More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1797 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1136  UvrD/REP helicase  39.45 
 
 		 1112 aa  742    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0229402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1797  Exodeoxyribonuclease V  100 
 
 		 1120 aa  2319    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00119316  normal  0.701381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  28.11 
 
 		 1052 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  26.99 
 
 		 1054 aa  355  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0914  hypothetical protein  30.73 
 
 		 913 aa  352  2e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.230756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  27.36 
 
 		 1060 aa  349  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2072  UvrD/REP helicase domain-containing protein  27.96 
 
 		 1102 aa  319  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4180  Exodeoxyribonuclease V  26.47 
 
 		 1073 aa  279  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0648836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.44 
 
 		 1067 aa  140  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  25.62 
 
 		 933 aa  135  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  26.93 
 
 		 1152 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0979  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 1173 aa  125  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.156033  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  24.76 
 
 		 1124 aa  122  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0764  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 1161 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  24.31 
 
 		 1125 aa  116  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2111  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.28 
 
 		 1251 aa  110  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  26.55 
 
 		 921 aa  108  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  26.55 
 
 		 921 aa  105  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  26.55 
 
 		 921 aa  105  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  23.49 
 
 		 1182 aa  105  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  23.56 
 
 		 1147 aa  104  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  26.73 
 
 		 939 aa  104  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  26.61 
 
 		 903 aa  102  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.12 
 
 		 1251 aa  95.5  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  23.71 
 
 		 1189 aa  95.5  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  22.46 
 
 		 1087 aa  95.5  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.97 
 
 		 1177 aa  94.7  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.95 
 
 		 1226 aa  94.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  24.78 
 
 		 1183 aa  92.8  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  24.51 
 
 		 1183 aa  92.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  25.88 
 
 		 915 aa  92.4  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  22.85 
 
 		 1119 aa  92.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  24.13 
 
 		 1212 aa  92  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1177 aa  91.7  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1160  UvrD/REP helicase  25.83 
 
 		 1064 aa  91.7  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.737588 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  23.73 
 
 		 1224 aa  91.3  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1651  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.13 
 
 		 1226 aa  90.9  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.81 
 
 		 1226 aa  90.1  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2420  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.41 
 
 		 1238 aa  89.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415139  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  24.63 
 
 		 921 aa  89.4  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.75 
 
 		 1230 aa  89  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  24.67 
 
 		 907 aa  88.2  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  22.94 
 
 		 1208 aa  87.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  23.78 
 
 		 1106 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0761  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.85 
 
 		 1223 aa  86.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.238035  normal  0.093599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  25.22 
 
 		 1147 aa  86.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.47 
 
 		 1269 aa  85.9  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0993  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.19 
 
 		 1125 aa  84  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00861563  normal  0.126412 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.61 
 
 		 1276 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2642  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.95 
 
 		 1229 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  25.37 
 
 		 1156 aa  83.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2932  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.35 
 
 		 1198 aa  82.8  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2547  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.35 
 
 		 1198 aa  82.8  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.789149 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0929  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.57 
 
 		 1216 aa  81.6  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.35 
 
 		 1209 aa  81.3  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  23.44 
 
 		 1251 aa  81.3  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  24.07 
 
 		 1173 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  21.81 
 
 		 1282 aa  80.9  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1936  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.45 
 
 		 1251 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25 
 
 		 1168 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2246  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.41 
 
 		 1263 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919114 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3578  UvrD/REP helicase  23.66 
 
 		 995 aa  80.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1057 aa  80.5  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.51 
 
 		 1106 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2171  Exodeoxyribonuclease V  21.91 
 
 		 1152 aa  80.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.05 
 
 		 1199 aa  79.7  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 681 aa  79  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  22.48 
 
 		 1161 aa  79  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  24.08 
 
 		 705 aa  78.6  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.59 
 
 		 1200 aa  78.6  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  22.6 
 
 		 1217 aa  78.2  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  22.6 
 
 		 1217 aa  78.2  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  25.04 
 
 		 1208 aa  77.4  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  23.07 
 
 		 1183 aa  77.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.95 
 
 		 1204 aa  77.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5901  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 		 689 aa  77  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361362  normal  0.5857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  25.73 
 
 		 1036 aa  77  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  23.87 
 
 		 1173 aa  77  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2148  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.27 
 
 		 1259 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4565  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1273 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2279  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.7 
 
 		 1273 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.87 
 
 		 732 aa  75.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1852  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.86 
 
 		 1269 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0579  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.13 
 
 		 1085 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  23.47 
 
 		 1147 aa  75.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0644  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 1109 aa  75.5  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.25 
 
 		 1223 aa  75.1  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  24.36 
 
 		 1161 aa  74.7  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 		 741 aa  75.1  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  23.23 
 
 		 1121 aa  74.7  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2047  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.17 
 
 		 1273 aa  74.7  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.680974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3206  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 		 1290 aa  74.7  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  25.42 
 
 		 720 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0914  exonuclease V subunit beta  23.12 
 
 		 1194 aa  73.9  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 		 739 aa  74.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  23.47 
 
 		 1147 aa  74.3  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1391  putative recombination protein RecB  21.74 
 
 		 923 aa  74.3  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  22.89 
 
 		 707 aa  74.3  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1774  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.44 
 
 		 1274 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  24.33 
 
 		 1121 aa  74.3  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>