More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0914 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0914  hypothetical protein  100 
 
 		 913 aa  1883    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.230756 
 
 
-
 
NC_002950  PG2072  UvrD/REP helicase domain-containing protein  34.82 
 
 		 1102 aa  458  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4180  Exodeoxyribonuclease V  29.87 
 
 		 1073 aa  363  9e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0648836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1797  Exodeoxyribonuclease V  30.73 
 
 		 1120 aa  352  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00119316  normal  0.701381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  29.93 
 
 		 1052 aa  339  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  30.31 
 
 		 1054 aa  307  5.0000000000000004e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1136  UvrD/REP helicase  28 
 
 		 1112 aa  296  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0229402 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  28.17 
 
 		 1060 aa  288  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.69 
 
 		 1067 aa  188  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0979  UvrD/REP helicase  24.31 
 
 		 1173 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.156033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 1152 aa  154  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0764  UvrD/REP helicase  24.4 
 
 		 1161 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  26.04 
 
 		 1173 aa  115  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  25.95 
 
 		 1173 aa  109  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1177 aa  107  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.52 
 
 		 1168 aa  105  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  23.19 
 
 		 1121 aa  103  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  25.84 
 
 		 1185 aa  102  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1391  putative recombination protein RecB  25.05 
 
 		 923 aa  101  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  26.33 
 
 		 1173 aa  90.1  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  27.11 
 
 		 1217 aa  89.7  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  25.43 
 
 		 1207 aa  87.4  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.35 
 
 		 1200 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.15 
 
 		 1086 aa  86.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  23.14 
 
 		 1212 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.22 
 
 		 1203 aa  84  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  25.45 
 
 		 1162 aa  83.2  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  34.57 
 
 		 921 aa  82.8  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  34.57 
 
 		 921 aa  82.4  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.25 
 
 		 1199 aa  82.4  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  22.26 
 
 		 1224 aa  82.8  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  34.57 
 
 		 921 aa  81.6  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  36.67 
 
 		 915 aa  81.6  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  32.53 
 
 		 903 aa  81.3  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  33.68 
 
 		 933 aa  80.1  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14771  UvrD/REP helicase subunit B  23.27 
 
 		 1261 aa  79.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.248766 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1036 aa  79.3  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.29 
 
 		 1155 aa  79  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  22.63 
 
 		 1270 aa  79  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  36.88 
 
 		 907 aa  78.6  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  24.19 
 
 		 1089 aa  76.6  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.53 
 
 		 1197 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2171  Exodeoxyribonuclease V  22.57 
 
 		 1152 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.75 
 
 		 1271 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  22.22 
 
 		 1106 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  21.93 
 
 		 724 aa  76.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  23.61 
 
 		 921 aa  75.9  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0645  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.93 
 
 		 1261 aa  75.5  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10831  UvrD/REP helicase subunit B  22.79 
 
 		 1265 aa  75.1  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.261186  normal  0.314032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.47 
 
 		 1200 aa  75.1  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  21.7 
 
 		 1106 aa  75.1  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2005  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.15 
 
 		 1155 aa  74.3  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  24.02 
 
 		 1157 aa  74.3  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  22.56 
 
 		 1226 aa  73.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.66 
 
 		 1269 aa  74.3  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.21 
 
 		 1230 aa  73.6  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  21.91 
 
 		 1248 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  23.3 
 
 		 1080 aa  73.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  23.31 
 
 		 1187 aa  73.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  25.6 
 
 		 1236 aa  73.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  23.73 
 
 		 1204 aa  73.6  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  21.65 
 
 		 705 aa  72.4  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  22.61 
 
 		 1151 aa  72.8  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09621  UvrD/REP helicase subunit B  20.97 
 
 		 1274 aa  72.4  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  22.07 
 
 		 1119 aa  72.4  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  21.32 
 
 		 734 aa  72  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  34.04 
 
 		 939 aa  71.6  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.1 
 
 		 1209 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2547  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.06 
 
 		 1198 aa  70.1  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.789149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  24.41 
 
 		 1208 aa  70.1  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.84 
 
 		 1203 aa  70.1  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2932  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.06 
 
 		 1198 aa  70.1  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25 
 
 		 1183 aa  70.1  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  27.07 
 
 		 727 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  27.07 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  21.36 
 
 		 724 aa  68.6  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1708  UvrD/REP helicase  22.81 
 
 		 695 aa  67.8  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.62 
 
 		 1130 aa  67.4  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  36.72 
 
 		 1124 aa  67.4  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  21.59 
 
 		 723 aa  67.4  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01028  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.99 
 
 		 1336 aa  66.6  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1936  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.02 
 
 		 1251 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  22.9 
 
 		 1182 aa  66.6  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  23.6 
 
 		 723 aa  66.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0930  UvrD/REP helicase  22.64 
 
 		 932 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0490168  normal  0.240502 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  23.6 
 
 		 723 aa  66.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.61 
 
 		 932 aa  66.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.16 
 
 		 710 aa  65.5  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  25 
 
 		 721 aa  65.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4011  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 		 1083 aa  65.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  22.37 
 
 		 840 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 744 aa  65.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1119  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.5 
 
 		 691 aa  65.1  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.8 
 
 		 1207 aa  65.1  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3206  UvrD/REP helicase  21.47 
 
 		 1290 aa  65.1  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  27 
 
 		 726 aa  65.1  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  38.64 
 
 		 722 aa  65.1  0.000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0579  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.91 
 
 		 1085 aa  65.1  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  26.64 
 
 		 729 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  21.61 
 
 		 1180 aa  64.7  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>