More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0910 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  55.64 
 
 		 939 aa  1030    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  40.32 
 
 		 921 aa  669    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  100 
 
 		 933 aa  1897    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1391  putative recombination protein RecB  38.5 
 
 		 923 aa  589  1e-167  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  35.75 
 
 		 915 aa  527  1e-148  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  36.74 
 
 		 921 aa  528  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  36.74 
 
 		 921 aa  529  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  36.46 
 
 		 921 aa  523  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  35.43 
 
 		 907 aa  497  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  34.57 
 
 		 903 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  24.74 
 
 		 1054 aa  141  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  29.08 
 
 		 1147 aa  137  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  24.12 
 
 		 1036 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1797  Exodeoxyribonuclease V  25.62 
 
 		 1120 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00119316  normal  0.701381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1136  UvrD/REP helicase  24.19 
 
 		 1112 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0229402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  29.57 
 
 		 1124 aa  132  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  24.77 
 
 		 1060 aa  130  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.87 
 
 		 860 aa  129  3e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.26 
 
 		 1089 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  27.07 
 
 		 1173 aa  126  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  24.26 
 
 		 1052 aa  125  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1076 aa  125  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  26.87 
 
 		 1173 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 854 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.3 
 
 		 1183 aa  123  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.61 
 
 		 1086 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.82 
 
 		 1177 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  27.75 
 
 		 1168 aa  119  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0979  UvrD/REP helicase  25.77 
 
 		 1173 aa  118  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.156033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  26.68 
 
 		 1087 aa  117  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  27.92 
 
 		 1155 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  26.15 
 
 		 1182 aa  115  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  30.25 
 
 		 1106 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  27.67 
 
 		 1119 aa  115  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  29.91 
 
 		 1106 aa  115  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4180  Exodeoxyribonuclease V  22.91 
 
 		 1073 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0648836 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  28.36 
 
 		 1121 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  23.78 
 
 		 1180 aa  112  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 		 1103 aa  112  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  23.81 
 
 		 1180 aa  111  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.57 
 
 		 1139 aa  109  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  26.02 
 
 		 1149 aa  108  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  26.73 
 
 		 1183 aa  107  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 		 1140 aa  106  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1561  UvrD/REP helicase  24.61 
 
 		 1054 aa  105  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  27.48 
 
 		 1125 aa  104  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1076 aa  99.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  25.88 
 
 		 1095 aa  98.6  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  24.35 
 
 		 1161 aa  98.2  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  26.84 
 
 		 1147 aa  97.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  24.65 
 
 		 1185 aa  95.5  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  25 
 
 		 1089 aa  93.2  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  26.41 
 
 		 1147 aa  92  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  26.41 
 
 		 1147 aa  91.7  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3578  UvrD/REP helicase  22.75 
 
 		 995 aa  90.5  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.51 
 
 		 1016 aa  89.7  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  25.62 
 
 		 1240 aa  88.6  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2005  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.91 
 
 		 1155 aa  89  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  36.42 
 
 		 1196 aa  86.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0929  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.97 
 
 		 1216 aa  87  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  25.66 
 
 		 1208 aa  85.1  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0495  UvrD/REP helicase  24.95 
 
 		 981 aa  84.7  0.000000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1057 aa  84.7  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 1152 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.11 
 
 		 1067 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0764  UvrD/REP helicase  26.33 
 
 		 1161 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.94 
 
 		 1203 aa  82.4  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  38.14 
 
 		 1120 aa  81.3  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  25.24 
 
 		 1157 aa  80.9  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1177 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  37.9 
 
 		 1182 aa  80.5  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  25.95 
 
 		 1121 aa  80.9  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  31.69 
 
 		 1157 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  35.19 
 
 		 1132 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  25.64 
 
 		 1251 aa  80.5  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  34.09 
 
 		 1110 aa  79.7  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  30.36 
 
 		 1161 aa  80.1  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  40 
 
 		 1187 aa  80.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0914  hypothetical protein  33.68 
 
 		 913 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.230756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  23.6 
 
 		 1244 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  30.77 
 
 		 1157 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  23.58 
 
 		 1180 aa  79  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  31.69 
 
 		 688 aa  79  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  32.86 
 
 		 1151 aa  79  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.33 
 
 		 672 aa  78.6  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2072  UvrD/REP helicase domain-containing protein  27.14 
 
 		 1102 aa  78.2  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2746  Exodeoxyribonuclease V  23.57 
 
 		 1134 aa  78.2  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  25.41 
 
 		 648 aa  77.8  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  25.41 
 
 		 648 aa  77.8  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  36.23 
 
 		 1123 aa  77.4  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  27.01 
 
 		 1047 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.17 
 
 		 1226 aa  77  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.04 
 
 		 669 aa  77  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  39.23 
 
 		 1197 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  25 
 
 		 1392 aa  76.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0644  UvrD/REP helicase  35.81 
 
 		 1109 aa  77  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  35.34 
 
 		 1156 aa  77  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  26.86 
 
 		 1117 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  31.91 
 
 		 1183 aa  76.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  33.33 
 
 		 1110 aa  76.3  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>