More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1160 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1160  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1064 aa  2164    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.737588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  40.85 
 
 		 1061 aa  738    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1560  UvrD/REP helicase  52.99 
 
 		 1054 aa  1100    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.538348  normal  0.490234 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4011  UvrD/REP helicase  31.86 
 
 		 1083 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05980  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  28.6 
 
 		 1104 aa  260  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.061722  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5440  UvrD/REP helicase  27.38 
 
 		 1051 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  28.59 
 
 		 833 aa  157  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  23.86 
 
 		 1204 aa  150  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  23.44 
 
 		 1161 aa  137  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  26.14 
 
 		 1147 aa  135  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  21.9 
 
 		 1121 aa  129  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  24.05 
 
 		 1207 aa  122  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  24.35 
 
 		 1149 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  23.65 
 
 		 1282 aa  117  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0419  UvrD/REP helicase  23.3 
 
 		 1003 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 1115 aa  116  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  24.89 
 
 		 1156 aa  114  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.5 
 
 		 1230 aa  112  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  22.46 
 
 		 1218 aa  112  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1061 aa  112  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.66 
 
 		 1168 aa  109  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.17 
 
 		 1156 aa  109  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  23.44 
 
 		 1217 aa  107  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  25.43 
 
 		 1117 aa  107  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.77 
 
 		 1186 aa  107  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1057 aa  105  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  24.74 
 
 		 1124 aa  105  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  22.68 
 
 		 1065 aa  102  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  21.87 
 
 		 1244 aa  102  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  24.61 
 
 		 1125 aa  102  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  25.42 
 
 		 1182 aa  101  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.76 
 
 		 1241 aa  97.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.75 
 
 		 1207 aa  97.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0579  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.56 
 
 		 1085 aa  96.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.6 
 
 		 1241 aa  95.9  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1757  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.31 
 
 		 1320 aa  96.3  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  24.24 
 
 		 1180 aa  95.5  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.37 
 
 		 737 aa  95.1  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  26.58 
 
 		 1123 aa  95.1  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.63 
 
 		 1240 aa  95.1  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  23.6 
 
 		 1241 aa  94.7  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  23.6 
 
 		 1241 aa  94.7  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.43 
 
 		 1241 aa  94.7  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  24.38 
 
 		 1242 aa  95.1  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  24.64 
 
 		 1240 aa  94.7  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.48 
 
 		 1139 aa  94.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.6 
 
 		 1241 aa  94.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2171  Exodeoxyribonuclease V  22.81 
 
 		 1152 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  28.6 
 
 		 1142 aa  94.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  25.24 
 
 		 1161 aa  93.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.4 
 
 		 1241 aa  93.6  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  25.64 
 
 		 1106 aa  92.8  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.6 
 
 		 1241 aa  92.8  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  25.3 
 
 		 1180 aa  93.2  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  23.72 
 
 		 1241 aa  92.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.89 
 
 		 758 aa  92.4  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1797  Exodeoxyribonuclease V  25.83 
 
 		 1120 aa  92  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00119316  normal  0.701381 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  25.3 
 
 		 1180 aa  92  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  27.22 
 
 		 1131 aa  91.7  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.48 
 
 		 741 aa  91.3  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.16 
 
 		 1251 aa  90.9  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  25.19 
 
 		 1164 aa  91.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1693  Exodeoxyribonuclease V  25.32 
 
 		 1125 aa  90.9  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  26.32 
 
 		 1110 aa  90.9  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.85 
 
 		 1203 aa  90.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  24.11 
 
 		 1202 aa  90.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.28 
 
 		 725 aa  90.1  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.43 
 
 		 772 aa  89.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.31 
 
 		 732 aa  89.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  22.85 
 
 		 1130 aa  89.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  21.61 
 
 		 1270 aa  89.4  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.34 
 
 		 715 aa  89  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.81 
 
 		 1244 aa  89  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.61 
 
 		 751 aa  89  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  26.3 
 
 		 709 aa  88.2  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 		 709 aa  88.2  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.22 
 
 		 730 aa  88.2  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  24.78 
 
 		 1121 aa  88.2  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.22 
 
 		 730 aa  88.2  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  25.74 
 
 		 723 aa  88.2  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.58 
 
 		 730 aa  88.2  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.35 
 
 		 729 aa  87.4  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.36 
 
 		 1130 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 1120 aa  87.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  24.34 
 
 		 1162 aa  87.4  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  24.04 
 
 		 1392 aa  87.4  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.42 
 
 		 751 aa  87.4  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  28.33 
 
 		 805 aa  87.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  25.09 
 
 		 1155 aa  87.8  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.33 
 
 		 805 aa  86.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.88 
 
 		 1200 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  27.06 
 
 		 1047 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  24.63 
 
 		 845 aa  86.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 1073 aa  85.9  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  27.13 
 
 		 768 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  23.19 
 
 		 1248 aa  86.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  24.71 
 
 		 726 aa  86.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.5 
 
 		 1200 aa  85.9  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  25.74 
 
 		 705 aa  85.5  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  24.43 
 
 		 724 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>