More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1681 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  56.69 
 
 		 1207 aa  1332    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  41 
 
 		 1203 aa  826    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  100 
 
 		 1217 aa  2489    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.86 
 
 		 1230 aa  487  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  30.84 
 
 		 1241 aa  486  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  29.5 
 
 		 1242 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  30.93 
 
 		 1241 aa  479  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.79 
 
 		 1241 aa  479  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  30.93 
 
 		 1241 aa  479  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.85 
 
 		 1241 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.6 
 
 		 1241 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.83 
 
 		 1241 aa  476  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  31.08 
 
 		 1241 aa  476  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.78 
 
 		 1240 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.69 
 
 		 1241 aa  473  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.02 
 
 		 1186 aa  460  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  30.09 
 
 		 1244 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  29.75 
 
 		 1242 aa  445  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  30.3 
 
 		 1230 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  30.01 
 
 		 1217 aa  429  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  30.01 
 
 		 1217 aa  429  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  28.61 
 
 		 1204 aa  422  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.95 
 
 		 1251 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  29.27 
 
 		 1270 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  29.42 
 
 		 1244 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  29.55 
 
 		 1218 aa  403  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  27.96 
 
 		 1248 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  29.61 
 
 		 1236 aa  392  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  29.27 
 
 		 1392 aa  358  3.9999999999999996e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  29.49 
 
 		 1282 aa  358  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  29.56 
 
 		 1392 aa  330  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  27.02 
 
 		 1121 aa  317  6e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  28.03 
 
 		 1377 aa  306  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  25.83 
 
 		 1240 aa  278  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  29.81 
 
 		 1233 aa  220  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  27.98 
 
 		 1271 aa  194  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.93 
 
 		 1405 aa  161  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  24.33 
 
 		 1147 aa  160  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  23.65 
 
 		 1165 aa  152  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1057 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  27.97 
 
 		 1184 aa  147  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1177 aa  141  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  25.88 
 
 		 1080 aa  141  8.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  22.44 
 
 		 1074 aa  136  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  24.13 
 
 		 1173 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  27.48 
 
 		 833 aa  132  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1061 aa  132  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  23.52 
 
 		 1123 aa  132  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  23.26 
 
 		 1061 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  22.46 
 
 		 1089 aa  129  4.0000000000000003e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.23 
 
 		 1183 aa  128  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  22.21 
 
 		 1180 aa  127  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  23.97 
 
 		 1173 aa  125  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  24.94 
 
 		 1115 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  22.78 
 
 		 1124 aa  123  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  23.04 
 
 		 1164 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  23.55 
 
 		 1120 aa  118  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  22.8 
 
 		 1183 aa  118  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  25.23 
 
 		 1149 aa  118  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  25.18 
 
 		 762 aa  117  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.09 
 
 		 755 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  25.81 
 
 		 1108 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.37 
 
 		 1197 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  26.38 
 
 		 689 aa  115  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  22.72 
 
 		 1183 aa  115  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  22.8 
 
 		 1202 aa  114  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  23.7 
 
 		 1251 aa  114  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  23.11 
 
 		 1124 aa  114  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.41 
 
 		 640 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.96 
 
 		 729 aa  112  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.95 
 
 		 662 aa  112  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.47 
 
 		 1119 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  22.35 
 
 		 1155 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  22.96 
 
 		 1196 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  26.18 
 
 		 689 aa  112  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3622  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.31 
 
 		 1135 aa  112  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1693  Exodeoxyribonuclease V  25 
 
 		 1125 aa  112  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 646 aa  111  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 		 1065 aa  110  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 		 1173 aa  110  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  23.42 
 
 		 1118 aa  110  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 		 1161 aa  110  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 773 aa  109  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  23.44 
 
 		 1101 aa  109  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  23.93 
 
 		 1125 aa  108  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  25.27 
 
 		 738 aa  108  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  25.59 
 
 		 840 aa  108  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  24.86 
 
 		 738 aa  108  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  25.81 
 
 		 1196 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  22.95 
 
 		 1132 aa  107  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.72 
 
 		 738 aa  107  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  24.34 
 
 		 1106 aa  107  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  25.42 
 
 		 787 aa  107  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.77 
 
 		 718 aa  106  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  25.19 
 
 		 707 aa  106  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.82 
 
 		 658 aa  106  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  24.32 
 
 		 744 aa  105  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  26.34 
 
 		 787 aa  105  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  22.97 
 
 		 1101 aa  105  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  24.57 
 
 		 1130 aa  104  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>