More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1276 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  38.22 
 
 		 1392 aa  756    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  41.61 
 
 		 1241 aa  909    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  41.69 
 
 		 1241 aa  907    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  41.61 
 
 		 1241 aa  909    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  41.53 
 
 		 1241 aa  903    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  41.45 
 
 		 1241 aa  907    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  41.61 
 
 		 1241 aa  914    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  100 
 
 		 1230 aa  2445    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  44.28 
 
 		 1242 aa  878    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  31.98 
 
 		 1377 aa  660    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  35.4 
 
 		 1282 aa  772    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  41.04 
 
 		 1251 aa  909    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  41.69 
 
 		 1241 aa  907    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  41.61 
 
 		 1240 aa  907    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  41.61 
 
 		 1241 aa  910    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  40.76 
 
 		 1405 aa  771    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  41.65 
 
 		 1242 aa  922    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  40.19 
 
 		 1248 aa  927    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  41.61 
 
 		 1241 aa  907    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  37.69 
 
 		 1271 aa  822    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  38.27 
 
 		 1270 aa  823    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  46.44 
 
 		 1244 aa  1052    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  43.3 
 
 		 1244 aa  920    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  36.69 
 
 		 1236 aa  759    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  41.37 
 
 		 1233 aa  900    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  31.72 
 
 		 1218 aa  614  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  31.86 
 
 		 1217 aa  602  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  31.86 
 
 		 1217 aa  602  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  28.86 
 
 		 1204 aa  523  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.9 
 
 		 1230 aa  516  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.03 
 
 		 1186 aa  504  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  32.9 
 
 		 1392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  26.9 
 
 		 1121 aa  445  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  30.3 
 
 		 1217 aa  443  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  28.71 
 
 		 1207 aa  439  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28 
 
 		 1203 aa  436  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  33.02 
 
 		 1240 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  27.79 
 
 		 1226 aa  221  5e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1057 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  26.06 
 
 		 1149 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  32.52 
 
 		 1184 aa  178  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  26.05 
 
 		 1161 aa  167  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  26.36 
 
 		 1180 aa  159  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 1165 aa  158  6e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  27.64 
 
 		 1124 aa  154  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  26.45 
 
 		 1180 aa  154  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1061 aa  152  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  23.84 
 
 		 1074 aa  152  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  26.81 
 
 		 1095 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  28.96 
 
 		 1080 aa  149  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  27.86 
 
 		 1262 aa  149  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  32.38 
 
 		 1196 aa  148  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  27.68 
 
 		 1183 aa  147  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  26.64 
 
 		 1125 aa  146  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  27.07 
 
 		 1189 aa  146  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  27.31 
 
 		 1185 aa  145  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  27 
 
 		 1147 aa  144  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.13 
 
 		 773 aa  141  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.48 
 
 		 763 aa  140  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  26.25 
 
 		 1115 aa  138  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.04 
 
 		 1139 aa  136  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  26.53 
 
 		 1182 aa  136  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  26.41 
 
 		 1120 aa  135  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  26.54 
 
 		 1166 aa  135  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  24.11 
 
 		 1130 aa  134  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.65 
 
 		 1183 aa  132  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  25.77 
 
 		 1103 aa  132  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.87 
 
 		 755 aa  130  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  25.53 
 
 		 1164 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  26.63 
 
 		 1180 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  27.39 
 
 		 1162 aa  128  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 		 1187 aa  128  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.45 
 
 		 753 aa  127  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  25.4 
 
 		 1157 aa  127  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.45 
 
 		 753 aa  127  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.89 
 
 		 639 aa  126  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.64 
 
 		 747 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  25.64 
 
 		 751 aa  126  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  26.55 
 
 		 1156 aa  126  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.64 
 
 		 747 aa  126  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.64 
 
 		 751 aa  125  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  25.64 
 
 		 753 aa  125  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  27 
 
 		 678 aa  125  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.64 
 
 		 751 aa  125  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  28.88 
 
 		 739 aa  125  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.77 
 
 		 747 aa  125  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  28.28 
 
 		 1173 aa  125  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 1202 aa  125  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.64 
 
 		 751 aa  125  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.2 
 
 		 802 aa  125  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  28.52 
 
 		 706 aa  124  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1177 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  22.7 
 
 		 639 aa  122  3e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  28.1 
 
 		 726 aa  122  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.16 
 
 		 830 aa  123  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.64 
 
 		 786 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  28.62 
 
 		 1168 aa  122  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.04 
 
 		 741 aa  122  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.82 
 
 		 732 aa  122  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1121 aa  122  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>