21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1043 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1043  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0207  hypothetical protein  60.44 
 
 		 578 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2850  hypothetical protein  59.09 
 
 		 579 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3806  DNA helicase II  55.68 
 
 		 588 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939631  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60080  hypothetical protein  42.05 
 
 		 643 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581559  hitchhiker  0.0000000248833 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3888  hypothetical protein  40.86 
 
 		 631 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2792  DNA helicase II  44.3 
 
 		 585 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.336571 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4971  DNA helicase II  44.3 
 
 		 585 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4220  hypothetical protein  43.75 
 
 		 628 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1801  hypothetical protein  41.76 
 
 		 625 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3656  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  44.26 
 
 		 637 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.317383  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0596  hypothetical protein  53.19 
 
 		 707 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6475  hypothetical protein  49.21 
 
 		 628 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.574703  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1438  pathogenesis-related protein  42.67 
 
 		 650 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0692667  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0295  hypothetical protein  41.79 
 
 		 629 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0682  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.86 
 
 		 634 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2418  putative ATP-dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 622 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.197345  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5468  pathogenesis-related protein  34.41 
 
 		 639 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  43.33 
 
 		 634 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2719  pathogenesis-related protein  40.68 
 
 		 639 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  48.98 
 
 		 627 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>