72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0596 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0596  hypothetical protein  100 
 
 		 707 aa  1451    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3656  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.68 
 
 		 637 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.317383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60080  hypothetical protein  27.34 
 
 		 643 aa  124  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581559  hitchhiker  0.0000000248833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2792  DNA helicase II  23.94 
 
 		 585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.336571 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4971  DNA helicase II  23.94 
 
 		 585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4220  hypothetical protein  24.36 
 
 		 628 aa  111  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2418  putative ATP-dependent DNA helicase  24.62 
 
 		 622 aa  109  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.197345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0295  hypothetical protein  23.89 
 
 		 629 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1801  hypothetical protein  23.74 
 
 		 625 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0207  hypothetical protein  24.81 
 
 		 578 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0682  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.12 
 
 		 634 aa  96.7  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2850  hypothetical protein  24.39 
 
 		 579 aa  95.1  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  29.82 
 
 		 627 aa  88.2  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  31.6 
 
 		 634 aa  87.8  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3806  DNA helicase II  23.56 
 
 		 588 aa  84.3  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939631  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5468  pathogenesis-related protein  23.94 
 
 		 639 aa  83.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3888  hypothetical protein  23.11 
 
 		 631 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2719  pathogenesis-related protein  22.85 
 
 		 639 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6475  hypothetical protein  36.36 
 
 		 628 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.574703  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1438  pathogenesis-related protein  23.48 
 
 		 650 aa  72  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0692667  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 		 746 aa  57.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2179  UvrD/REP helicase  23.57 
 
 		 809 aa  55.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.577747  normal  0.847748 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  23.85 
 
 		 739 aa  52.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1043  hypothetical protein  53.19 
 
 		 109 aa  53.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  24.31 
 
 		 799 aa  51.6  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4906  pathogenesis-related protein  22.11 
 
 		 649 aa  51.2  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.827624  normal  0.119775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  20.78 
 
 		 708 aa  51.6  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  43.66 
 
 		 520 aa  51.2  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2446  UvrD/REP helicase  23.53 
 
 		 1141 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  24.47 
 
 		 630 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.1 
 
 		 828 aa  48.9  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  29.29 
 
 		 1075 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1561  UvrD/REP helicase  29.79 
 
 		 1054 aa  48.9  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.29 
 
 		 725 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  23.15 
 
 		 1134 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  23.91 
 
 		 1066 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  25.99 
 
 		 758 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  31.25 
 
 		 625 aa  48.1  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  35.14 
 
 		 737 aa  47.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  24.74 
 
 		 789 aa  47.4  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4241  UvrD/REP helicase  21.38 
 
 		 907 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000158675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.56 
 
 		 772 aa  47  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  36.25 
 
 		 762 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  25.59 
 
 		 757 aa  46.6  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.66 
 
 		 673 aa  47.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.46 
 
 		 729 aa  47  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.67 
 
 		 732 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  39.47 
 
 		 620 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1890  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.01 
 
 		 540 aa  46.6  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.53 
 
 		 765 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.68 
 
 		 667 aa  45.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  21.41 
 
 		 682 aa  45.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.14 
 
 		 1023 aa  45.8  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  32 
 
 		 1132 aa  45.8  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  40 
 
 		 757 aa  45.4  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.67 
 
 		 741 aa  45.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.8 
 
 		 694 aa  45.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.84 
 
 		 711 aa  45.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.14 
 
 		 851 aa  45.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  29.73 
 
 		 744 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.84 
 
 		 758 aa  44.7  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  19.76 
 
 		 663 aa  44.3  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.85 
 
 		 743 aa  44.7  0.007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  32.47 
 
 		 900 aa  44.3  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  20.43 
 
 		 1016 aa  44.3  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  34.92 
 
 		 702 aa  44.3  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.91 
 
 		 773 aa  44.3  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  29.93 
 
 		 671 aa  43.9  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.34 
 
 		 690 aa  44.3  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1050  UvrD/REP helicase  34.78 
 
 		 597 aa  43.9  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  32.89 
 
 		 770 aa  43.9  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.33 
 
 		 817 aa  43.9  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>