More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0644 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0644  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1109 aa  2214    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1561  UvrD/REP helicase  28.02 
 
 		 1054 aa  293  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1391  putative recombination protein RecB  22.52 
 
 		 923 aa  134  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  25.52 
 
 		 1156 aa  116  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0468  UvrD/REP helicase  26.22 
 
 		 1134 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  27.41 
 
 		 939 aa  112  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  27.18 
 
 		 1147 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  26.39 
 
 		 915 aa  109  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0979  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 1173 aa  107  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.156033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  28.33 
 
 		 1118 aa  100  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  28.33 
 
 		 1157 aa  99.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  29.45 
 
 		 933 aa  96.7  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.95 
 
 		 1156 aa  95.5  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  25.5 
 
 		 1124 aa  95.1  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  27.4 
 
 		 1087 aa  94.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  23.13 
 
 		 921 aa  93.6  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  25.35 
 
 		 1125 aa  91.7  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  25.38 
 
 		 1208 aa  91.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  28.8 
 
 		 1185 aa  89.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  23.32 
 
 		 1060 aa  89.4  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.25 
 
 		 1183 aa  89.4  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  35 
 
 		 1164 aa  88.6  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  26.44 
 
 		 1187 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  27.66 
 
 		 1152 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  26.95 
 
 		 1161 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  23.48 
 
 		 1052 aa  86.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  23.57 
 
 		 921 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  24.38 
 
 		 1054 aa  83.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  26.15 
 
 		 1162 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  22.67 
 
 		 1155 aa  82.8  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  28.57 
 
 		 921 aa  82.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  28.11 
 
 		 921 aa  82.4  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  41.35 
 
 		 903 aa  82.4  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  38.85 
 
 		 1106 aa  82.4  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4180  Exodeoxyribonuclease V  25.36 
 
 		 1073 aa  81.3  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0648836 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  27.91 
 
 		 1147 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  38.68 
 
 		 1089 aa  80.9  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  24.27 
 
 		 1146 aa  80.1  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  39.58 
 
 		 1106 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  39.23 
 
 		 1189 aa  80.1  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  27.91 
 
 		 1147 aa  80.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2005  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.21 
 
 		 1155 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3622  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.25 
 
 		 1135 aa  79.7  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  32.45 
 
 		 1121 aa  79.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  27.12 
 
 		 1132 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  26.8 
 
 		 1165 aa  79.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1797  Exodeoxyribonuclease V  25.25 
 
 		 1120 aa  79.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00119316  normal  0.701381 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  32.45 
 
 		 854 aa  79  0.0000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 		 1164 aa  79  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  38.46 
 
 		 1182 aa  79  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  27.47 
 
 		 1202 aa  78.2  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  35.76 
 
 		 1119 aa  78.2  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  24.36 
 
 		 1196 aa  78.2  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  37.27 
 
 		 1167 aa  77.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  25.77 
 
 		 1159 aa  77.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  25.65 
 
 		 1183 aa  77.4  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  40.95 
 
 		 907 aa  77.8  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.45 
 
 		 1139 aa  77  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  27.95 
 
 		 1147 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  27.86 
 
 		 1161 aa  77  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0467  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.83 
 
 		 907 aa  75.5  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  40.29 
 
 		 1173 aa  75.5  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  21.92 
 
 		 1036 aa  75.1  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  27.94 
 
 		 1157 aa  74.7  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  22.74 
 
 		 1236 aa  74.7  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  34.25 
 
 		 1151 aa  74.3  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  40.15 
 
 		 1177 aa  74.3  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.33 
 
 		 860 aa  73.9  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  23.03 
 
 		 1121 aa  74.3  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  38.28 
 
 		 1155 aa  73.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1136  UvrD/REP helicase  24.9 
 
 		 1112 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0229402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  39.57 
 
 		 1173 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 		 1168 aa  73.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.96 
 
 		 1199 aa  73.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  35.38 
 
 		 1183 aa  73.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4671  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.98 
 
 		 1224 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828259 
 
 
-
 
NC_002950  PG2072  UvrD/REP helicase domain-containing protein  34.81 
 
 		 1102 aa  72.8  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  37.21 
 
 		 1180 aa  72.4  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.23 
 
 		 1269 aa  72  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  37.21 
 
 		 1180 aa  72.4  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.17 
 
 		 1226 aa  72  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  35.95 
 
 		 1120 aa  71.6  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.47 
 
 		 1240 aa  71.6  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0764  UvrD/REP helicase  26.94 
 
 		 1161 aa  71.6  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3578  UvrD/REP helicase  27.09 
 
 		 995 aa  70.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  39.83 
 
 		 1076 aa  70.1  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1751  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.71 
 
 		 1129 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.910924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  31.98 
 
 		 1157 aa  70.1  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  39.83 
 
 		 1076 aa  69.7  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.84 
 
 		 1226 aa  69.7  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4537  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.22 
 
 		 1224 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.227788  normal  0.354601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  36.04 
 
 		 1177 aa  67.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  36.05 
 
 		 1180 aa  67  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  37.23 
 
 		 1140 aa  67  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  37.5 
 
 		 1166 aa  67  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  22.85 
 
 		 1217 aa  67  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05321  ATP-dependent DNA helicase II protein  32.45 
 
 		 710 aa  66.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1401  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.72 
 
 		 1221 aa  66.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  32.82 
 
 		 1397 aa  66.2  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  38.83 
 
 		 1067 aa  65.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>