More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3578 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3578  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 995 aa  1948    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  35.13 
 
 		 1036 aa  544  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0495  UvrD/REP helicase  29.55 
 
 		 981 aa  275  3e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  25.66 
 
 		 921 aa  144  8e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  24.8 
 
 		 903 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1076 aa  118  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1136  UvrD/REP helicase  22.92 
 
 		 1112 aa  112  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0229402 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  24.93 
 
 		 1060 aa  108  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1391  putative recombination protein RecB  23.15 
 
 		 923 aa  107  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  26.08 
 
 		 1054 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  22.08 
 
 		 1110 aa  100  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  20.64 
 
 		 1146 aa  100  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  22.08 
 
 		 1110 aa  100  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  20.61 
 
 		 1132 aa  99  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.42 
 
 		 1200 aa  98.6  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0979  UvrD/REP helicase  25.42 
 
 		 1173 aa  95.9  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.156033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  25.92 
 
 		 921 aa  95.5  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  22.01 
 
 		 1152 aa  95.1  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1076 aa  94  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 1052 aa  94.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0764  UvrD/REP helicase  24.02 
 
 		 1161 aa  93.6  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  21.65 
 
 		 678 aa  92.8  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  24.87 
 
 		 939 aa  92  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  26.88 
 
 		 915 aa  92  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.37 
 
 		 1067 aa  91.3  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  22.75 
 
 		 933 aa  90.5  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  19.08 
 
 		 1155 aa  88.2  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  21.71 
 
 		 1147 aa  87.4  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  18.93 
 
 		 1118 aa  86.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1061 aa  85.5  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  26.13 
 
 		 1124 aa  85.5  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  23.65 
 
 		 907 aa  85.1  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  23.79 
 
 		 666 aa  84  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.71 
 
 		 751 aa  83.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0968  UvrD/REP helicase  26 
 
 		 706 aa  82.8  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  25.1 
 
 		 722 aa  82.8  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.71 
 
 		 751 aa  82  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1797  Exodeoxyribonuclease V  23.66 
 
 		 1120 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00119316  normal  0.701381 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  22.96 
 
 		 1218 aa  80.1  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.69 
 
 		 1203 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0007  exodeoxyribonuclease V, beta chain, putative  22.95 
 
 		 1026 aa  79.7  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  21.09 
 
 		 1241 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  27.49 
 
 		 754 aa  79  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  21.09 
 
 		 1241 aa  78.2  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  22.06 
 
 		 1182 aa  78.2  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  20.92 
 
 		 1168 aa  77.8  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  23.19 
 
 		 833 aa  77.8  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3000  UvrD/REP helicase  22.49 
 
 		 731 aa  77  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.120838 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  25 
 
 		 1217 aa  77.4  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  21.07 
 
 		 1241 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.26 
 
 		 1199 aa  77  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  20.98 
 
 		 1241 aa  77  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  24.32 
 
 		 705 aa  77  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  20.98 
 
 		 1241 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  20.52 
 
 		 1117 aa  76.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  20.98 
 
 		 1241 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  24.51 
 
 		 1121 aa  76.3  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  22.55 
 
 		 656 aa  75.9  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  20.08 
 
 		 1182 aa  75.5  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1403  UvrD/REP helicase  25.22 
 
 		 900 aa  75.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405797  normal  0.0281555 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0163  UvrD/REP helicase  22.84 
 
 		 695 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2905  UvrD/REP helicase  22.84 
 
 		 695 aa  75.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306179  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0150  UvrD/REP helicase  22.84 
 
 		 695 aa  75.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  22.64 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  20.79 
 
 		 1240 aa  75.1  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  23.86 
 
 		 1095 aa  75.1  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3742  UvrD/REP helicase  22.53 
 
 		 1142 aa  74.7  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.404574  normal  0.909717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  23.11 
 
 		 1187 aa  74.3  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  20.87 
 
 		 1241 aa  74.3  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12101  UvrD/REP helicase subunit B  26.11 
 
 		 1208 aa  74.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  20.87 
 
 		 1241 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  20.87 
 
 		 1241 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  19.65 
 
 		 1110 aa  74.3  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0149  UvrD/REP helicase  22.43 
 
 		 695 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  21.41 
 
 		 1073 aa  73.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  20.85 
 
 		 1242 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0146  UvrD/REP helicase  22.79 
 
 		 721 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728084  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3329  UvrD/REP helicase  22.59 
 
 		 695 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544954  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  19.23 
 
 		 1155 aa  73.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0467  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.16 
 
 		 907 aa  73.2  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2005  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.83 
 
 		 1155 aa  73.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  23.18 
 
 		 665 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0137  UvrD/REP helicase  22.43 
 
 		 695 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.67 
 
 		 785 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4180  Exodeoxyribonuclease V  36.04 
 
 		 1073 aa  73.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0648836 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5176  UvrD/REP helicase  23.04 
 
 		 573 aa  73.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1511  UvrD/REP helicase  23.04 
 
 		 573 aa  73.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.487565 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1561  UvrD/REP helicase  21.99 
 
 		 1054 aa  72.8  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3206  UvrD/REP helicase  20.46 
 
 		 1290 aa  72.8  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.93 
 
 		 1203 aa  73.2  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.4 
 
 		 1197 aa  72  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  21.3 
 
 		 1089 aa  72  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  22.79 
 
 		 1204 aa  72  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1050  UvrD/REP helicase  24.26 
 
 		 597 aa  71.6  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  22.13 
 
 		 1089 aa  71.2  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1416  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.47 
 
 		 664 aa  71.2  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2171  Exodeoxyribonuclease V  22.19 
 
 		 1152 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1160  UvrD/REP helicase  20.63 
 
 		 1064 aa  70.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.737588 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.85 
 
 		 1208 aa  70.5  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0953517  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  22.43 
 
 		 1196 aa  70.5  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>