More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1099 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1099  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  100 
 
 		 773 aa  1484    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.774754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4324  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  84.66 
 
 		 767 aa  1134    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1189  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  85.22 
 
 		 773 aa  1144    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357914  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0735  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  84.08 
 
 		 2007 aa  1101    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1099  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  96.39 
 
 		 774 aa  1234    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1216  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  84.08 
 
 		 772 aa  1104    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2087  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  82.65 
 
 		 774 aa  1085    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0473  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  68.1 
 
 		 896 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1391  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  68.1 
 
 		 890 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1768  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  68.1 
 
 		 898 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1190  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  68.1 
 
 		 896 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.916948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1521  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  68.1 
 
 		 898 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0679  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  68.1 
 
 		 898 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.287821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1387  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  67.82 
 
 		 898 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2850  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  66.48 
 
 		 899 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.934016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2837  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  70.14 
 
 		 704 aa  416  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1615  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  70.76 
 
 		 695 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.481167 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1747  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  67.74 
 
 		 672 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0692  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  53.61 
 
 		 603 aa  246  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4084  exonuclease V subunit alpha  44.85 
 
 		 608 aa  219  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02667  exonuclease V (RecBCD complex), alpha chain  44.85 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0872  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  44.85 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.938405  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3043  exonuclease V subunit alpha  44.85 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.225396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02628  hypothetical protein  44.85 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.627808  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3139  exonuclease V subunit alpha  44.85 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0896  exonuclease V subunit alpha  44.85 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.367719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0323  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  48.57 
 
 		 599 aa  218  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2966  exonuclease V subunit alpha  44.12 
 
 		 608 aa  217  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2965  exonuclease V subunit alpha  44.49 
 
 		 608 aa  217  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3156  exonuclease V subunit alpha  44.96 
 
 		 611 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3319  exonuclease V subunit alpha  44.96 
 
 		 611 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.940485 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3205  exonuclease V subunit alpha  44.96 
 
 		 611 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3139  exonuclease V subunit alpha  44.96 
 
 		 611 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3219  exonuclease V subunit alpha  44.96 
 
 		 611 aa  214  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0343  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  47.84 
 
 		 599 aa  213  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3262  exonuclease V subunit alpha  43.12 
 
 		 607 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0915  exonuclease V subunit alpha  45 
 
 		 619 aa  206  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.718919  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3813  exonuclease V subunit alpha  45.42 
 
 		 621 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.752384  hitchhiker  0.00686322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1892  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  45.81 
 
 		 594 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087164  hitchhiker  0.00000000000433292 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0682  exodeoxyribonuclease V alpha chain  39.92 
 
 		 674 aa  201  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163912  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3006  exonuclease V subunit alpha  41.67 
 
 		 616 aa  200  9e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0578  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  47.42 
 
 		 601 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2150  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  41.5 
 
 		 604 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00157683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3388  exonuclease V subunit alpha  44.12 
 
 		 618 aa  196  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1903  exodeoxyribonuclease V, 67 kDa subunit  37.58 
 
 		 706 aa  195  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1044  exonuclease V subunit alpha  41.02 
 
 		 657 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0992  exonuclease V subunit alpha  41.02 
 
 		 657 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3230  exonuclease V subunit alpha  41.02 
 
 		 652 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.91996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3231  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40.36 
 
 		 639 aa  190  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00025834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1758  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.32 
 
 		 737 aa  188  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002686  exodeoxyribonuclease V alpha chain  35.93 
 
 		 715 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03300  hypothetical protein  35.93 
 
 		 725 aa  182  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1432  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40.64 
 
 		 576 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00407883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1535  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  45.32 
 
 		 595 aa  179  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2280  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.83 
 
 		 739 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1056  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  43.75 
 
 		 609 aa  179  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.923429  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4566  hypothetical protein  38.83 
 
 		 739 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2421  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.98 
 
 		 664 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1460  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.88 
 
 		 698 aa  179  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4670  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  41.19 
 
 		 691 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281806 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1358  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  43.48 
 
 		 588 aa  177  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2093  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.46 
 
 		 740 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4672  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40.57 
 
 		 691 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.156704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1773  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.81 
 
 		 706 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2292  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.85 
 
 		 740 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.615762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1400  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  43.21 
 
 		 581 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1987  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.24 
 
 		 676 aa  174  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000228018  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1170  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  41.38 
 
 		 655 aa  174  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2046  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.52 
 
 		 739 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0762  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  43.16 
 
 		 691 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.089759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4536  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40.25 
 
 		 691 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636293  normal  0.640936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2247  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.75 
 
 		 701 aa  171  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.271795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2112  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.1 
 
 		 686 aa  169  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1851  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.1 
 
 		 710 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1902  exodeoxyribonuclease V  37.64 
 
 		 631 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2147  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.78 
 
 		 712 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0371  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.04 
 
 		 588 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.219276  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1211  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.03 
 
 		 787 aa  164  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1935  exodeoxyribonuclease V  35.96 
 
 		 683 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1778  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40.4 
 
 		 739 aa  162  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000685942 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2353  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.82 
 
 		 767 aa  161  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0770  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.11 
 
 		 579 aa  161  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0335755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2643  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.57 
 
 		 682 aa  160  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2131  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.52 
 
 		 662 aa  160  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0690  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.01 
 
 		 702 aa  160  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4567  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  41.67 
 
 		 708 aa  160  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2548  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  47.08 
 
 		 650 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.975526 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2933  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  47.08 
 
 		 646 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.238613  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1126  exonuclease V, alpha subunit  34.17 
 
 		 734 aa  158  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00308131  normal  0.011484 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1292  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.12 
 
 		 731 aa  159  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.255394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2535  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.33 
 
 		 687 aa  157  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1269  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40.31 
 
 		 680 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4013  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.51 
 
 		 626 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.123788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1847  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  47.28 
 
 		 683 aa  156  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.401727  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51700  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40 
 
 		 703 aa  155  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0778  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.5 
 
 		 697 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1623  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  48.25 
 
 		 679 aa  153  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127673  normal  0.170261 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2767  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.49 
 
 		 769 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2169  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.96 
 
 		 601 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55660  exodeoxyribonuclease V alpha chain  43.2 
 
 		 721 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>