More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0387 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  45.97 
 
 		 1089 aa  748    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  84.42 
 
 		 854 aa  1467    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  100 
 
 		 860 aa  1745    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  31.18 
 
 		 1156 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  30.55 
 
 		 1121 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  29.86 
 
 		 1187 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  29.71 
 
 		 1202 aa  388  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  29.33 
 
 		 1161 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.16 
 
 		 1156 aa  382  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  29.65 
 
 		 1106 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  29.72 
 
 		 1159 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  28.78 
 
 		 1189 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  28.05 
 
 		 1185 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  29.77 
 
 		 1125 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  29.22 
 
 		 1120 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  29.02 
 
 		 1119 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  28.97 
 
 		 1164 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  29.8 
 
 		 1164 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  29.45 
 
 		 1124 aa  372  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  29.33 
 
 		 1180 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  29.7 
 
 		 1183 aa  366  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  29.52 
 
 		 1106 aa  366  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 1162 aa  365  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  29.22 
 
 		 1180 aa  363  7.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  28.16 
 
 		 1182 aa  360  7e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  30.67 
 
 		 1155 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  29.06 
 
 		 1183 aa  357  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  28.63 
 
 		 1180 aa  356  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  25.7 
 
 		 1157 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.89 
 
 		 1183 aa  343  5.999999999999999e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  29.12 
 
 		 1151 aa  343  9e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  27.78 
 
 		 1167 aa  334  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  26.12 
 
 		 1166 aa  333  8e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  26.72 
 
 		 1161 aa  325  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  26.37 
 
 		 1147 aa  317  7e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.67 
 
 		 1177 aa  313  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  31.23 
 
 		 1161 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  26.43 
 
 		 1147 aa  300  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  26.32 
 
 		 1147 aa  300  9e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  30.34 
 
 		 1142 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  24.64 
 
 		 1157 aa  271  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  25.05 
 
 		 1157 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  26.72 
 
 		 1157 aa  265  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0467  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.11 
 
 		 907 aa  265  4e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  29.57 
 
 		 1165 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  24.51 
 
 		 1147 aa  243  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  21.55 
 
 		 1177 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  21.97 
 
 		 1089 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  21.5 
 
 		 1173 aa  164  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  21.8 
 
 		 1173 aa  162  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 		 1149 aa  159  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  20.92 
 
 		 1107 aa  156  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  27.29 
 
 		 1080 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  21.8 
 
 		 1117 aa  154  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  22.33 
 
 		 1140 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  20.94 
 
 		 1087 aa  152  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  21.88 
 
 		 1101 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1061 aa  144  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  21.22 
 
 		 1187 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  22.6 
 
 		 1241 aa  140  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  22.9 
 
 		 1226 aa  137  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  21.33 
 
 		 1162 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.66 
 
 		 1240 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  21.64 
 
 		 1242 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.11 
 
 		 1241 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  22.3 
 
 		 1161 aa  132  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1057 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  27.87 
 
 		 933 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.53 
 
 		 1086 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  22.01 
 
 		 1168 aa  128  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0979  UvrD/REP helicase  21.52 
 
 		 1173 aa  125  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.156033  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  21.34 
 
 		 833 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 		 1095 aa  123  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  23.82 
 
 		 1248 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.61 
 
 		 1197 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  22.56 
 
 		 1103 aa  121  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1814  exodeoxyribonuclease V beta chain  22.65 
 
 		 1242 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1746  UvrD/REP helicase  22.65 
 
 		 1243 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  24.9 
 
 		 907 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  22.62 
 
 		 1270 aa  119  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  26.92 
 
 		 915 aa  119  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  27.18 
 
 		 939 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.35 
 
 		 1271 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  20.92 
 
 		 1118 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  27.99 
 
 		 921 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  24.07 
 
 		 1110 aa  115  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.45 
 
 		 1251 aa  115  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  22.94 
 
 		 1165 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  21.58 
 
 		 1152 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  22.67 
 
 		 1074 aa  114  9e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.85 
 
 		 1241 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  23.28 
 
 		 1207 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.86 
 
 		 1067 aa  111  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  20.27 
 
 		 1110 aa  111  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.91 
 
 		 1230 aa  111  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  24.2 
 
 		 1185 aa  111  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.8 
 
 		 1241 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.52 
 
 		 1241 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  24.54 
 
 		 1121 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.85 
 
 		 1241 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>