More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1410 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0645  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  37.36 
 
 
1261 aa  899    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14771  UvrD/REP helicase subunit B  37.24 
 
 
1261 aa  901    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.248766 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1410  exodeoxyribonuclease V, beta subunit RecB  100 
 
 
1208 aa  2427    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.828955  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1651  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  67.24 
 
 
1226 aa  1525    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09621  UvrD/REP helicase subunit B  50.9 
 
 
1274 aa  1156    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10831  UvrD/REP helicase subunit B  40.7 
 
 
1265 aa  978    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.261186  normal  0.314032 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12091  UvrD/REP helicase subunit B  25.2 
 
 
1208 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12101  UvrD/REP helicase subunit B  25.58 
 
 
1208 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.4 
 
 
1208 aa  475  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0953517  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11941  UvrD/REP helicase subunit B  25.6 
 
 
1212 aa  469  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.82 
 
 
1207 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.55 
 
 
1204 aa  353  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.48 
 
 
1168 aa  347  7e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.94 
 
 
1203 aa  346  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  29.24 
 
 
1208 aa  345  4e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.58 
 
 
1200 aa  336  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.86 
 
 
1200 aa  333  9e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  29.57 
 
 
1212 aa  333  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.5 
 
 
1203 aa  326  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  28.34 
 
 
1224 aa  323  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  26.85 
 
 
1208 aa  321  6e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.16 
 
 
1240 aa  315  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.63 
 
 
1269 aa  311  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2025  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.92 
 
 
1224 aa  308  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2291  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.37 
 
 
1273 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  27.95 
 
 
1183 aa  303  9e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2279  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.12 
 
 
1273 aa  303  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4565  hypothetical protein  26.12 
 
 
1273 aa  303  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2094  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.42 
 
 
1273 aa  302  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.780628  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2047  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.7 
 
 
1273 aa  297  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.680974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3042  exonuclease V subunit beta  28.74 
 
 
1180 aa  295  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1936  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.59 
 
 
1251 aa  293  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2111  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.31 
 
 
1251 aa  293  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3263  exonuclease V subunit beta  27.66 
 
 
1181 aa  293  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2967  exonuclease V subunit beta  29.2 
 
 
1170 aa  290  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.483472  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3140  exonuclease V subunit beta  28.79 
 
 
1180 aa  290  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0914  exonuclease V subunit beta  28.58 
 
 
1194 aa  290  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4085  exonuclease V subunit beta  28.74 
 
 
1180 aa  290  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0871  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.79 
 
 
1180 aa  290  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2966  exonuclease V subunit beta  28.79 
 
 
1180 aa  290  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0895  exonuclease V subunit beta  28.79 
 
 
1180 aa  290  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.861993  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02668  exonuclease V (RecBCD complex), beta subunit  29.22 
 
 
1180 aa  289  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02629  hypothetical protein  29.22 
 
 
1180 aa  289  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1774  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.56 
 
 
1274 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2642  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.22 
 
 
1229 aa  288  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.13 
 
 
1226 aa  286  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2148  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.85 
 
 
1259 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2246  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.63 
 
 
1263 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.919114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2838  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.7 
 
 
1230 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.506585  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1614  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.51 
 
 
1232 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364449  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.34 
 
 
1276 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1852  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.28 
 
 
1269 aa  283  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.7 
 
 
1129 aa  282  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.61 
 
 
1130 aa  282  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.91 
 
 
1240 aa  279  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1209  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.35 
 
 
1097 aa  276  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1624  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.52 
 
 
1240 aa  275  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.547512  normal  0.545211 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3389  exonuclease V subunit beta  27.89 
 
 
1203 aa  272  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3157  exonuclease V subunit beta  27.48 
 
 
1181 aa  269  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0252  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.45 
 
 
1111 aa  267  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0689  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.26 
 
 
1229 aa  263  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0221198  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0917  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.18 
 
 
1115 aa  262  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45261  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2429  Exodeoxyribonuclease V  31.24 
 
 
1148 aa  263  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.765298  hitchhiker  0.0020094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0900  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.18 
 
 
1115 aa  262  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0906  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.92 
 
 
1115 aa  262  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.025647 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0929  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.78 
 
 
1216 aa  259  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10641  exonuclease V beta subunit recB  30.82 
 
 
1094 aa  258  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000417929  normal  0.0791919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2746  Exodeoxyribonuclease V  30.88 
 
 
1134 aa  259  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3373  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.12 
 
 
1132 aa  258  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.43 
 
 
1223 aa  257  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0804  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.03 
 
 
1242 aa  254  5.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.888497  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0579  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.77 
 
 
1085 aa  254  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.34 
 
 
1109 aa  253  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915993  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3007  exonuclease V subunit beta  29.36 
 
 
1189 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1748  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.46 
 
 
1241 aa  245  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0546  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.06 
 
 
1183 aa  244  5e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3907  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.46 
 
 
1139 aa  244  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0574999  normal  0.0165259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.53 
 
 
1272 aa  244  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000848552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2295  Exodeoxyribonuclease V  30.92 
 
 
1110 aa  243  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0993  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.35 
 
 
1125 aa  239  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00861563  normal  0.126412 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1401  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.35 
 
 
1221 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1359  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.21 
 
 
1226 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2547  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.3 
 
 
1198 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.789149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2932  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.3 
 
 
1198 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4323  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.2 
 
 
1236 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182798  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1814  exodeoxyribonuclease V beta chain  26.67 
 
 
1242 aa  234  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1746  UvrD/REP helicase  26.43 
 
 
1243 aa  231  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.89 
 
 
1199 aa  231  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.29 
 
 
1234 aa  230  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0918971  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.07 
 
 
1234 aa  230  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1188  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.65 
 
 
1235 aa  225  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.513756  normal  0.625115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2171  Exodeoxyribonuclease V  26.74 
 
 
1152 aa  225  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0735  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.65 
 
 
2007 aa  225  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1215  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.65 
 
 
1235 aa  225  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.513189  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1901  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.23 
 
 
1224 aa  219  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2420  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.42 
 
 
1238 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0681  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.47 
 
 
1230 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.639627  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3320  exonuclease V subunit beta  28.98 
 
 
1181 aa  211  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.602721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2088  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.01 
 
 
1236 aa  211  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2352  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.06 
 
 
1355 aa  211  9e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>