More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1439 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  70.49 
 
 
1196 aa  1311    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2512  UvrD/REP helicase  93.05 
 
 
1192 aa  1638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1439  UvrD/REP helicase  100 
 
 
1195 aa  2202    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1341  UvrD/REP helicase  97.16 
 
 
1195 aa  1718    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.638227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  31.15 
 
 
1226 aa  271  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  33.02 
 
 
1184 aa  266  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  31.8 
 
 
1117 aa  225  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  32.5 
 
 
1080 aa  214  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  30.06 
 
 
1115 aa  214  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  31.79 
 
 
1123 aa  206  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.86 
 
 
1139 aa  199  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  31.29 
 
 
1047 aa  196  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  31.76 
 
 
1149 aa  190  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  32.17 
 
 
1177 aa  188  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  33.6 
 
 
1110 aa  188  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  31.18 
 
 
1240 aa  187  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  29.89 
 
 
1110 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  27.03 
 
 
1262 aa  172  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  28.84 
 
 
1061 aa  173  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  22.3 
 
 
1218 aa  172  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  23.33 
 
 
1217 aa  171  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  23.33 
 
 
1217 aa  171  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  29.11 
 
 
1125 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  30.52 
 
 
1173 aa  166  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  29.22 
 
 
1057 aa  163  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  31.26 
 
 
1185 aa  160  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  25.75 
 
 
1282 aa  160  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  24.7 
 
 
1074 aa  158  6e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  31.11 
 
 
1173 aa  157  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3984  UvrD/REP helicase  33.89 
 
 
1111 aa  156  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  31.04 
 
 
1147 aa  157  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1560  UvrD/REP helicase  28.76 
 
 
1054 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.538348  normal  0.490234 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  27.99 
 
 
1161 aa  155  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  21.88 
 
 
1203 aa  155  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  31.57 
 
 
1131 aa  154  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  22.22 
 
 
1121 aa  153  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  29.71 
 
 
1107 aa  152  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  26.47 
 
 
1185 aa  150  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  24.57 
 
 
1165 aa  149  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  24.98 
 
 
1392 aa  148  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  29.64 
 
 
1251 aa  148  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  27.39 
 
 
620 aa  148  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  33.57 
 
 
833 aa  147  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  21.17 
 
 
1065 aa  145  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.07 
 
 
1168 aa  145  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  27.82 
 
 
1244 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.03 
 
 
1197 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.16 
 
 
1207 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  20.37 
 
 
1124 aa  143  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.25 
 
 
1226 aa  142  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.93 
 
 
1230 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  30.59 
 
 
1230 aa  142  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  28.75 
 
 
1156 aa  142  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  22.48 
 
 
1208 aa  138  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  27.27 
 
 
900 aa  139  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  29.19 
 
 
1095 aa  137  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  29.02 
 
 
1244 aa  137  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0419  UvrD/REP helicase  23.99 
 
 
1003 aa  135  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0689  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.04 
 
 
1229 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0221198  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 
738 aa  135  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4568  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.67 
 
 
1263 aa  135  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.94 
 
 
1241 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.93 
 
 
833 aa  135  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.11 
 
 
1023 aa  135  6e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  32.7 
 
 
1106 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.49 
 
 
738 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.19 
 
 
1089 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  22.48 
 
 
1130 aa  134  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 
726 aa  134  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.02 
 
 
756 aa  134  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  26.12 
 
 
1377 aa  134  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.64 
 
 
1241 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.33 
 
 
753 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  29.78 
 
 
1242 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  24.96 
 
 
1236 aa  133  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.13 
 
 
1183 aa  133  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.69 
 
 
747 aa  132  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  24.69 
 
 
753 aa  132  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.69 
 
 
747 aa  132  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.69 
 
 
751 aa  132  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.69 
 
 
751 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.97 
 
 
1241 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  24.69 
 
 
751 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1693  Exodeoxyribonuclease V  28.41 
 
 
1125 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.69 
 
 
751 aa  132  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.03 
 
 
795 aa  132  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.38 
 
 
1241 aa  131  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0428  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.58 
 
 
670 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.82 
 
 
1241 aa  131  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.65 
 
 
1405 aa  131  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 
1159 aa  131  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.49 
 
 
1241 aa  131  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  24.37 
 
 
1248 aa  131  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.55 
 
 
758 aa  131  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  25.16 
 
 
1224 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.17 
 
 
781 aa  131  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.19 
 
 
765 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.33 
 
 
753 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.52 
 
 
802 aa  130  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.16 
 
 
829 aa  130  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>