More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3362 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  100 
 
 		 630 aa  1298    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0754  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.37 
 
 		 587 aa  387  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.643559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1845  UvrD/REP helicase  36.35 
 
 		 620 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  30.24 
 
 		 726 aa  216  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  29.65 
 
 		 762 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  29.19 
 
 		 738 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  29.76 
 
 		 746 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.45 
 
 		 1023 aa  210  5e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  28.94 
 
 		 728 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.04 
 
 		 765 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  28.79 
 
 		 728 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  28.66 
 
 		 738 aa  207  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  28.45 
 
 		 743 aa  207  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.66 
 
 		 738 aa  207  6e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  28.96 
 
 		 722 aa  207  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  28.96 
 
 		 722 aa  207  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  28.46 
 
 		 720 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  28.81 
 
 		 722 aa  206  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.01 
 
 		 737 aa  206  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.37 
 
 		 768 aa  206  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  28.46 
 
 		 720 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  28.46 
 
 		 720 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  28.46 
 
 		 720 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  28.46 
 
 		 720 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  29.56 
 
 		 720 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  28.59 
 
 		 722 aa  206  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.28 
 
 		 786 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  29 
 
 		 625 aa  204  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  28.04 
 
 		 737 aa  204  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  28.81 
 
 		 722 aa  204  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  28.96 
 
 		 721 aa  204  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  28.38 
 
 		 720 aa  203  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  28.4 
 
 		 722 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  28.4 
 
 		 722 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  28.96 
 
 		 721 aa  203  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  28.4 
 
 		 722 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  29.47 
 
 		 720 aa  203  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  28.38 
 
 		 720 aa  203  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  28.38 
 
 		 720 aa  203  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  28.4 
 
 		 722 aa  203  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  28.38 
 
 		 720 aa  203  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  28.38 
 
 		 720 aa  203  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  28.38 
 
 		 720 aa  203  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  26.79 
 
 		 786 aa  203  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  28.38 
 
 		 720 aa  203  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  28.38 
 
 		 720 aa  203  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.92 
 
 		 762 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  27.85 
 
 		 726 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  27.84 
 
 		 727 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  29.6 
 
 		 720 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  27.35 
 
 		 724 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.59 
 
 		 755 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  29.19 
 
 		 727 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.75 
 
 		 729 aa  201  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  28.23 
 
 		 720 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  28.27 
 
 		 729 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  29.33 
 
 		 900 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  27.78 
 
 		 723 aa  201  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  27.84 
 
 		 726 aa  200  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.89 
 
 		 817 aa  200  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  29.47 
 
 		 707 aa  200  7.999999999999999e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  29.32 
 
 		 720 aa  199  9e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  28.21 
 
 		 723 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.23 
 
 		 773 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  28.89 
 
 		 735 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.87 
 
 		 729 aa  199  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  29.14 
 
 		 726 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.72 
 
 		 858 aa  199  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  27.2 
 
 		 724 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  28.46 
 
 		 721 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.3 
 
 		 785 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.89 
 
 		 747 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  28.27 
 
 		 730 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  29.32 
 
 		 721 aa  197  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.83 
 
 		 787 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  28.66 
 
 		 721 aa  197  6e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.66 
 
 		 754 aa  197  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.94 
 
 		 741 aa  197  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  27.95 
 
 		 720 aa  197  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  27.97 
 
 		 728 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  29.1 
 
 		 721 aa  196  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  27.97 
 
 		 728 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  28.74 
 
 		 726 aa  196  8.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.06 
 
 		 838 aa  196  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.66 
 
 		 806 aa  196  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.19 
 
 		 751 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  29.19 
 
 		 753 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  28.96 
 
 		 727 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  28.04 
 
 		 744 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  28.17 
 
 		 717 aa  196  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.19 
 
 		 751 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.83 
 
 		 763 aa  196  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.69 
 
 		 795 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.19 
 
 		 747 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.15 
 
 		 759 aa  195  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  29.19 
 
 		 751 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  28.4 
 
 		 723 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.62 
 
 		 730 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  27.65 
 
 		 734 aa  195  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.62 
 
 		 730 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>