More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1403 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2352  UvrD/REP helicase  63.55 
 
 		 920 aa  1081    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1403  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 900 aa  1773    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405797  normal  0.0281555 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  29.95 
 
 		 1080 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  26.5 
 
 		 733 aa  151  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  23.99 
 
 		 1074 aa  140  7.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  31.36 
 
 		 1184 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 700 aa  137  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  24.11 
 
 		 666 aa  136  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  27.49 
 
 		 771 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.25 
 
 		 765 aa  134  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  22.29 
 
 		 1065 aa  133  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  26.07 
 
 		 742 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  27.8 
 
 		 648 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  27.8 
 
 		 648 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.79 
 
 		 730 aa  131  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.79 
 
 		 730 aa  131  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.58 
 
 		 730 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.4 
 
 		 729 aa  130  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.3 
 
 		 743 aa  127  9e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  27.3 
 
 		 738 aa  127  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.25 
 
 		 729 aa  127  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  31.63 
 
 		 715 aa  126  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  23.92 
 
 		 706 aa  127  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  25.88 
 
 		 696 aa  126  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.97 
 
 		 738 aa  126  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  28.6 
 
 		 797 aa  126  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.72 
 
 		 817 aa  126  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  27.19 
 
 		 738 aa  125  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  29.33 
 
 		 816 aa  124  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4251  UvrD/REP helicase  24.93 
 
 		 715 aa  124  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  26.02 
 
 		 732 aa  124  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.43 
 
 		 754 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  25.94 
 
 		 731 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.22 
 
 		 751 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  26.43 
 
 		 754 aa  123  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  24.34 
 
 		 678 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.22 
 
 		 751 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  22.29 
 
 		 1130 aa  122  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.88 
 
 		 773 aa  122  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  26.47 
 
 		 741 aa  122  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  29.42 
 
 		 1117 aa  121  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.83 
 
 		 1130 aa  121  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  24.51 
 
 		 1149 aa  121  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.78 
 
 		 1129 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.1 
 
 		 662 aa  120  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  27.52 
 
 		 707 aa  120  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  31.25 
 
 		 833 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.64 
 
 		 802 aa  119  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  28.66 
 
 		 1147 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 798 aa  119  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.17 
 
 		 731 aa  119  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  25.74 
 
 		 726 aa  119  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.49 
 
 		 797 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.26 
 
 		 814 aa  118  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 		 1183 aa  118  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0340  UvrD/REP helicase  23.83 
 
 		 951 aa  118  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  25.25 
 
 		 672 aa  117  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  26.79 
 
 		 739 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.27 
 
 		 1023 aa  117  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  25.8 
 
 		 688 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  23.21 
 
 		 715 aa  115  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.71 
 
 		 742 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.99 
 
 		 719 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  21.67 
 
 		 1121 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.36 
 
 		 747 aa  114  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 795 aa  114  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  23.75 
 
 		 638 aa  114  7.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  27.16 
 
 		 728 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  25.88 
 
 		 714 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  27.37 
 
 		 1226 aa  114  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  24.58 
 
 		 714 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  29.7 
 
 		 1047 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.85 
 
 		 737 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.34 
 
 		 831 aa  114  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  25.37 
 
 		 630 aa  114  9e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1084  UvrD/REP helicase  27.6 
 
 		 789 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.21 
 
 		 1139 aa  113  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.77 
 
 		 759 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  26.29 
 
 		 762 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 795 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  23.67 
 
 		 770 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  23.68 
 
 		 783 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  26.29 
 
 		 787 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.53 
 
 		 838 aa  112  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.66 
 
 		 833 aa  112  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  27.45 
 
 		 799 aa  112  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.95 
 
 		 786 aa  112  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  28.24 
 
 		 790 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.36 
 
 		 725 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.8 
 
 		 817 aa  112  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3984  UvrD/REP helicase  29.65 
 
 		 1111 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.3 
 
 		 711 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  23.22 
 
 		 630 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  24.88 
 
 		 816 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.18 
 
 		 753 aa  112  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.18 
 
 		 753 aa  111  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.38 
 
 		 858 aa  111  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  26.91 
 
 		 728 aa  111  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  27.08 
 
 		 721 aa  111  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.83 
 
 		 741 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>