202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_60080 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_60080  hypothetical protein  100 
 
 		 643 aa  1328    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581559  hitchhiker  0.0000000248833 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6475  hypothetical protein  44.39 
 
 		 628 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.574703  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1801  hypothetical protein  43.12 
 
 		 625 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3888  hypothetical protein  43.42 
 
 		 631 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0295  hypothetical protein  41.46 
 
 		 629 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3656  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  40.56 
 
 		 637 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.317383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4220  hypothetical protein  41.82 
 
 		 628 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1438  pathogenesis-related protein  31.5 
 
 		 650 aa  296  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0692667  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5468  pathogenesis-related protein  32.71 
 
 		 639 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2719  pathogenesis-related protein  31.78 
 
 		 639 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2418  putative ATP-dependent DNA helicase  28.78 
 
 		 622 aa  255  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.197345  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2792  DNA helicase II  28.64 
 
 		 585 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.336571 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4971  DNA helicase II  28.64 
 
 		 585 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146307 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4906  pathogenesis-related protein  29.72 
 
 		 649 aa  191  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.827624  normal  0.119775 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0207  hypothetical protein  27.39 
 
 		 578 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2850  hypothetical protein  27.36 
 
 		 579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3806  DNA helicase II  26.97 
 
 		 588 aa  141  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939631  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0682  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.08 
 
 		 634 aa  134  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 627 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0596  hypothetical protein  27.34 
 
 		 707 aa  124  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  28.61 
 
 		 634 aa  115  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  26.17 
 
 		 659 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  27.11 
 
 		 746 aa  65.1  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1043  hypothetical protein  42.05 
 
 		 109 aa  64.7  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.7 
 
 		 772 aa  60.1  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  21.11 
 
 		 698 aa  60.1  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.27 
 
 		 783 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  25.27 
 
 		 783 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.97 
 
 		 729 aa  58.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  24.33 
 
 		 659 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  26.92 
 
 		 706 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  25.08 
 
 		 900 aa  57.8  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  24.42 
 
 		 625 aa  56.6  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  27.85 
 
 		 726 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  27.27 
 
 		 723 aa  55.8  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  26.01 
 
 		 1127 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  24.04 
 
 		 735 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.63 
 
 		 741 aa  56.2  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  26.74 
 
 		 758 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  25.09 
 
 		 715 aa  55.5  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.68 
 
 		 737 aa  55.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  25.61 
 
 		 726 aa  54.7  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.19 
 
 		 659 aa  54.7  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  24.57 
 
 		 759 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  27.21 
 
 		 715 aa  54.7  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  23.69 
 
 		 724 aa  54.7  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  25 
 
 		 520 aa  54.3  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  24.66 
 
 		 735 aa  54.3  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  24.32 
 
 		 739 aa  53.9  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  23.26 
 
 		 689 aa  53.9  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  25.78 
 
 		 787 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  25.78 
 
 		 787 aa  53.5  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  26.55 
 
 		 846 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 706 aa  53.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  26.55 
 
 		 840 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  26.55 
 
 		 787 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  23.79 
 
 		 620 aa  53.5  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  26.55 
 
 		 787 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.57 
 
 		 797 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  25.78 
 
 		 787 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  25.78 
 
 		 787 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  23.42 
 
 		 751 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  26.55 
 
 		 787 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  25.53 
 
 		 634 aa  52.8  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.89 
 
 		 751 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  25.78 
 
 		 787 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.55 
 
 		 787 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.45 
 
 		 1089 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.89 
 
 		 747 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  26.55 
 
 		 786 aa  53.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  24.73 
 
 		 790 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  25.78 
 
 		 787 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  25.78 
 
 		 787 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  25.78 
 
 		 787 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  23.81 
 
 		 564 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  24.26 
 
 		 771 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.63 
 
 		 747 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  23.63 
 
 		 753 aa  52.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  23.63 
 
 		 751 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.63 
 
 		 753 aa  52  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.63 
 
 		 751 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.63 
 
 		 753 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.63 
 
 		 751 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  26.81 
 
 		 1244 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 		 708 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  24.41 
 
 		 726 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  25.15 
 
 		 728 aa  51.6  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  24.44 
 
 		 714 aa  51.6  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.04 
 
 		 795 aa  51.6  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.86 
 
 		 734 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  22.32 
 
 		 681 aa  51.2  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.61 
 
 		 741 aa  51.2  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  25.33 
 
 		 742 aa  50.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.13 
 
 		 658 aa  50.8  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.67 
 
 		 932 aa  50.8  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  24.32 
 
 		 768 aa  50.8  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.58 
 
 		 781 aa  50.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  23.88 
 
 		 689 aa  50.4  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.76 
 
 		 785 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  23.25 
 
 		 783 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>