More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1391 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1391  putative recombination protein RecB  100 
 
 		 923 aa  1853    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  38.5 
 
 		 933 aa  589  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  38.22 
 
 		 939 aa  560  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  36.94 
 
 		 921 aa  510  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  36.47 
 
 		 921 aa  495  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  36.74 
 
 		 921 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  36.54 
 
 		 921 aa  488  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  34.67 
 
 		 915 aa  439  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  31.44 
 
 		 907 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  32.44 
 
 		 903 aa  384  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  23.25 
 
 		 1152 aa  118  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  25.93 
 
 		 1087 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.95 
 
 		 1089 aa  110  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 1052 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  24.13 
 
 		 1182 aa  107  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3578  UvrD/REP helicase  23.15 
 
 		 995 aa  107  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4180  Exodeoxyribonuclease V  22.12 
 
 		 1073 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0648836 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1561  UvrD/REP helicase  27.05 
 
 		 1054 aa  102  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0914  hypothetical protein  25.05 
 
 		 913 aa  101  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.230756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  24.35 
 
 		 1060 aa  99.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 		 1196 aa  99.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.56 
 
 		 1086 aa  98.6  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  25.45 
 
 		 1147 aa  97.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  24.21 
 
 		 1054 aa  96.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  23.8 
 
 		 1080 aa  94  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  25.05 
 
 		 1095 aa  92.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.27 
 
 		 1067 aa  89  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1136  UvrD/REP helicase  22.14 
 
 		 1112 aa  88.6  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0229402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  24.35 
 
 		 1184 aa  87.4  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  37.58 
 
 		 1147 aa  85.5  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  25.17 
 
 		 1149 aa  82.4  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2072  UvrD/REP helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1102 aa  81.3  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1160  UvrD/REP helicase  25.3 
 
 		 1064 aa  80.5  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.737588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  29.44 
 
 		 1101 aa  79.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  24.39 
 
 		 1061 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  29.44 
 
 		 1101 aa  79  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  36.5 
 
 		 1183 aa  78.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.5 
 
 		 860 aa  78.2  0.0000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  32.87 
 
 		 1106 aa  78.2  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  24.79 
 
 		 643 aa  77.8  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  40 
 
 		 1076 aa  77.4  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  29.05 
 
 		 1140 aa  77  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  33.1 
 
 		 1173 aa  77  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.55 
 
 		 1139 aa  76.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0644  UvrD/REP helicase  29.17 
 
 		 1109 aa  77  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  33.79 
 
 		 1106 aa  76.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.49 
 
 		 1200 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  35.33 
 
 		 1110 aa  77  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  37.86 
 
 		 1183 aa  75.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  40 
 
 		 1076 aa  75.5  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0929  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24 
 
 		 1216 aa  75.1  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  26.68 
 
 		 1207 aa  74.7  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  31.85 
 
 		 1185 aa  74.7  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  34.67 
 
 		 1110 aa  74.3  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  28.96 
 
 		 1089 aa  73.9  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1797  Exodeoxyribonuclease V  21.74 
 
 		 1120 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00119316  normal  0.701381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  35.77 
 
 		 1142 aa  74.3  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0979  UvrD/REP helicase  38.05 
 
 		 1173 aa  73.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.156033  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  26.74 
 
 		 1124 aa  72.8  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  39.25 
 
 		 1196 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  37.6 
 
 		 1121 aa  72.4  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  32.92 
 
 		 1156 aa  72  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  33.1 
 
 		 1119 aa  72  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  23.95 
 
 		 1240 aa  72  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  36.02 
 
 		 1036 aa  72  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.29 
 
 		 1155 aa  72  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  30.46 
 
 		 1173 aa  71.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  29.47 
 
 		 1166 aa  71.6  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  27.05 
 
 		 826 aa  71.2  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  44.71 
 
 		 1168 aa  71.2  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  34.59 
 
 		 1180 aa  70.5  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  34.59 
 
 		 1180 aa  70.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.05 
 
 		 816 aa  70.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  31.72 
 
 		 1189 aa  70.5  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  30.46 
 
 		 1173 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  25.7 
 
 		 1161 aa  70.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1177 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2547  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.94 
 
 		 1198 aa  70.1  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.789149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2932  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.94 
 
 		 1198 aa  70.1  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 		 793 aa  70.1  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  33.59 
 
 		 1187 aa  70.1  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1751  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.65 
 
 		 1129 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.910924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0252  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.59 
 
 		 1111 aa  70.1  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103947  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1560  UvrD/REP helicase  24.62 
 
 		 1054 aa  70.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.538348  normal  0.490234 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  36.28 
 
 		 1397 aa  69.3  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  31.72 
 
 		 1120 aa  69.3  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.35 
 
 		 1183 aa  69.3  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5331  UvrD/REP helicase  27.23 
 
 		 822 aa  68.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0764  UvrD/REP helicase  22.75 
 
 		 1161 aa  68.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  32.76 
 
 		 1164 aa  68.6  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.46 
 
 		 1168 aa  68.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  32.56 
 
 		 1155 aa  68.6  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  35.66 
 
 		 1132 aa  68.6  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.43 
 
 		 1203 aa  68.6  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  29.8 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  37.68 
 
 		 666 aa  68.2  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1714  UvrD/REP helicase  22.75 
 
 		 948 aa  68.6  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  29.8 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  37.59 
 
 		 1187 aa  68.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  35.4 
 
 		 1047 aa  68.6  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>