More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_14771 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0645  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  96.51 
 
 
1261 aa  2470    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1410  exodeoxyribonuclease V, beta subunit RecB  37.31 
 
 
1208 aa  873    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.828955  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1651  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  37.72 
 
 
1226 aa  879    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14771  UvrD/REP helicase subunit B  100 
 
 
1261 aa  2555    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.248766 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09621  UvrD/REP helicase subunit B  41.21 
 
 
1274 aa  1042    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10831  UvrD/REP helicase subunit B  42.62 
 
 
1265 aa  1001    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.261186  normal  0.314032 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11941  UvrD/REP helicase subunit B  30.91 
 
 
1212 aa  496  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.86 
 
 
1207 aa  365  3e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.06 
 
 
1168 aa  324  6e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12101  UvrD/REP helicase subunit B  29.74 
 
 
1208 aa  321  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.08 
 
 
1200 aa  320  7e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.21 
 
 
1208 aa  315  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0953517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.62 
 
 
1203 aa  314  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.61 
 
 
1204 aa  304  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.59 
 
 
1203 aa  292  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  25.36 
 
 
1224 aa  285  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  25.81 
 
 
1208 aa  282  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.61 
 
 
1199 aa  281  4e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2642  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.42 
 
 
1229 aa  281  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3263  exonuclease V subunit beta  25.82 
 
 
1181 aa  280  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  25.8 
 
 
1183 aa  276  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0900  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.8 
 
 
1115 aa  275  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0917  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.8 
 
 
1115 aa  275  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45261  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.26 
 
 
1230 aa  275  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0906  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.8 
 
 
1115 aa  274  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.025647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4851  exodeoxyribonuclease V beta chain  25.22 
 
 
1244 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1936  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.04 
 
 
1251 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2420  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.08 
 
 
1238 aa  271  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415139  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.42 
 
 
1269 aa  268  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.84 
 
 
1226 aa  268  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0991  exonuclease V subunit beta  24.67 
 
 
1220 aa  266  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1043  exonuclease V subunit beta  24.67 
 
 
1220 aa  266  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3231  exonuclease V subunit beta  24.67 
 
 
1220 aa  266  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0761  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.94 
 
 
1223 aa  265  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.238035  normal  0.093599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3389  exonuclease V subunit beta  25.57 
 
 
1203 aa  264  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0689  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.76 
 
 
1229 aa  264  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0221198  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.15 
 
 
1240 aa  263  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.29 
 
 
1240 aa  262  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0914  exonuclease V subunit beta  25.82 
 
 
1194 aa  262  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2111  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.57 
 
 
1251 aa  259  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.17 
 
 
1223 aa  257  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0681  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.78 
 
 
1230 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.639627  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1901  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.95 
 
 
1224 aa  257  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3007  exonuclease V subunit beta  25.2 
 
 
1189 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.31 
 
 
1226 aa  255  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1401  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.21 
 
 
1221 aa  255  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4568  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.75 
 
 
1263 aa  255  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0929  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.97 
 
 
1216 aa  254  6e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01028  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.02 
 
 
1336 aa  254  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1209  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23 
 
 
1097 aa  252  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2746  Exodeoxyribonuclease V  24.84 
 
 
1134 aa  250  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1359  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.18 
 
 
1226 aa  249  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2279  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.26 
 
 
1273 aa  248  6e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4565  hypothetical protein  24.26 
 
 
1273 aa  248  6e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.38 
 
 
1109 aa  247  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915993  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2291  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.16 
 
 
1273 aa  247  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2047  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.15 
 
 
1273 aa  247  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.680974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0011  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.43 
 
 
1241 aa  245  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10641  exonuclease V beta subunit recB  24.2 
 
 
1094 aa  245  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000417929  normal  0.0791919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.26 
 
 
1129 aa  244  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0993  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.42 
 
 
1125 aa  243  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00861563  normal  0.126412 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2094  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.89 
 
 
1273 aa  242  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.780628  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2295  Exodeoxyribonuclease V  24.89 
 
 
1110 aa  238  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1814  exodeoxyribonuclease V beta chain  23.07 
 
 
1242 aa  238  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3373  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.2 
 
 
1132 aa  235  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3907  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.43 
 
 
1139 aa  235  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0574999  normal  0.0165259 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0252  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.39 
 
 
1111 aa  235  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0804  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.17 
 
 
1242 aa  235  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.888497  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2025  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.01 
 
 
1224 aa  233  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1774  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.62 
 
 
1274 aa  233  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.66 
 
 
1130 aa  231  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2429  Exodeoxyribonuclease V  22.11 
 
 
1148 aa  228  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.765298  hitchhiker  0.0020094 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12091  UvrD/REP helicase subunit B  45.08 
 
 
1208 aa  228  7e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2547  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.52 
 
 
1198 aa  225  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.789149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2932  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.52 
 
 
1198 aa  225  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.04 
 
 
1276 aa  225  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0997  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.2 
 
 
1203 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2768  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.84 
 
 
1286 aa  218  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.57 
 
 
1234 aa  212  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.72 
 
 
1234 aa  211  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0918971  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2352  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.5 
 
 
1355 aa  209  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1748  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.68 
 
 
1241 aa  209  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  25.22 
 
 
1208 aa  207  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4323  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.48 
 
 
1236 aa  206  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182798  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1746  UvrD/REP helicase  23.85 
 
 
1243 aa  203  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1188  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.24 
 
 
1235 aa  201  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.513756  normal  0.625115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.12 
 
 
1209 aa  201  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0735  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.25 
 
 
2007 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1215  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.4 
 
 
1235 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.513189  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3206  exonuclease V subunit beta  25.74 
 
 
1181 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.146819  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3320  exonuclease V subunit beta  26.03 
 
 
1181 aa  198  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.602721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3140  exonuclease V subunit beta  26.03 
 
 
1181 aa  198  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3220  exonuclease V subunit beta  26.03 
 
 
1181 aa  197  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3157  exonuclease V subunit beta  26.03 
 
 
1181 aa  197  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4085  exonuclease V subunit beta  25.28 
 
 
1180 aa  196  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  25.45 
 
 
1212 aa  196  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3140  exonuclease V subunit beta  25.03 
 
 
1180 aa  196  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3042  exonuclease V subunit beta  24.92 
 
 
1180 aa  195  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0546  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.59 
 
 
1183 aa  195  5e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0895  exonuclease V subunit beta  24.92 
 
 
1180 aa  194  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.861993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>