More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2746 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0993  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  42.76 
 
 		 1125 aa  679    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00861563  normal  0.126412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0906  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  39.71 
 
 		 1115 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.025647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2295  Exodeoxyribonuclease V  49.65 
 
 		 1110 aa  873    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3907  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  42.44 
 
 		 1139 aa  650    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0574999  normal  0.0165259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0900  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  39.79 
 
 		 1115 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2746  Exodeoxyribonuclease V  100 
 
 		 1134 aa  2262    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2429  Exodeoxyribonuclease V  43.71 
 
 		 1148 aa  715    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.765298  hitchhiker  0.0020094 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0252  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  40.95 
 
 		 1111 aa  687    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103947  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0917  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  39.79 
 
 		 1115 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1209  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  40.03 
 
 		 1097 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3373  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  41.75 
 
 		 1132 aa  624  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  39.19 
 
 		 1109 aa  611  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10641  exonuclease V beta subunit recB  40.4 
 
 		 1094 aa  596  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000417929  normal  0.0791919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.24 
 
 		 1129 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.59 
 
 		 1130 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0579  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.61 
 
 		 1085 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.72 
 
 		 1204 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.75 
 
 		 1199 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0997  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.08 
 
 		 1203 aa  302  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.67 
 
 		 1200 aa  301  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.2 
 
 		 1203 aa  300  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3263  exonuclease V subunit beta  31.06 
 
 		 1181 aa  296  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3389  exonuclease V subunit beta  30.79 
 
 		 1203 aa  289  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1043  exonuclease V subunit beta  29.75 
 
 		 1220 aa  287  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0991  exonuclease V subunit beta  29.75 
 
 		 1220 aa  288  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3231  exonuclease V subunit beta  29.75 
 
 		 1220 aa  287  5.999999999999999e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  30.49 
 
 		 1208 aa  287  9e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.83 
 
 		 1207 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  28.92 
 
 		 1224 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  30.84 
 
 		 1183 aa  284  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.42 
 
 		 1203 aa  282  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  28.16 
 
 		 1208 aa  279  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0914  exonuclease V subunit beta  30.24 
 
 		 1194 aa  278  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  28.95 
 
 		 1212 aa  278  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3220  exonuclease V subunit beta  31.06 
 
 		 1181 aa  278  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3157  exonuclease V subunit beta  31.34 
 
 		 1181 aa  277  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3007  exonuclease V subunit beta  31.2 
 
 		 1189 aa  277  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.22 
 
 		 1168 aa  277  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3320  exonuclease V subunit beta  31.06 
 
 		 1181 aa  276  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.602721 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1359  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.12 
 
 		 1226 aa  275  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4565  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1273 aa  274  7e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.29 
 
 		 1223 aa  274  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2279  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.98 
 
 		 1273 aa  274  7e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3206  exonuclease V subunit beta  30.67 
 
 		 1181 aa  274  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.146819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3140  exonuclease V subunit beta  30.78 
 
 		 1181 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1401  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.63 
 
 		 1221 aa  273  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0871  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.68 
 
 		 1180 aa  273  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2111  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.05 
 
 		 1251 aa  273  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3140  exonuclease V subunit beta  30.68 
 
 		 1180 aa  272  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2966  exonuclease V subunit beta  30.68 
 
 		 1180 aa  273  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0895  exonuclease V subunit beta  30.68 
 
 		 1180 aa  273  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.861993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2291  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.25 
 
 		 1273 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4085  exonuclease V subunit beta  30.56 
 
 		 1180 aa  269  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2967  exonuclease V subunit beta  30.92 
 
 		 1170 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.483472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3042  exonuclease V subunit beta  30.68 
 
 		 1180 aa  269  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10831  UvrD/REP helicase subunit B  27.41 
 
 		 1265 aa  268  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.261186  normal  0.314032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2094  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.61 
 
 		 1273 aa  268  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.780628  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02668  exonuclease V (RecBCD complex), beta subunit  30.47 
 
 		 1180 aa  267  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02629  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1180 aa  267  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2047  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.91 
 
 		 1273 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.680974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4014  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.03 
 
 		 1226 aa  265  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.398722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1852  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.98 
 
 		 1269 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1774  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.85 
 
 		 1274 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1651  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.01 
 
 		 1226 aa  262  3e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2246  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.53 
 
 		 1263 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919114 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1410  exodeoxyribonuclease V, beta subunit RecB  30.31 
 
 		 1208 aa  259  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.828955  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1901  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.03 
 
 		 1224 aa  259  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.92 
 
 		 1240 aa  258  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2148  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.24 
 
 		 1259 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.98 
 
 		 1269 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0645  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.27 
 
 		 1261 aa  253  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.08 
 
 		 1230 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1748  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.48 
 
 		 1241 aa  251  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14771  UvrD/REP helicase subunit B  24.84 
 
 		 1261 aa  250  9e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.248766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0761  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.18 
 
 		 1223 aa  250  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.238035  normal  0.093599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1614  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.47 
 
 		 1232 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.01 
 
 		 1226 aa  244  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0681  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.13 
 
 		 1230 aa  244  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.639627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2642  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.56 
 
 		 1229 aa  243  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2420  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.21 
 
 		 1238 aa  243  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415139  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09621  UvrD/REP helicase subunit B  29.05 
 
 		 1274 aa  243  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4671  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.37 
 
 		 1224 aa  243  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2025  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.39 
 
 		 1224 aa  243  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4673  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.24 
 
 		 1224 aa  242  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2838  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.52 
 
 		 1230 aa  241  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.506585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0804  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.72 
 
 		 1242 aa  241  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.888497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4537  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.24 
 
 		 1224 aa  241  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.227788  normal  0.354601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0689  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.43 
 
 		 1229 aa  239  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0221198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.92 
 
 		 1240 aa  239  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0929  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.67 
 
 		 1216 aa  239  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0546  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.27 
 
 		 1183 aa  238  6e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1814  exodeoxyribonuclease V beta chain  31.33 
 
 		 1242 aa  235  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1757  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.33 
 
 		 1320 aa  233  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03906  exodeoxyribonuclease V beta chain  30.84 
 
 		 1357 aa  231  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1936  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.2 
 
 		 1251 aa  229  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.06 
 
 		 1226 aa  226  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01028  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.19 
 
 		 1336 aa  226  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1981  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.25 
 
 		 1259 aa  224  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.335433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2768  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.18 
 
 		 1286 aa  224  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2088  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.56 
 
 		 1236 aa  218  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>