More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0736 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  100 
 
 		 939 aa  1883    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  55.64 
 
 		 933 aa  1030    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  38.86 
 
 		 921 aa  588  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1391  putative recombination protein RecB  38.22 
 
 		 923 aa  560  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  36.46 
 
 		 915 aa  490  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  35.22 
 
 		 921 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  34.97 
 
 		 921 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  34.97 
 
 		 921 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  33.61 
 
 		 907 aa  446  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  33.68 
 
 		 903 aa  442  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  25.43 
 
 		 1052 aa  172  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  23.63 
 
 		 1036 aa  139  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1136  UvrD/REP helicase  23.95 
 
 		 1112 aa  131  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0229402 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  27.11 
 
 		 1054 aa  131  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  23.8 
 
 		 854 aa  121  6e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  27.33 
 
 		 1168 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.56 
 
 		 860 aa  119  3e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  27.25 
 
 		 1125 aa  115  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  25.98 
 
 		 1156 aa  114  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  26.08 
 
 		 1060 aa  113  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  24.6 
 
 		 1155 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  25.46 
 
 		 1152 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  26.15 
 
 		 1101 aa  110  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  26.88 
 
 		 1124 aa  109  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  26.15 
 
 		 1101 aa  109  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0495  UvrD/REP helicase  25.95 
 
 		 981 aa  109  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.29 
 
 		 1183 aa  108  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  25.36 
 
 		 1103 aa  108  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0644  UvrD/REP helicase  26.54 
 
 		 1109 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4180  Exodeoxyribonuclease V  26.79 
 
 		 1073 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0648836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1797  Exodeoxyribonuclease V  26.73 
 
 		 1120 aa  104  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00119316  normal  0.701381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1140 aa  104  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1087 aa  103  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  25.95 
 
 		 1182 aa  102  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.59 
 
 		 1086 aa  102  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  26.51 
 
 		 1095 aa  101  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  33.5 
 
 		 1147 aa  96.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  24.27 
 
 		 1089 aa  94  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  24.9 
 
 		 1119 aa  93.6  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  27.01 
 
 		 1164 aa  92.4  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3578  UvrD/REP helicase  24.87 
 
 		 995 aa  92  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  25.14 
 
 		 1184 aa  91.3  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  21.71 
 
 		 1061 aa  90.1  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1561  UvrD/REP helicase  23.25 
 
 		 1054 aa  89  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.88 
 
 		 932 aa  88.2  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0764  UvrD/REP helicase  28.52 
 
 		 1161 aa  87.8  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  24.14 
 
 		 1080 aa  87  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  24.79 
 
 		 1117 aa  87  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0979  UvrD/REP helicase  29.77 
 
 		 1173 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.156033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.84 
 
 		 1067 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.44 
 
 		 685 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  25.62 
 
 		 1065 aa  83.2  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.62 
 
 		 682 aa  83.2  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 786 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  40.16 
 
 		 688 aa  82.4  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  22.76 
 
 		 1073 aa  82.4  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  32.69 
 
 		 1110 aa  82  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  23.03 
 
 		 1185 aa  81.6  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.29 
 
 		 1177 aa  81.6  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  24.66 
 
 		 668 aa  81.3  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  28.15 
 
 		 840 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.85 
 
 		 1200 aa  81.3  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.52 
 
 		 669 aa  80.5  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.06 
 
 		 672 aa  80.9  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0166  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.68 
 
 		 660 aa  80.9  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  28.15 
 
 		 787 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 787 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.57 
 
 		 787 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 846 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 787 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  28.03 
 
 		 728 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1401  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.08 
 
 		 1221 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0467  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.16 
 
 		 907 aa  80.5  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  27.87 
 
 		 1236 aa  80.1  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1359  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.36 
 
 		 1226 aa  79.3  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  24.41 
 
 		 723 aa  79.3  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  37.12 
 
 		 1173 aa  79.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  24.41 
 
 		 723 aa  79.3  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  32.24 
 
 		 729 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  27.62 
 
 		 728 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  30.37 
 
 		 726 aa  79  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  37.12 
 
 		 1173 aa  78.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  40.17 
 
 		 1187 aa  78.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  24.61 
 
 		 709 aa  78.6  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  24.61 
 
 		 709 aa  78.6  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  32.18 
 
 		 1147 aa  78.2  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  32.18 
 
 		 1147 aa  78.2  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  28.95 
 
 		 1157 aa  78.2  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  32.05 
 
 		 1110 aa  78.6  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  26.18 
 
 		 1343 aa  78.2  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  29.13 
 
 		 1147 aa  78.2  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  31.98 
 
 		 1151 aa  77.8  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2072  UvrD/REP helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1102 aa  77.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11941  UvrD/REP helicase subunit B  24.95 
 
 		 1212 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.58 
 
 		 677 aa  77.4  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  31.82 
 
 		 1196 aa  77  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  34.39 
 
 		 1132 aa  77  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  28.43 
 
 		 1143 aa  77.4  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  37.58 
 
 		 677 aa  77.4  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0070  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.37 
 
 		 671 aa  76.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>