More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0495 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0495  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 981 aa  1911    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  30.69 
 
 		 1036 aa  292  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3578  UvrD/REP helicase  29.64 
 
 		 995 aa  289  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  24.28 
 
 		 907 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  25.25 
 
 		 921 aa  125  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  26.76 
 
 		 939 aa  121  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  26.78 
 
 		 903 aa  118  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  19.33 
 
 		 1147 aa  95.1  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  25.21 
 
 		 933 aa  92.8  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  19.77 
 
 		 1119 aa  90.5  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  21.05 
 
 		 1173 aa  89  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  23.17 
 
 		 648 aa  87.4  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  23.17 
 
 		 648 aa  87.4  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  25.26 
 
 		 921 aa  87  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  24.59 
 
 		 921 aa  86.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  22.4 
 
 		 1120 aa  86.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  21.46 
 
 		 1173 aa  85.9  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.15 
 
 		 662 aa  85.9  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.48 
 
 		 1168 aa  85.5  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  22.71 
 
 		 787 aa  84.7  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  24.96 
 
 		 921 aa  84.7  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  22.38 
 
 		 1183 aa  84.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  21.53 
 
 		 1106 aa  84  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  21.69 
 
 		 1106 aa  84  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  22.4 
 
 		 795 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  20.41 
 
 		 1177 aa  83.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  22.07 
 
 		 797 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.27 
 
 		 742 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  22.44 
 
 		 1073 aa  82.8  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  23.24 
 
 		 739 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  25.86 
 
 		 1054 aa  82.4  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  22.39 
 
 		 1110 aa  82.4  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  23.96 
 
 		 630 aa  81.3  0.00000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 665 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  22.07 
 
 		 798 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1403  UvrD/REP helicase  20.98 
 
 		 900 aa  80.1  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405797  normal  0.0281555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  23.95 
 
 		 663 aa  79.3  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  21.01 
 
 		 1156 aa  79.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  22.13 
 
 		 795 aa  79.7  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.79 
 
 		 1139 aa  79  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2137  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.66 
 
 		 864 aa  79.3  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  19.6 
 
 		 1125 aa  79  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  22.44 
 
 		 717 aa  78.6  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  24.7 
 
 		 678 aa  78.2  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.35 
 
 		 768 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  20.81 
 
 		 1095 aa  77.8  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  22.2 
 
 		 1110 aa  77.4  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.1 
 
 		 1067 aa  77.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  24.53 
 
 		 677 aa  77.4  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  23 
 
 		 689 aa  77.4  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  23.6 
 
 		 655 aa  77.8  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.41 
 
 		 663 aa  76.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  22.6 
 
 		 744 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  21.77 
 
 		 736 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  24.97 
 
 		 1124 aa  76.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  20.89 
 
 		 1124 aa  76.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3574  UvrD/REP helicase  21.8 
 
 		 646 aa  75.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  22.04 
 
 		 1061 aa  75.5  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  22.65 
 
 		 1121 aa  75.9  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  22.01 
 
 		 816 aa  75.5  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  29.15 
 
 		 726 aa  75.1  0.000000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.58 
 
 		 671 aa  75.1  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.65 
 
 		 758 aa  74.7  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  19.37 
 
 		 1140 aa  74.7  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1076 aa  74.7  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  24.73 
 
 		 706 aa  73.9  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  26.24 
 
 		 722 aa  74.3  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0199  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.82 
 
 		 674 aa  74.3  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  21.32 
 
 		 1157 aa  74.3  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  25.43 
 
 		 749 aa  74.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  19.9 
 
 		 668 aa  73.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  18.08 
 
 		 1086 aa  73.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.41 
 
 		 690 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1279  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  23.54 
 
 		 688 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456815  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1076 aa  72.8  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1391  putative recombination protein RecB  26.52 
 
 		 923 aa  72.8  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  22.87 
 
 		 668 aa  73.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  23.61 
 
 		 1060 aa  72.8  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.11 
 
 		 672 aa  72.8  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 688 aa  72.8  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.2 
 
 		 670 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0305  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.34 
 
 		 670 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3142  UvrD/REP helicase  22.36 
 
 		 687 aa  72.4  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.53 
 
 		 674 aa  72.4  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.9 
 
 		 1203 aa  72.4  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  23.51 
 
 		 1226 aa  72  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0764  UvrD/REP helicase  21.88 
 
 		 1161 aa  72  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2005  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  21.05 
 
 		 1155 aa  72  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.92 
 
 		 682 aa  72  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1084  UvrD/REP helicase  21.92 
 
 		 789 aa  72  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0374  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.13 
 
 		 671 aa  72  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.07 
 
 		 674 aa  71.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.33 
 
 		 674 aa  71.6  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4281  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 716 aa  71.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344477  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2555  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.44 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  23.94 
 
 		 705 aa  71.2  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  21.58 
 
 		 697 aa  71.2  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  27.48 
 
 		 723 aa  71.2  0.00000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0376  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.13 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.158989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2701  UvrD/REP helicase  22.5 
 
 		 686 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311884  normal  0.28531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>