More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1651 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0645  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  37.56 
 
 
1261 aa  917    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10831  UvrD/REP helicase subunit B  40.95 
 
 
1265 aa  963    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.261186  normal  0.314032 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1410  exodeoxyribonuclease V, beta subunit RecB  67.24 
 
 
1208 aa  1526    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.828955  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1651  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  100 
 
 
1226 aa  2440    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14771  UvrD/REP helicase subunit B  37.72 
 
 
1261 aa  919    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.248766 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09621  UvrD/REP helicase subunit B  51.37 
 
 
1274 aa  1142    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12091  UvrD/REP helicase subunit B  25.48 
 
 
1208 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12101  UvrD/REP helicase subunit B  25.72 
 
 
1208 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11941  UvrD/REP helicase subunit B  26.42 
 
 
1212 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.8 
 
 
1208 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0953517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.47 
 
 
1203 aa  347  7e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.28 
 
 
1207 aa  340  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.71 
 
 
1269 aa  337  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.39 
 
 
1203 aa  336  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1748  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.07 
 
 
1241 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1614  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.81 
 
 
1232 aa  322  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364449  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  29.53 
 
 
1183 aa  318  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  28.27 
 
 
1224 aa  315  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2838  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.9 
 
 
1230 aa  311  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.506585  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3231  exonuclease V subunit beta  29.1 
 
 
1220 aa  309  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0991  exonuclease V subunit beta  29.1 
 
 
1220 aa  309  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1043  exonuclease V subunit beta  29.1 
 
 
1220 aa  309  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  28.17 
 
 
1212 aa  309  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0914  exonuclease V subunit beta  29.67 
 
 
1194 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  29.29 
 
 
1208 aa  307  8.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.31 
 
 
1199 aa  307  9.000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2111  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.05 
 
 
1251 aa  303  9e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.21 
 
 
1200 aa  301  4e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4851  exodeoxyribonuclease V beta chain  31.11 
 
 
1244 aa  301  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.86 
 
 
1226 aa  300  9e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  26.53 
 
 
1208 aa  299  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2291  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.41 
 
 
1273 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2047  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.64 
 
 
1273 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.680974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3263  exonuclease V subunit beta  27.29 
 
 
1181 aa  298  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2094  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.7 
 
 
1273 aa  297  9e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.780628  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4565  hypothetical protein  26.21 
 
 
1273 aa  296  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2279  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.21 
 
 
1273 aa  296  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0900  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.14 
 
 
1115 aa  291  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0917  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.14 
 
 
1115 aa  291  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45261  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2352  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27 
 
 
1355 aa  290  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.46 
 
 
1240 aa  290  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.76 
 
 
1226 aa  289  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3389  exonuclease V subunit beta  28.83 
 
 
1203 aa  288  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2148  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.96 
 
 
1259 aa  288  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2246  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.3 
 
 
1263 aa  288  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.919114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.16 
 
 
1168 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2642  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.03 
 
 
1229 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0997  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.13 
 
 
1203 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1852  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.37 
 
 
1269 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3320  exonuclease V subunit beta  27.59 
 
 
1181 aa  284  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.602721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0252  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.36 
 
 
1111 aa  284  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103947  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10641  exonuclease V beta subunit recB  31.41 
 
 
1094 aa  284  9e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000417929  normal  0.0791919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.5 
 
 
1129 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3220  exonuclease V subunit beta  27.35 
 
 
1181 aa  283  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0906  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.65 
 
 
1115 aa  282  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.025647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3140  exonuclease V subunit beta  27.21 
 
 
1181 aa  281  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3206  exonuclease V subunit beta  27.43 
 
 
1181 aa  281  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.146819  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1774  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.35 
 
 
1274 aa  281  6e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3157  exonuclease V subunit beta  27.08 
 
 
1181 aa  280  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1209  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.05 
 
 
1097 aa  279  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0689  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.41 
 
 
1229 aa  279  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0221198  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2746  Exodeoxyribonuclease V  30.2 
 
 
1134 aa  278  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.92 
 
 
1130 aa  272  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1359  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.42 
 
 
1226 aa  272  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1981  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.68 
 
 
1259 aa  271  5e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.335433  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1401  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.03 
 
 
1221 aa  271  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.61 
 
 
1109 aa  270  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915993  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3373  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.68 
 
 
1132 aa  270  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0579  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.77 
 
 
1085 aa  269  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2429  Exodeoxyribonuclease V  31.66 
 
 
1148 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.765298  hitchhiker  0.0020094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.64 
 
 
1209 aa  264  8.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2295  Exodeoxyribonuclease V  32.1 
 
 
1110 aa  263  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0993  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.15 
 
 
1125 aa  261  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00861563  normal  0.126412 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0929  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.45 
 
 
1216 aa  261  8e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2025  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.58 
 
 
1224 aa  261  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.54 
 
 
1240 aa  260  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4014  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.24 
 
 
1226 aa  260  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.398722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4537  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.29 
 
 
1224 aa  260  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.227788  normal  0.354601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4673  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.13 
 
 
1224 aa  257  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0804  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.22 
 
 
1242 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.888497  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.7 
 
 
1204 aa  254  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0546  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.57 
 
 
1183 aa  249  2e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01028  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.13 
 
 
1336 aa  249  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.55 
 
 
1200 aa  249  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4323  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.74 
 
 
1236 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182798  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1624  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.77 
 
 
1240 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.547512  normal  0.545211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.77 
 
 
1234 aa  244  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.62 
 
 
1234 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0918971  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4568  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.55 
 
 
1263 aa  243  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2547  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.73 
 
 
1198 aa  243  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.789149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2932  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.73 
 
 
1198 aa  243  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3007  exonuclease V subunit beta  30.02 
 
 
1189 aa  243  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2171  Exodeoxyribonuclease V  25.65 
 
 
1152 aa  240  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0735  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.09 
 
 
2007 aa  239  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1215  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.01 
 
 
1235 aa  238  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.513189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1188  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.91 
 
 
1235 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.513756  normal  0.625115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.28 
 
 
1223 aa  231  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2768  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.62 
 
 
1286 aa  230  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55670  exodeoxyribonuclease V beta chain  32.06 
 
 
1245 aa  230  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.80629  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2088  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.99 
 
 
1236 aa  226  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>