More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_2020 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  42.93 
 
 		 1156 aa  801    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  47.7 
 
 		 1183 aa  950    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  99.58 
 
 		 1180 aa  2364    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  40.3 
 
 		 1161 aa  707    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  84.75 
 
 		 1180 aa  2002    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  38.17 
 
 		 1202 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  47.37 
 
 		 1182 aa  935    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  40.54 
 
 		 1187 aa  666    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  38.41 
 
 		 1164 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  40.75 
 
 		 1161 aa  691    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  39.38 
 
 		 1164 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  40.1 
 
 		 1165 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  40.88 
 
 		 1159 aa  721    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  41.4 
 
 		 1156 aa  723    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  46.91 
 
 		 1155 aa  1032    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  54.41 
 
 		 1177 aa  1117    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  100 
 
 		 1180 aa  2375    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  47.61 
 
 		 1183 aa  942    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  46.63 
 
 		 1189 aa  924    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  38.6 
 
 		 1183 aa  631  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  39.13 
 
 		 1147 aa  626  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  37.41 
 
 		 1162 aa  627  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  40.81 
 
 		 1157 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  41.07 
 
 		 1157 aa  609  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  38.49 
 
 		 1147 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  38.4 
 
 		 1147 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  36.81 
 
 		 1125 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  39.98 
 
 		 1167 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  38.2 
 
 		 1119 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  37.39 
 
 		 1185 aa  561  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  37.31 
 
 		 1124 aa  548  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  35.12 
 
 		 1121 aa  532  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  35.17 
 
 		 1120 aa  527  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  35.54 
 
 		 1161 aa  509  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  40.38 
 
 		 1106 aa  505  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  39.42 
 
 		 1157 aa  501  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  40.49 
 
 		 1106 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  30.48 
 
 		 1089 aa  452  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  36.26 
 
 		 1157 aa  390  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  36.8 
 
 		 1166 aa  375  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 		 854 aa  372  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.33 
 
 		 860 aa  365  3e-99  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  35.63 
 
 		 1142 aa  358  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  30.82 
 
 		 1147 aa  324  7e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  27.79 
 
 		 1173 aa  257  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1177 aa  251  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  27.83 
 
 		 1173 aa  251  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.03 
 
 		 1089 aa  227  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  24 
 
 		 1173 aa  208  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  27.9 
 
 		 1168 aa  201  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  24.39 
 
 		 1185 aa  198  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  26.55 
 
 		 1187 aa  196  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  26.13 
 
 		 1087 aa  196  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.59 
 
 		 1197 aa  194  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  51.47 
 
 		 1151 aa  188  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 1101 aa  187  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1057 aa  185  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  26.46 
 
 		 1140 aa  182  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0467  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.41 
 
 		 907 aa  182  2.9999999999999997e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  26.91 
 
 		 1103 aa  179  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  27.9 
 
 		 1095 aa  179  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  22.94 
 
 		 1121 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  26.51 
 
 		 1165 aa  169  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 1162 aa  162  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.62 
 
 		 1086 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  26.11 
 
 		 1230 aa  149  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  23.76 
 
 		 1282 aa  147  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  25.78 
 
 		 1117 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  25.21 
 
 		 1242 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  25.39 
 
 		 1132 aa  140  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  29.19 
 
 		 1080 aa  140  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  23.63 
 
 		 1236 aa  138  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  25.3 
 
 		 1115 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  29.21 
 
 		 1149 aa  132  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.34 
 
 		 1271 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.34 
 
 		 1203 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  21.86 
 
 		 1218 aa  129  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1061 aa  128  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0468  UvrD/REP helicase  26.04 
 
 		 1134 aa  126  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  23.13 
 
 		 1074 aa  127  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  24.67 
 
 		 1110 aa  125  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  30.34 
 
 		 1101 aa  124  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  25.25 
 
 		 1248 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.96 
 
 		 742 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  28.7 
 
 		 705 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  25.04 
 
 		 1233 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.18 
 
 		 1186 aa  116  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.78 
 
 		 1200 aa  116  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  28.7 
 
 		 1131 aa  116  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  29.47 
 
 		 1047 aa  116  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  24.87 
 
 		 1196 aa  115  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  25.13 
 
 		 1241 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  26.36 
 
 		 739 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  24.82 
 
 		 1377 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.38 
 
 		 1240 aa  112  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.43 
 
 		 772 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  23.78 
 
 		 933 aa  112  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.99 
 
 		 1200 aa  111  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  28.29 
 
 		 1226 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  25.63 
 
 		 1146 aa  109  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>