More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0735 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1189  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  94.97 
 
 		 773 aa  1243    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357914  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1188  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  99.43 
 
 		 1235 aa  2434    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.513756  normal  0.625115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  45.53 
 
 		 1200 aa  904    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  77.61 
 
 		 1270 aa  1779    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2087  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  81.7 
 
 		 774 aa  1080    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0472  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  77.61 
 
 		 1270 aa  1779    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.352906  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1520  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  77.45 
 
 		 1934 aa  1765    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.604792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4323  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  94.65 
 
 		 1236 aa  2184    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4324  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  89.55 
 
 		 767 aa  1183    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1099  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  83.66 
 
 		 773 aa  1037    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.774754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1748  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  69.27 
 
 		 1241 aa  1601    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1386  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  78.04 
 
 		 1263 aa  1779    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2851  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  79.11 
 
 		 1321 aa  1774    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.191976  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2838  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  71.28 
 
 		 1230 aa  1595    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.506585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0735  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  100 
 
 		 2007 aa  3933    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1390  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  77.45 
 
 		 1270 aa  1772    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1614  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  70.56 
 
 		 1232 aa  1611    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2088  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  90.76 
 
 		 1236 aa  2063    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  93.03 
 
 		 1234 aa  2160    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1099  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  85.53 
 
 		 774 aa  1098    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1189  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  77.61 
 
 		 1270 aa  1779    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1215  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  100 
 
 		 1235 aa  2446    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.513189  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1216  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  100 
 
 		 772 aa  1481    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0680  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  77.61 
 
 		 1270 aa  1779    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  92.46 
 
 		 1234 aa  2134    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0918971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  35.42 
 
 		 1203 aa  592  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  37.49 
 
 		 1168 aa  583  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  34.26 
 
 		 1224 aa  580  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  34.15 
 
 		 1212 aa  575  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2642  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.03 
 
 		 1229 aa  569  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1936  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.23 
 
 		 1251 aa  569  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  35.65 
 
 		 1200 aa  562  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  33.68 
 
 		 1208 aa  561  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  35.58 
 
 		 1208 aa  563  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2246  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.55 
 
 		 1263 aa  553  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919114 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.05 
 
 		 1226 aa  556  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2148  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.5 
 
 		 1259 aa  551  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  35.04 
 
 		 1207 aa  547  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1774  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.94 
 
 		 1274 aa  548  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2111  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.67 
 
 		 1251 aa  545  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1852  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.83 
 
 		 1269 aa  545  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3320  exonuclease V subunit beta  35.09 
 
 		 1181 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.602721 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.34 
 
 		 1276 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3157  exonuclease V subunit beta  35.32 
 
 		 1181 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0914  exonuclease V subunit beta  35.09 
 
 		 1194 aa  539  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3220  exonuclease V subunit beta  35.02 
 
 		 1181 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3140  exonuclease V subunit beta  35.09 
 
 		 1181 aa  539  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3206  exonuclease V subunit beta  35.09 
 
 		 1181 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.146819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2047  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.59 
 
 		 1273 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.680974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02668  exonuclease V (RecBCD complex), beta subunit  34.54 
 
 		 1180 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3389  exonuclease V subunit beta  34.68 
 
 		 1203 aa  535  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02629  hypothetical protein  34.54 
 
 		 1180 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2094  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.64 
 
 		 1273 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.780628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2291  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.18 
 
 		 1273 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2279  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.46 
 
 		 1273 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2967  exonuclease V subunit beta  34.76 
 
 		 1170 aa  530  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.483472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4565  hypothetical protein  33.46 
 
 		 1273 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1901  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.75 
 
 		 1224 aa  531  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3042  exonuclease V subunit beta  34.62 
 
 		 1180 aa  530  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.14 
 
 		 1199 aa  528  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2420  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.38 
 
 		 1238 aa  530  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415139  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4085  exonuclease V subunit beta  34.54 
 
 		 1180 aa  528  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  35.25 
 
 		 1183 aa  530  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0871  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.38 
 
 		 1180 aa  527  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0895  exonuclease V subunit beta  34.38 
 
 		 1180 aa  527  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.861993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2966  exonuclease V subunit beta  34.38 
 
 		 1180 aa  527  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.3 
 
 		 1223 aa  525  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3140  exonuclease V subunit beta  34.31 
 
 		 1180 aa  525  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0997  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.9 
 
 		 1203 aa  522  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1359  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  35.41 
 
 		 1226 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0991  exonuclease V subunit beta  34.12 
 
 		 1220 aa  515  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1043  exonuclease V subunit beta  34.12 
 
 		 1220 aa  515  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3231  exonuclease V subunit beta  34.12 
 
 		 1220 aa  515  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.29 
 
 		 1203 aa  511  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  36.83 
 
 		 1269 aa  511  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3007  exonuclease V subunit beta  35.57 
 
 		 1189 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3263  exonuclease V subunit beta  34.26 
 
 		 1181 aa  507  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2352  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.04 
 
 		 1355 aa  499  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.69 
 
 		 1240 aa  498  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  35.77 
 
 		 1204 aa  493  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1401  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.6 
 
 		 1221 aa  493  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0681  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.98 
 
 		 1230 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.639627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.31 
 
 		 1230 aa  476  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0689  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.92 
 
 		 1229 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0221198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0761  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.69 
 
 		 1223 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.238035  normal  0.093599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4851  exodeoxyribonuclease V beta chain  33.41 
 
 		 1244 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55670  exodeoxyribonuclease V beta chain  33.61 
 
 		 1245 aa  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.80629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4673  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.7 
 
 		 1224 aa  459  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.97 
 
 		 1226 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4537  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.72 
 
 		 1224 aa  457  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.227788  normal  0.354601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4671  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.33 
 
 		 1224 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828259 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.91 
 
 		 1240 aa  447  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0804  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.38 
 
 		 1242 aa  443  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.888497  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1768  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  68.77 
 
 		 898 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1521  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  69.14 
 
 		 898 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0679  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  68.77 
 
 		 898 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.287821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2025  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.26 
 
 		 1224 aa  436  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.59 
 
 		 1209 aa  435  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1391  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  69.14 
 
 		 890 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1190  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  68.77 
 
 		 896 aa  434  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.916948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>