More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003290 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  100 
 
 		 634 aa  1301    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  49.52 
 
 		 627 aa  566  1e-160  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0682  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.28 
 
 		 634 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2792  DNA helicase II  32.52 
 
 		 585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.336571 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4971  DNA helicase II  32.52 
 
 		 585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3656  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.52 
 
 		 637 aa  165  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.317383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4220  hypothetical protein  25.55 
 
 		 628 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2850  hypothetical protein  25.42 
 
 		 579 aa  150  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5468  pathogenesis-related protein  24.82 
 
 		 639 aa  146  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6475  hypothetical protein  31.61 
 
 		 628 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.574703  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2418  putative ATP-dependent DNA helicase  30 
 
 		 622 aa  134  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.197345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0295  hypothetical protein  32.6 
 
 		 629 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3888  hypothetical protein  30.05 
 
 		 631 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0207  hypothetical protein  27.75 
 
 		 578 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1438  pathogenesis-related protein  28.57 
 
 		 650 aa  123  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0692667  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1801  hypothetical protein  31.01 
 
 		 625 aa  123  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3806  DNA helicase II  27.67 
 
 		 588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939631  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60080  hypothetical protein  28.61 
 
 		 643 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581559  hitchhiker  0.0000000248833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2719  pathogenesis-related protein  25.54 
 
 		 639 aa  91.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4906  pathogenesis-related protein  27.12 
 
 		 649 aa  89.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.827624  normal  0.119775 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0596  hypothetical protein  31.6 
 
 		 707 aa  87.8  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.86 
 
 		 785 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3186  UvrD/REP helicase  21.87 
 
 		 603 aa  71.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.985169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  26.5 
 
 		 706 aa  70.1  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  25.99 
 
 		 726 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  28.07 
 
 		 681 aa  66.6  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1515  UvrD/REP helicase  22.47 
 
 		 575 aa  64.7  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0347716  hitchhiker  2.10005e-16 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  29.34 
 
 		 689 aa  64.7  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  22.8 
 
 		 625 aa  65.1  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1050  UvrD/REP helicase  25.86 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.55 
 
 		 730 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 742 aa  63.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  28.36 
 
 		 682 aa  63.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  23.36 
 
 		 520 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.04 
 
 		 662 aa  62.4  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  26.55 
 
 		 736 aa  63.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  23.84 
 
 		 726 aa  62.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.58 
 
 		 755 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 730 aa  62  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  26.74 
 
 		 739 aa  62  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 730 aa  62  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2458  UvrD/REP helicase  26.24 
 
 		 586 aa  62  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411519  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.69 
 
 		 729 aa  61.6  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.35 
 
 		 757 aa  61.6  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  25.97 
 
 		 659 aa  61.2  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2355  hypothetical protein  27.41 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  25.69 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 744 aa  60.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.31 
 
 		 732 aa  60.8  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  28.47 
 
 		 723 aa  60.1  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  24.16 
 
 		 671 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.78 
 
 		 671 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 659 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  24.16 
 
 		 671 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.16 
 
 		 751 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.57 
 
 		 689 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  25.99 
 
 		 678 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  24.03 
 
 		 678 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.21 
 
 		 756 aa  58.9  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.08 
 
 		 747 aa  58.9  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.26 
 
 		 753 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.16 
 
 		 672 aa  58.9  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  24.8 
 
 		 807 aa  58.9  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  23.47 
 
 		 778 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.16 
 
 		 751 aa  58.9  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.2 
 
 		 817 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.26 
 
 		 753 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.26 
 
 		 747 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.26 
 
 		 751 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  25.26 
 
 		 753 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  25.26 
 
 		 751 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.37 
 
 		 741 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.26 
 
 		 751 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.26 
 
 		 751 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  24.35 
 
 		 770 aa  58.5  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  24.9 
 
 		 620 aa  58.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  25.99 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.26 
 
 		 747 aa  58.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.18 
 
 		 663 aa  57.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  26.12 
 
 		 742 aa  57.4  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  26.55 
 
 		 726 aa  57  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.31 
 
 		 759 aa  56.6  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.9 
 
 		 737 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.73 
 
 		 685 aa  57  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  24.01 
 
 		 663 aa  57  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  23.92 
 
 		 772 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.05 
 
 		 725 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.05 
 
 		 718 aa  56.2  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  25 
 
 		 743 aa  56.2  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.37 
 
 		 658 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  25.84 
 
 		 735 aa  55.8  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0055  UvrD/REP helicase  23.79 
 
 		 1112 aa  56.2  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.73 
 
 		 670 aa  56.2  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.81 
 
 		 758 aa  55.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  23.69 
 
 		 1050 aa  55.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  24.3 
 
 		 723 aa  55.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  26.01 
 
 		 658 aa  55.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10120  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.67 
 
 		 841 aa  55.5  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454031 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.35 
 
 		 858 aa  55.5  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.16 
 
 		 672 aa  55.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>