More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2114 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  56.02 
 
 		 1173 aa  1183    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  55.57 
 
 		 1177 aa  1137    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  37.26 
 
 		 1173 aa  671    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  54.94 
 
 		 1173 aa  1167    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  100 
 
 		 1197 aa  2387    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  36.68 
 
 		 1185 aa  652    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  74.19 
 
 		 1187 aa  1659    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  37.52 
 
 		 1089 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  36.86 
 
 		 1147 aa  432  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 1087 aa  429  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  36.37 
 
 		 1168 aa  430  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  35.87 
 
 		 1086 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  32.64 
 
 		 1095 aa  406  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  35.26 
 
 		 1101 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  35.26 
 
 		 1101 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  33.47 
 
 		 1165 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  32.41 
 
 		 1140 aa  364  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  35.99 
 
 		 1103 aa  281  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  28.23 
 
 		 1164 aa  246  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  25.04 
 
 		 1155 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  28.52 
 
 		 1161 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  28.07 
 
 		 1183 aa  242  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  27.66 
 
 		 1121 aa  240  9e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  28.9 
 
 		 1124 aa  236  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.54 
 
 		 1177 aa  229  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  27.2 
 
 		 1180 aa  227  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  28.22 
 
 		 1183 aa  225  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  27.41 
 
 		 1180 aa  225  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  28.59 
 
 		 1156 aa  224  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  31 
 
 		 1187 aa  221  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  29.1 
 
 		 1159 aa  218  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  29.42 
 
 		 1189 aa  218  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  27.08 
 
 		 1180 aa  217  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  28.54 
 
 		 1162 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  30.1 
 
 		 1106 aa  215  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  23.83 
 
 		 1089 aa  214  7e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  28.02 
 
 		 1182 aa  213  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  28.97 
 
 		 1161 aa  213  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.81 
 
 		 1156 aa  213  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  28.93 
 
 		 1164 aa  213  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  29.92 
 
 		 1106 aa  211  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  28.07 
 
 		 1161 aa  211  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  29.98 
 
 		 1151 aa  209  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  26.73 
 
 		 1125 aa  202  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  29.16 
 
 		 1147 aa  201  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  30.99 
 
 		 1157 aa  193  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  29.06 
 
 		 1202 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  28.4 
 
 		 1080 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.2 
 
 		 1183 aa  189  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  28.6 
 
 		 1184 aa  184  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  28.43 
 
 		 1185 aa  176  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  29.45 
 
 		 1167 aa  170  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  27.85 
 
 		 1117 aa  169  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.35 
 
 		 1230 aa  169  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  26.95 
 
 		 1115 aa  168  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  28.14 
 
 		 1118 aa  161  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1057 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 1110 aa  158  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  27.28 
 
 		 1132 aa  157  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  27.73 
 
 		 1162 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 1146 aa  154  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  27.79 
 
 		 1392 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  22.82 
 
 		 1270 aa  147  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.41 
 
 		 1251 aa  146  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  25.49 
 
 		 1149 aa  146  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1751  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.4 
 
 		 1129 aa  144  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.910924 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.67 
 
 		 1271 aa  143  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 1166 aa  141  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  21.96 
 
 		 1248 aa  138  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  27.95 
 
 		 1157 aa  139  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1061 aa  137  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  22.54 
 
 		 1282 aa  137  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  27.06 
 
 		 1392 aa  135  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  28.35 
 
 		 1047 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  27.97 
 
 		 1131 aa  135  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  23.06 
 
 		 1217 aa  134  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  29.95 
 
 		 1120 aa  134  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3622  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.76 
 
 		 1135 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  23.06 
 
 		 1217 aa  134  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  30.83 
 
 		 1147 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  30.83 
 
 		 1147 aa  131  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  22.14 
 
 		 1121 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  27.52 
 
 		 1240 aa  130  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  29.44 
 
 		 1165 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  22.37 
 
 		 1217 aa  128  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  31.14 
 
 		 1196 aa  128  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  22.67 
 
 		 854 aa  126  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  22.74 
 
 		 1207 aa  125  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.69 
 
 		 860 aa  125  4e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  25.3 
 
 		 1244 aa  125  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  25.4 
 
 		 1241 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  29.05 
 
 		 1182 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  25.46 
 
 		 1241 aa  121  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  25.46 
 
 		 1241 aa  121  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.3 
 
 		 1241 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.3 
 
 		 1241 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.15 
 
 		 1241 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.36 
 
 		 1186 aa  120  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.23 
 
 		 1240 aa  119  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.3 
 
 		 1241 aa  119  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>