More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1561 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1561  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1054 aa  2170    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0644  UvrD/REP helicase  28.09 
 
 		 1109 aa  280  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  24.46 
 
 		 933 aa  127  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  22.83 
 
 		 1110 aa  124  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0764  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 		 1161 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  22.83 
 
 		 1110 aa  122  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  24.02 
 
 		 1120 aa  122  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  23.97 
 
 		 1124 aa  122  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  23.59 
 
 		 1156 aa  116  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  23.34 
 
 		 1052 aa  114  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  23.58 
 
 		 1180 aa  112  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  23.28 
 
 		 1180 aa  112  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.98 
 
 		 1177 aa  111  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  23.55 
 
 		 921 aa  111  7.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  23.5 
 
 		 1180 aa  110  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  23.53 
 
 		 907 aa  108  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  24.36 
 
 		 1125 aa  107  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1391  putative recombination protein RecB  27.66 
 
 		 923 aa  104  7e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0929  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.2 
 
 		 1216 aa  101  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  23.57 
 
 		 1106 aa  100  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  25.18 
 
 		 1185 aa  99.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  25.48 
 
 		 915 aa  98.6  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  25.19 
 
 		 1147 aa  96.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  22.16 
 
 		 1060 aa  93.2  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  25.45 
 
 		 1161 aa  93.2  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  24.39 
 
 		 1182 aa  91.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  26.17 
 
 		 1173 aa  91.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0979  UvrD/REP helicase  24.64 
 
 		 1173 aa  91.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.156033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  21.91 
 
 		 921 aa  88.6  6e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  23.72 
 
 		 1121 aa  88.6  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  24.59 
 
 		 1119 aa  87  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  22.49 
 
 		 939 aa  87.8  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.76 
 
 		 1183 aa  87.4  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  29.73 
 
 		 903 aa  86.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 		 1196 aa  86.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.04 
 
 		 1067 aa  85.9  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  22.98 
 
 		 1074 aa  85.5  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  23.14 
 
 		 1182 aa  85.1  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  24.36 
 
 		 1132 aa  85.1  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  24.12 
 
 		 1089 aa  85.1  0.000000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  24.01 
 
 		 1202 aa  84.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.44 
 
 		 1168 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  24.27 
 
 		 1159 aa  84  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  21.26 
 
 		 1155 aa  84  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1076 aa  82  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  24.93 
 
 		 1157 aa  82.4  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  23.67 
 
 		 1151 aa  81.6  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12091  UvrD/REP helicase subunit B  22.52 
 
 		 1208 aa  80.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  24.27 
 
 		 1140 aa  80.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.09 
 
 		 1208 aa  79.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0953517  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  25.03 
 
 		 1183 aa  78.2  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  30.95 
 
 		 921 aa  77.8  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.71 
 
 		 1089 aa  77.4  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12101  UvrD/REP helicase subunit B  22.55 
 
 		 1208 aa  77.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  24.85 
 
 		 1152 aa  77.4  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  32 
 
 		 1103 aa  77.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  30.95 
 
 		 921 aa  77  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  24.71 
 
 		 1161 aa  77  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11941  UvrD/REP helicase subunit B  19.22 
 
 		 1212 aa  76.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  24.5 
 
 		 715 aa  75.9  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  23.05 
 
 		 1208 aa  75.9  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1160  UvrD/REP helicase  22.97 
 
 		 1064 aa  75.9  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.737588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  34.19 
 
 		 1095 aa  75.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3578  UvrD/REP helicase  22.32 
 
 		 995 aa  75.1  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  23.37 
 
 		 1161 aa  74.7  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2171  Exodeoxyribonuclease V  24.63 
 
 		 1152 aa  74.7  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.64 
 
 		 1203 aa  74.7  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  23.63 
 
 		 1183 aa  74.7  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  23.86 
 
 		 1146 aa  74.3  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  23.71 
 
 		 1189 aa  73.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  29.08 
 
 		 1106 aa  73.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  22.1 
 
 		 1076 aa  73.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  23.76 
 
 		 1217 aa  73.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  23.76 
 
 		 1217 aa  73.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  22.14 
 
 		 689 aa  72.8  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  23.43 
 
 		 1166 aa  72.8  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  34.4 
 
 		 1168 aa  72.8  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.11 
 
 		 1209 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.68 
 
 		 1223 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  38.66 
 
 		 1173 aa  71.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  36 
 
 		 1054 aa  71.2  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0467  ATP-dependent DNA helicase UvrD  34.27 
 
 		 907 aa  70.5  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23 
 
 		 685 aa  70.5  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1797  Exodeoxyribonuclease V  23.63 
 
 		 1120 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00119316  normal  0.701381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  38.89 
 
 		 1197 aa  68.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  28.52 
 
 		 1118 aa  69.3  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.47 
 
 		 1129 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  26.47 
 
 		 1036 aa  68.9  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.2 
 
 		 1109 aa  68.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09621  UvrD/REP helicase subunit B  23.82 
 
 		 1274 aa  68.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  21.9 
 
 		 1204 aa  68.6  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1209  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.71 
 
 		 1097 aa  68.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1651  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.53 
 
 		 1226 aa  68.2  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  23.07 
 
 		 1061 aa  68.2  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  29.38 
 
 		 1183 aa  67.8  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.53 
 
 		 1226 aa  67.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  27.32 
 
 		 1167 aa  67.4  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1401  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.32 
 
 		 1221 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  32.8 
 
 		 1101 aa  66.6  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  32.8 
 
 		 1101 aa  66.6  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>