More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2837 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1615  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  88.12 
 
 		 695 aa  1140    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.481167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2837  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  100 
 
 		 704 aa  1388    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1747  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  71.77 
 
 		 672 aa  859    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4324  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  70.45 
 
 		 767 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2850  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  73.98 
 
 		 899 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.934016  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0735  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  72.59 
 
 		 2007 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1189  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  63.31 
 
 		 773 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357914  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1216  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  72.59 
 
 		 772 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2087  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  69.86 
 
 		 774 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1387  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  73.26 
 
 		 898 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0473  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  72.89 
 
 		 896 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1768  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  72.89 
 
 		 898 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0679  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  72.89 
 
 		 898 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.287821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1521  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  72.89 
 
 		 898 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1190  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  72.89 
 
 		 896 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.916948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1391  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  72.89 
 
 		 890 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1099  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  70.83 
 
 		 774 aa  364  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1099  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  69.94 
 
 		 773 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.774754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0323  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.85 
 
 		 599 aa  346  7e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0578  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40.47 
 
 		 601 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3230  exonuclease V subunit alpha  39.4 
 
 		 652 aa  334  4e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.91996 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1044  exonuclease V subunit alpha  39.41 
 
 		 657 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0992  exonuclease V subunit alpha  39.26 
 
 		 657 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3388  exonuclease V subunit alpha  37.52 
 
 		 618 aa  317  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3262  exonuclease V subunit alpha  36.79 
 
 		 607 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1535  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.47 
 
 		 595 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2421  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.33 
 
 		 664 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1892  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.25 
 
 		 594 aa  300  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087164  hitchhiker  0.00000000000433292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4670  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.4 
 
 		 691 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281806 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3231  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.63 
 
 		 639 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00025834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4850  exodeoxyribonuclease V alpha chain  39.47 
 
 		 720 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.61173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2643  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.27 
 
 		 682 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1903  exodeoxyribonuclease V, 67 kDa subunit  37.55 
 
 		 706 aa  294  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03300  hypothetical protein  33.43 
 
 		 725 aa  294  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002686  exodeoxyribonuclease V alpha chain  34.5 
 
 		 715 aa  291  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4536  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.33 
 
 		 691 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636293  normal  0.640936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4672  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.45 
 
 		 691 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.156704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51700  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40.18 
 
 		 703 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1170  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40.7 
 
 		 655 aa  287  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768019  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0690  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.52 
 
 		 702 aa  287  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1758  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.5 
 
 		 737 aa  286  8e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1935  exodeoxyribonuclease V  33.82 
 
 		 683 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55660  exodeoxyribonuclease V alpha chain  39.62 
 
 		 721 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1987  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.35 
 
 		 676 aa  280  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000228018  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0762  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.77 
 
 		 691 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.089759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0778  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.45 
 
 		 697 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0682  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.12 
 
 		 697 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1778  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.2 
 
 		 739 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000685942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2131  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.17 
 
 		 662 aa  272  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4567  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.45 
 
 		 708 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1460  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.11 
 
 		 698 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2112  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.75 
 
 		 686 aa  267  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1269  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.9 
 
 		 680 aa  266  8e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0522  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.18 
 
 		 735 aa  265  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.496827  hitchhiker  0.000245551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2292  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.45 
 
 		 740 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.615762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2280  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.41 
 
 		 739 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4566  hypothetical protein  32.41 
 
 		 739 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1773  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.42 
 
 		 706 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1851  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.85 
 
 		 710 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2147  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.86 
 
 		 712 aa  257  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2093  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.26 
 
 		 740 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2046  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.65 
 
 		 739 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591294  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2247  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.17 
 
 		 701 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.271795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2169  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.98 
 
 		 601 aa  253  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2535  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.18 
 
 		 687 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0371  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.89 
 
 		 588 aa  242  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.219276  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0692  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  50.91 
 
 		 603 aa  240  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0547  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.61 
 
 		 619 aa  218  2.9999999999999998e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.607405  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2430  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.72 
 
 		 647 aa  218  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869931  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03905  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.3 
 
 		 750 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.824272  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3813  exonuclease V subunit alpha  45.86 
 
 		 621 aa  213  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.752384  hitchhiker  0.00686322 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0915  exonuclease V subunit alpha  44.73 
 
 		 619 aa  212  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.718919  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4084  exonuclease V subunit alpha  40.52 
 
 		 608 aa  206  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2966  exonuclease V subunit alpha  40.23 
 
 		 608 aa  204  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3006  exonuclease V subunit alpha  42.29 
 
 		 616 aa  203  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02667  exonuclease V (RecBCD complex), alpha chain  40.23 
 
 		 608 aa  203  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0872  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40.23 
 
 		 608 aa  203  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.938405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0896  exonuclease V subunit alpha  40.23 
 
 		 608 aa  203  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.367719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3139  exonuclease V subunit alpha  40.23 
 
 		 608 aa  203  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02628  hypothetical protein  40.23 
 
 		 608 aa  203  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.627808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3043  exonuclease V subunit alpha  40.23 
 
 		 608 aa  203  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.225396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2965  exonuclease V subunit alpha  39.94 
 
 		 608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3156  exonuclease V subunit alpha  38.53 
 
 		 611 aa  197  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3139  exonuclease V subunit alpha  38.53 
 
 		 611 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3319  exonuclease V subunit alpha  38.53 
 
 		 611 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.940485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3219  exonuclease V subunit alpha  38.53 
 
 		 611 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3205  exonuclease V subunit alpha  38.53 
 
 		 611 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0682  exodeoxyribonuclease V alpha chain  38.41 
 
 		 674 aa  194  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2150  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40.07 
 
 		 604 aa  191  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00157683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0343  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  41.52 
 
 		 599 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1432  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40.15 
 
 		 576 aa  182  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00407883  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1358  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  42.81 
 
 		 588 aa  182  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1400  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  41.84 
 
 		 581 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1056  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  44.13 
 
 		 609 aa  178  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.923429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1980  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  41.67 
 
 		 714 aa  171  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2026  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40.37 
 
 		 681 aa  171  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2548  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.93 
 
 		 650 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.975526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1902  exodeoxyribonuclease V  38.46 
 
 		 631 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2933  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.93 
 
 		 646 aa  169  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.238613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0253  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.13 
 
 		 584 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>