 		 795 aa  54.3  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.88 
 
 		 677 aa  54.3  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 677 aa  54.3  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  26.24 
 
 		 714 aa  54.3  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  25.98 
 
 		 656 aa  53.9  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  24.49 
 
 		 625 aa  53.5  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.79 
 
 		 672 aa  53.9  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 694 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  28.28 
 
 		 641 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.95 
 
 		 781 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  25.44 
 
 		 687 aa  53.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.64 
 
 		 690 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4281  UvrD/REP helicase  26.18 
 
 		 716 aa  52.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344477  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.74 
 
 		 730 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.74 
 
 		 730 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 663 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  23.25 
 
 		 1132 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  24.65 
 
 		 726 aa  52  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4241  UvrD/REP helicase  26.25 
 
 		 907 aa  52  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000158675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 1075 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  27.24 
 
 		 659 aa  52  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  23.58 
 
 		 1082 aa  51.6  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  26.26 
 
 		 746 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 706 aa  51.6  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  23.81 
 
 		 1715 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  26.22 
 
 		 807 aa  51.2  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0352  UvrD/REP helicase  26.45 
 
 		 709 aa  51.2  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.877458  normal  0.0118212 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 725 aa  51.2  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  25.29 
 
 		 1089 aa  51.2  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.44 
 
 		 762 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  25.4 
 
 		 666 aa  50.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3174  UvrD/REP helicase  25.97 
 
 		 557 aa  50.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.938492  unclonable  0.0000000000000324964 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  29.49 
 
 		 630 aa  50.8  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.84 
 
 		 765 aa  50.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  35.71 
 
 		 665 aa  50.4  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  24 
 
 		 706 aa  50.4  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  38.46 
 
 		 787 aa  50.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.82 
 
 		 729 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.17 
 
 		 667 aa  50.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  22.47 
 
 		 762 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  24.72 
 
 		 698 aa  50.1  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  38.03 
 
 		 1165 aa  50.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  26.07 
 
 		 757 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  26.91 
 
 		 1174 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.65 
 
 		 731 aa  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2560  UvrD/REP helicase  26.73 
 
 		 553 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.232934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  25.13 
 
 		 1050 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  22.8 
 
 		 689 aa  49.3  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.3 
 
 		 794 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.27 
 
 		 663 aa  48.5  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.88 
 
 		 932 aa  48.5  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  21.79 
 
 		 754 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.09 
 
 		 751 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.09 
 
 		 751 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  24.83 
 
 		 743 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  25.64 
 
 		 668 aa  48.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.36 
 
 		 672 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.42 
 
 		 670 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.82 
 
 		 849 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>