More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1114 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_11941  UvrD/REP helicase subunit B  70.36 
 
 		 1212 aa  1661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12091  UvrD/REP helicase subunit B  91.8 
 
 		 1208 aa  2111    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  100 
 
 		 1208 aa  2377    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0953517  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12101  UvrD/REP helicase subunit B  91.31 
 
 		 1208 aa  2096    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10831  UvrD/REP helicase subunit B  31.13 
 
 		 1265 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.261186  normal  0.314032 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14771  UvrD/REP helicase subunit B  31.71 
 
 		 1261 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.248766 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0645  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.77 
 
 		 1261 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09621  UvrD/REP helicase subunit B  26.31 
 
 		 1274 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1410  exodeoxyribonuclease V, beta subunit RecB  26 
 
 		 1208 aa  510  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.828955  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1651  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.16 
 
 		 1226 aa  503  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.09 
 
 		 1207 aa  270  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.48 
 
 		 1200 aa  252  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.94 
 
 		 1203 aa  243  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.99 
 
 		 1168 aa  240  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0906  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.43 
 
 		 1115 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.025647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0900  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.5 
 
 		 1115 aa  235  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0917  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.5 
 
 		 1115 aa  235  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  22.62 
 
 		 1208 aa  224  8e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1981  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.88 
 
 		 1259 aa  219  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.335433  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1901  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.8 
 
 		 1224 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0929  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.82 
 
 		 1216 aa  216  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1614  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.16 
 
 		 1232 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10641  exonuclease V beta subunit recB  20.73 
 
 		 1094 aa  215  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000417929  normal  0.0791919 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.69 
 
 		 1199 aa  213  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  22.25 
 
 		 1224 aa  209  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.47 
 
 		 1109 aa  207  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0252  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.33 
 
 		 1111 aa  206  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103947  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.22 
 
 		 1269 aa  203  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3373  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.69 
 
 		 1132 aa  202  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2746  Exodeoxyribonuclease V  20.88 
 
 		 1134 aa  201  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1209  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.44 
 
 		 1097 aa  201  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  21.99 
 
 		 1212 aa  201  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.84 
 
 		 1203 aa  191  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0991  exonuclease V subunit beta  21.51 
 
 		 1220 aa  190  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.53 
 
 		 1240 aa  189  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1043  exonuclease V subunit beta  21.74 
 
 		 1220 aa  190  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3231  exonuclease V subunit beta  21.74 
 
 		 1220 aa  190  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  19.32 
 
 		 1204 aa  184  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1748  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.38 
 
 		 1241 aa  183  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.3 
 
 		 1234 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.41 
 
 		 1234 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0918971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4323  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.48 
 
 		 1236 aa  182  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1188  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.59 
 
 		 1235 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.513756  normal  0.625115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0761  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.76 
 
 		 1223 aa  181  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.238035  normal  0.093599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0735  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.48 
 
 		 2007 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1624  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.22 
 
 		 1240 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.547512  normal  0.545211 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1215  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.48 
 
 		 1235 aa  180  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.513189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.64 
 
 		 1130 aa  179  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4014  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.44 
 
 		 1226 aa  178  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.398722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.53 
 
 		 1129 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01028  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.12 
 
 		 1336 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.87 
 
 		 1226 aa  176  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2088  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.34 
 
 		 1236 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  22.28 
 
 		 1183 aa  175  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3263  exonuclease V subunit beta  22.67 
 
 		 1181 aa  174  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2295  Exodeoxyribonuclease V  21.84 
 
 		 1110 aa  174  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2838  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.89 
 
 		 1230 aa  173  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.506585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2642  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.44 
 
 		 1229 aa  172  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0579  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.51 
 
 		 1085 aa  172  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4568  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.09 
 
 		 1263 aa  170  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03906  exodeoxyribonuclease V beta chain  20.33 
 
 		 1357 aa  170  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2148  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.7 
 
 		 1259 aa  169  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2932  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.92 
 
 		 1198 aa  167  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2547  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.92 
 
 		 1198 aa  167  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.789149 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2094  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.7 
 
 		 1273 aa  167  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.780628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2768  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.07 
 
 		 1286 aa  167  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2047  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.94 
 
 		 1273 aa  166  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.680974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2291  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.95 
 
 		 1273 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.52 
 
 		 1200 aa  163  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2111  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.18 
 
 		 1251 aa  164  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1852  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.19 
 
 		 1269 aa  164  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02668  exonuclease V (RecBCD complex), beta subunit  22.74 
 
 		 1180 aa  163  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501353  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2967  exonuclease V subunit beta  22.76 
 
 		 1170 aa  163  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.483472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4565  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1273 aa  163  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2279  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.8 
 
 		 1273 aa  163  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02629  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1180 aa  163  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0871  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.96 
 
 		 1180 aa  162  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0895  exonuclease V subunit beta  22.96 
 
 		 1180 aa  162  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.861993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2966  exonuclease V subunit beta  22.96 
 
 		 1180 aa  162  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3140  exonuclease V subunit beta  22.96 
 
 		 1180 aa  162  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0993  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.93 
 
 		 1125 aa  162  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00861563  normal  0.126412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4085  exonuclease V subunit beta  23.07 
 
 		 1180 aa  161  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1936  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.03 
 
 		 1251 aa  160  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0997  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.76 
 
 		 1203 aa  160  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2171  Exodeoxyribonuclease V  26.36 
 
 		 1152 aa  160  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0914  exonuclease V subunit beta  21.3 
 
 		 1194 aa  159  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2246  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.26 
 
 		 1263 aa  159  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919114 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3042  exonuclease V subunit beta  22.99 
 
 		 1180 aa  157  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  21.2 
 
 		 1208 aa  155  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1774  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.61 
 
 		 1274 aa  153  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.59 
 
 		 1209 aa  151  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.45 
 
 		 1226 aa  151  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4671  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21 
 
 		 1224 aa  148  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.25 
 
 		 1230 aa  147  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0681  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.56 
 
 		 1230 aa  146  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.639627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2025  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.63 
 
 		 1224 aa  145  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2352  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.61 
 
 		 1355 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1814  exodeoxyribonuclease V beta chain  19.89 
 
 		 1242 aa  144  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.42 
 
 		 1276 aa  142  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1746  UvrD/REP helicase  20.29 
 
 		 1243 aa  141  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>