More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1828 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  97.18 
 
 		 921 aa  1764    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  100 
 
 		 921 aa  1842    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  97.29 
 
 		 921 aa  1772    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  46.38 
 
 		 915 aa  740    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  38.58 
 
 		 921 aa  560  1e-158  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  36.88 
 
 		 933 aa  534  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1391  putative recombination protein RecB  37.17 
 
 		 923 aa  495  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  35.52 
 
 		 939 aa  490  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  33.95 
 
 		 907 aa  413  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  33.47 
 
 		 903 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  25.95 
 
 		 1052 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1797  Exodeoxyribonuclease V  24.56 
 
 		 1120 aa  137  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00119316  normal  0.701381 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  24.27 
 
 		 1054 aa  137  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  24.95 
 
 		 1147 aa  134  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  26.19 
 
 		 1125 aa  124  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  26.67 
 
 		 1183 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  27.37 
 
 		 1119 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  27.67 
 
 		 1185 aa  115  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 1173 aa  114  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  25.05 
 
 		 1183 aa  114  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 		 1140 aa  110  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  25.5 
 
 		 1168 aa  109  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  27.27 
 
 		 1089 aa  108  6e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2072  UvrD/REP helicase domain-containing protein  25.31 
 
 		 1102 aa  106  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  25.23 
 
 		 1101 aa  105  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  25.23 
 
 		 1101 aa  105  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.03 
 
 		 1086 aa  104  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1136  UvrD/REP helicase  25.04 
 
 		 1112 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0229402 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.43 
 
 		 860 aa  103  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  24.18 
 
 		 1182 aa  102  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  25.2 
 
 		 1162 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  25.51 
 
 		 1156 aa  102  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  26.87 
 
 		 1060 aa  101  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  39.74 
 
 		 1110 aa  99.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  25.28 
 
 		 1036 aa  98.6  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  34.53 
 
 		 1076 aa  98.2  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  24.35 
 
 		 1159 aa  98.2  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  33.63 
 
 		 1076 aa  97.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  23.91 
 
 		 1161 aa  96.3  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  39.07 
 
 		 1110 aa  95.9  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  32.69 
 
 		 1121 aa  92.4  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  36.23 
 
 		 1106 aa  92  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  36.23 
 
 		 1106 aa  92  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0006  UvrD/REP helicase  23.82 
 
 		 945 aa  89  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.416534  hitchhiker  0.0000067994 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  27 
 
 		 1161 aa  87  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  34.31 
 
 		 1120 aa  86.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1057 aa  85.9  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.5 
 
 		 1183 aa  85.9  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  30.73 
 
 		 1124 aa  85.9  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  29.87 
 
 		 1147 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  29.87 
 
 		 1147 aa  85.9  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  26.28 
 
 		 1033 aa  85.1  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  34.19 
 
 		 1182 aa  84.7  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  27.03 
 
 		 1343 aa  84.7  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  33.73 
 
 		 1196 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4011  UvrD/REP helicase  22.95 
 
 		 1083 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  27.56 
 
 		 1157 aa  82.4  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0644  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 1109 aa  82.4  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  29.24 
 
 		 1147 aa  82  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  32.14 
 
 		 1161 aa  82  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0914  hypothetical protein  34.57 
 
 		 913 aa  82  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.230756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.57 
 
 		 1197 aa  81.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  33.91 
 
 		 1187 aa  81.6  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  32.59 
 
 		 1157 aa  81.3  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  30.52 
 
 		 1185 aa  80.9  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  31.52 
 
 		 1157 aa  80.9  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1751  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  43.81 
 
 		 1129 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.910924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  32.43 
 
 		 1161 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0979  UvrD/REP helicase  28.76 
 
 		 1173 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.156033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  32.02 
 
 		 1151 aa  80.1  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1560  UvrD/REP helicase  22.5 
 
 		 1054 aa  79.7  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.538348  normal  0.490234 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 1152 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  35.25 
 
 		 854 aa  79.3  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0764  UvrD/REP helicase  22.55 
 
 		 1161 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  31.65 
 
 		 1164 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0011  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.4 
 
 		 1241 aa  79.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0495  UvrD/REP helicase  24.21 
 
 		 981 aa  79  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  35.71 
 
 		 1146 aa  79  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  22.81 
 
 		 1110 aa  79  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3622  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.05 
 
 		 1135 aa  79  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  39.06 
 
 		 1155 aa  79  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  31.48 
 
 		 1173 aa  78.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  22.78 
 
 		 1047 aa  78.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1177 aa  78.2  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  35.1 
 
 		 1180 aa  78.2  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.16 
 
 		 1067 aa  78.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  41.28 
 
 		 1132 aa  78.2  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  33.08 
 
 		 1165 aa  78.2  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  34.07 
 
 		 1157 aa  78.2  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  31.48 
 
 		 1173 aa  77.8  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  41.12 
 
 		 1118 aa  77.8  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  26.12 
 
 		 1095 aa  77.8  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  26.46 
 
 		 1065 aa  77  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  29.33 
 
 		 1202 aa  76.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1561  UvrD/REP helicase  30.95 
 
 		 1054 aa  76.6  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3742  UvrD/REP helicase  24.77 
 
 		 1142 aa  76.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.404574  normal  0.909717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  37.5 
 
 		 1189 aa  75.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  24.89 
 
 		 1187 aa  75.1  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  31.76 
 
 		 1087 aa  75.1  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  27.7 
 
 		 666 aa  74.7  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>