More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1515 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1515  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 575 aa  1172    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0347716  hitchhiker  2.10005e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4163  UvrD/REP helicase  43.67 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.533051  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3055  UvrD/REP helicase  37.62 
 
 		 608 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3048  UvrD/REP helicase  37.62 
 
 		 608 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0267526  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3186  UvrD/REP helicase  35.93 
 
 		 603 aa  364  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.985169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0672  UvrD/REP helicase  35.71 
 
 		 595 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0183847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2458  UvrD/REP helicase  29.56 
 
 		 586 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411519  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0546  UvrD/REP helicase  28.62 
 
 		 569 aa  203  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  24.56 
 
 		 666 aa  97.8  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  26.18 
 
 		 715 aa  90.1  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 1032 aa  88.6  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0661  UvrD/REP helicase  28.03 
 
 		 708 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0795  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 		 639 aa  85.1  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.790736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  27.38 
 
 		 809 aa  80.9  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.08 
 
 		 743 aa  80.1  0.00000000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  25.51 
 
 		 678 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  23.22 
 
 		 706 aa  79.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  25 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  26.34 
 
 		 793 aa  77.8  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  26.47 
 
 		 1075 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  26.62 
 
 		 726 aa  77.8  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1133  UvrD/REP helicase  27.02 
 
 		 688 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 757 aa  77.4  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  25.54 
 
 		 1082 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0968  UvrD/REP helicase  23.48 
 
 		 706 aa  77  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25 
 
 		 726 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  22.86 
 
 		 668 aa  77  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  21.25 
 
 		 696 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4063  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  28.92 
 
 		 688 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4279  UvrD/REP helicase  20.07 
 
 		 556 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  26.22 
 
 		 783 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  27 
 
 		 735 aa  76.3  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1279  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  28.22 
 
 		 688 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1307  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  28.22 
 
 		 688 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000490806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1146  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.22 
 
 		 688 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  24.45 
 
 		 682 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1384  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  28.22 
 
 		 688 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00158737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1346  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.22 
 
 		 688 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1127  ATP-dependent DNA helicase  28.22 
 
 		 688 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  24.76 
 
 		 648 aa  74.7  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1239  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.22 
 
 		 657 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  25.77 
 
 		 653 aa  74.7  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 706 aa  74.7  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.22 
 
 		 783 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  24.76 
 
 		 648 aa  74.7  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4419  UvrD/REP helicase  20.07 
 
 		 556 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.62 
 
 		 713 aa  74.7  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.9 
 
 		 825 aa  74.3  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.33 
 
 		 787 aa  74.3  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 		 725 aa  74.3  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  27.82 
 
 		 1050 aa  74.3  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  25.89 
 
 		 787 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  25.89 
 
 		 787 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1120  ATP-dependent DNA helicase  28.22 
 
 		 688 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  25.89 
 
 		 787 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 743 aa  73.9  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  26.45 
 
 		 814 aa  73.9  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  25.89 
 
 		 787 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  25.95 
 
 		 684 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  25.27 
 
 		 1089 aa  73.9  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.71 
 
 		 719 aa  73.6  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  26.59 
 
 		 726 aa  73.6  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.86 
 
 		 741 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  26.57 
 
 		 790 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  26.15 
 
 		 826 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.71 
 
 		 787 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.66 
 
 		 682 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.31 
 
 		 818 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  25.18 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  25.18 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.62 
 
 		 786 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  25.18 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  25.36 
 
 		 787 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  25.62 
 
 		 786 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4007  DNA-dependent helicase II  25.53 
 
 		 720 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984144  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25 
 
 		 816 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  24.5 
 
 		 723 aa  72.8  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1967  UvrD/REP helicase  26.33 
 
 		 789 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 		 787 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0641  UvrD/REP helicase  24.52 
 
 		 602 aa  72  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  25.8 
 
 		 721 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  25.8 
 
 		 721 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.49 
 
 		 711 aa  72  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  25.51 
 
 		 678 aa  72  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  25.66 
 
 		 720 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0039  UvrD/REP helicase  26.98 
 
 		 599 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.830062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.6 
 
 		 731 aa  72  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 		 787 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0545  DNA-dependent helicase II  25.66 
 
 		 720 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  24.56 
 
 		 737 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.41 
 
 		 748 aa  71.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 		 787 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  25.98 
 
 		 659 aa  71.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3174  UvrD/REP helicase  22.32 
 
 		 557 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.938492  unclonable  0.0000000000000324964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 		 846 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 		 840 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  27.71 
 
 		 620 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  26.09 
 
 		 678 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3407  UvrD/REP helicase  25.81 
 
 		 604 aa  70.5  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0218597  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 781 aa  70.5  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.517963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>