More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2076 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1240 aa  2475    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  32.64 
 
 		 1244 aa  485  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  32.04 
 
 		 1244 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  28.32 
 
 		 1248 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.77 
 
 		 1251 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.41 
 
 		 1241 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.24 
 
 		 1241 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  30.53 
 
 		 1241 aa  458  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.49 
 
 		 1241 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  30.53 
 
 		 1241 aa  458  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.71 
 
 		 1240 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.47 
 
 		 1241 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  29.63 
 
 		 1242 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.46 
 
 		 1241 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  30.44 
 
 		 1241 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.29 
 
 		 1241 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  28.09 
 
 		 1270 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  28.03 
 
 		 1233 aa  439  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  33.33 
 
 		 1242 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  27.71 
 
 		 1271 aa  439  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  28.56 
 
 		 1282 aa  426  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  33.1 
 
 		 1230 aa  413  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  27.35 
 
 		 1236 aa  405  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  27.34 
 
 		 1217 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  27.34 
 
 		 1217 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  26.08 
 
 		 1218 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  31.87 
 
 		 1392 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.42 
 
 		 1230 aa  366  1e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  32.69 
 
 		 1405 aa  345  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.78 
 
 		 1186 aa  340  7e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  25.08 
 
 		 1204 aa  337  9e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  28.81 
 
 		 1377 aa  333  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  25.85 
 
 		 1121 aa  332  3e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  28.39 
 
 		 1392 aa  312  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  26.06 
 
 		 1217 aa  297  8e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  24.48 
 
 		 1207 aa  277  9e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.77 
 
 		 1203 aa  261  9e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  28.26 
 
 		 1226 aa  217  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1057 aa  211  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  28.03 
 
 		 1117 aa  195  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  29.77 
 
 		 1184 aa  182  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  29.31 
 
 		 1074 aa  176  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  27.6 
 
 		 1110 aa  173  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  30.7 
 
 		 1080 aa  172  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  28.49 
 
 		 833 aa  165  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  25.05 
 
 		 1161 aa  164  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.97 
 
 		 1139 aa  162  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 1121 aa  161  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  30.85 
 
 		 1123 aa  159  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  31.84 
 
 		 1196 aa  158  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  29.3 
 
 		 1147 aa  157  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  29.03 
 
 		 1131 aa  153  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  28.26 
 
 		 1149 aa  151  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  29.38 
 
 		 1047 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 1115 aa  148  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  24.41 
 
 		 1173 aa  148  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1061 aa  147  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  27.87 
 
 		 1124 aa  145  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  27.82 
 
 		 1185 aa  143  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  27.8 
 
 		 1161 aa  139  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  30.21 
 
 		 1110 aa  134  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  25.05 
 
 		 1165 aa  132  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  31.23 
 
 		 1159 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.4 
 
 		 1089 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  26.71 
 
 		 1156 aa  130  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  24.33 
 
 		 1130 aa  129  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  28.75 
 
 		 1107 aa  129  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  28.2 
 
 		 1119 aa  129  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  29.95 
 
 		 646 aa  127  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  24.97 
 
 		 1185 aa  126  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1560  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 		 1054 aa  126  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.538348  normal  0.490234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2838  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.78 
 
 		 1230 aa  125  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.506585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0419  UvrD/REP helicase  23.77 
 
 		 1003 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  30.85 
 
 		 659 aa  123  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3878  UvrD/REP helicase  29.67 
 
 		 1111 aa  122  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  28.31 
 
 		 1147 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  29.61 
 
 		 1151 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1614  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.3 
 
 		 1232 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4021  UvrD/REP helicase  29.15 
 
 		 1111 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.76 
 
 		 1197 aa  119  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3984  UvrD/REP helicase  28.07 
 
 		 1111 aa  119  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1748  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.62 
 
 		 1241 aa  118  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  30.47 
 
 		 1161 aa  118  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  28.52 
 
 		 1087 aa  117  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  25.83 
 
 		 1146 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  26.94 
 
 		 1187 aa  116  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  24.19 
 
 		 1065 aa  115  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  27.57 
 
 		 1173 aa  115  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  25.25 
 
 		 1208 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.07 
 
 		 1234 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0918971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.07 
 
 		 1234 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1177 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  29.44 
 
 		 1161 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1981  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.48 
 
 		 1259 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.335433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.96 
 
 		 1156 aa  113  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2512  UvrD/REP helicase  29.44 
 
 		 1192 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  28.04 
 
 		 1164 aa  112  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1439  UvrD/REP helicase  28.55 
 
 		 1195 aa  112  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325426  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4323  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.58 
 
 		 1236 aa  111  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 		 1152 aa  110  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>