More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2560 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  100 
 
 		 520 aa  1053    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0039  UvrD/REP helicase  42.69 
 
 		 599 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.830062  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5487  putative ATP-dependent DNA helicase Rep  42.66 
 
 		 591 aa  360  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1645  UvrD/REP helicase  42.04 
 
 		 606 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.417198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3407  UvrD/REP helicase  40.98 
 
 		 604 aa  332  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0218597  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.49 
 
 		 759 aa  126  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  28.98 
 
 		 1032 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.76 
 
 		 754 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  29.19 
 
 		 736 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.1 
 
 		 671 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  28.49 
 
 		 770 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.83 
 
 		 738 aa  120  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 845 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 738 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  28.69 
 
 		 738 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  28.73 
 
 		 681 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  28.53 
 
 		 759 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.78 
 
 		 674 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  26.76 
 
 		 722 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  27.85 
 
 		 666 aa  118  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.35 
 
 		 741 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.04 
 
 		 730 aa  117  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.04 
 
 		 730 aa  117  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 508 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.57 
 
 		 745 aa  116  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.57 
 
 		 768 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.72 
 
 		 658 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.42 
 
 		 730 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  32.09 
 
 		 674 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.48 
 
 		 729 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  25.27 
 
 		 735 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4038  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.59 
 
 		 673 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.26 
 
 		 751 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  27.52 
 
 		 757 aa  115  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0507  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.59 
 
 		 673 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0177061  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  24.93 
 
 		 648 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  30.85 
 
 		 1132 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  26.32 
 
 		 751 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  24.93 
 
 		 648 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.46 
 
 		 751 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0175  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.59 
 
 		 673 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.13 
 
 		 675 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  29.11 
 
 		 671 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.66 
 
 		 757 aa  113  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  27.96 
 
 		 721 aa  113  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.67 
 
 		 671 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.53 
 
 		 674 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.87 
 
 		 640 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4207  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.13 
 
 		 673 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0352  UvrD/REP helicase  29.62 
 
 		 709 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.877458  normal  0.0118212 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  24.93 
 
 		 731 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0070  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.14 
 
 		 671 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0795  UvrD/REP helicase  28.47 
 
 		 639 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.790736  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  27.96 
 
 		 721 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  29.05 
 
 		 671 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4475  UvrD/REP helicase  28.02 
 
 		 689 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  27.52 
 
 		 653 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.15 
 
 		 662 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.01 
 
 		 849 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  26.15 
 
 		 662 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.12 
 
 		 658 aa  110  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.51 
 
 		 715 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4007  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.83 
 
 		 673 aa  110  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00646067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.45 
 
 		 682 aa  110  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  28.96 
 
 		 726 aa  110  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  28.83 
 
 		 1075 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  28.39 
 
 		 685 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.25 
 
 		 747 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  27.63 
 
 		 658 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.02 
 
 		 732 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.75 
 
 		 669 aa  109  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  27.7 
 
 		 689 aa  108  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2555  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.95 
 
 		 671 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4154  UvrD/REP helicase  31.12 
 
 		 545 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874139 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4199  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.01 
 
 		 673 aa  108  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3994  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.01 
 
 		 673 aa  108  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  26.2 
 
 		 724 aa  108  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4225  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.01 
 
 		 673 aa  108  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4142  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.01 
 
 		 673 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.76 
 
 		 794 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03656  DNA helicase and single-stranded DNA-dependent ATPase  29.01 
 
 		 673 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0354982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03605  hypothetical protein  29.01 
 
 		 673 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  25.93 
 
 		 625 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.08 
 
 		 699 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.01 
 
 		 674 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  26.68 
 
 		 717 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  26.84 
 
 		 714 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4288  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.01 
 
 		 673 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 668 aa  107  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  26.04 
 
 		 620 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06510  ATP-dependent DNA helicase pcra, putative  27.92 
 
 		 982 aa  107  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.23 
 
 		 677 aa  107  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.23 
 
 		 795 aa  107  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  28.23 
 
 		 677 aa  107  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4242  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.01 
 
 		 674 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.907548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.62 
 
 		 670 aa  107  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4301  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.01 
 
 		 674 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4139  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.01 
 
 		 674 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4124  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.01 
 
 		 707 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5211  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.01 
 
 		 673 aa  106  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>