More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0672 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3055  UvrD/REP helicase  61.99 
 
 		 608 aa  746    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3186  UvrD/REP helicase  62.06 
 
 		 603 aa  746    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.985169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0672  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 595 aa  1227    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0183847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3048  UvrD/REP helicase  61.15 
 
 		 608 aa  746    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0267526  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1515  UvrD/REP helicase  35.71 
 
 		 575 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0347716  hitchhiker  2.10005e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4163  UvrD/REP helicase  36.87 
 
 		 550 aa  339  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.533051  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2458  UvrD/REP helicase  33.99 
 
 		 586 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411519  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0546  UvrD/REP helicase  33.61 
 
 		 569 aa  256  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  30.07 
 
 		 845 aa  96.3  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  28.78 
 
 		 715 aa  95.1  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  25.49 
 
 		 787 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  27.21 
 
 		 656 aa  80.9  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  25.48 
 
 		 735 aa  80.5  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0641  UvrD/REP helicase  28.03 
 
 		 602 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.55 
 
 		 694 aa  77.8  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  24.03 
 
 		 726 aa  77  0.0000000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.63 
 
 		 783 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  19.84 
 
 		 749 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  26.44 
 
 		 735 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 		 741 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  22.07 
 
 		 724 aa  75.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  23.19 
 
 		 783 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  23.21 
 
 		 790 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  26.98 
 
 		 743 aa  75.5  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 739 aa  75.5  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  21.99 
 
 		 680 aa  74.7  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  22.41 
 
 		 739 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0795  UvrD/REP helicase  26.92 
 
 		 639 aa  73.9  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.790736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.51 
 
 		 729 aa  73.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  23.36 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  23.36 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  22.91 
 
 		 787 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  21.54 
 
 		 648 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  22.91 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  23.36 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  23.36 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  22.91 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  21.54 
 
 		 648 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  23.19 
 
 		 787 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.21 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  23.55 
 
 		 688 aa  70.9  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  23.63 
 
 		 746 aa  70.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  24.16 
 
 		 666 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  27.27 
 
 		 724 aa  70.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3526  hypothetical protein  26.45 
 
 		 617 aa  70.5  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.396406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 668 aa  70.5  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.39 
 
 		 766 aa  70.5  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  25.86 
 
 		 630 aa  70.1  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  23.04 
 
 		 657 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  23.71 
 
 		 681 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  24.1 
 
 		 743 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  23.97 
 
 		 732 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  22.4 
 
 		 741 aa  69.7  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  21.68 
 
 		 722 aa  68.9  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  22.35 
 
 		 744 aa  69.7  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 730 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.31 
 
 		 745 aa  68.6  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.43 
 
 		 677 aa  68.6  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  22.72 
 
 		 786 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  25.09 
 
 		 678 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  27.84 
 
 		 1132 aa  68.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  25.43 
 
 		 677 aa  68.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.65 
 
 		 725 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  23.28 
 
 		 786 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.15 
 
 		 828 aa  68.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3407  UvrD/REP helicase  25.64 
 
 		 604 aa  68.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0218597  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.47 
 
 		 759 aa  67.8  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  29.22 
 
 		 1001 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  23.97 
 
 		 783 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  26.1 
 
 		 720 aa  67.4  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  22.45 
 
 		 786 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  26.1 
 
 		 723 aa  67.4  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.32 
 
 		 747 aa  67  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.39 
 
 		 726 aa  67  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 		 620 aa  67.4  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00076  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.61 
 
 		 671 aa  67  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0599  UvrD/REP helicase  29.21 
 
 		 697 aa  67  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  24.5 
 
 		 846 aa  67  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  23.99 
 
 		 787 aa  67  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  24.64 
 
 		 678 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  22.63 
 
 		 829 aa  67  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  23.99 
 
 		 787 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.13 
 
 		 741 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  21.29 
 
 		 721 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  22.75 
 
 		 723 aa  67  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.41 
 
 		 751 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.69 
 
 		 751 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  27.17 
 
 		 779 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.404442 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  22.75 
 
 		 723 aa  67  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  27.38 
 
 		 1089 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1845  UvrD/REP helicase  22.83 
 
 		 620 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  27.94 
 
 		 725 aa  66.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  23.99 
 
 		 787 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  24.2 
 
 		 678 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  21.12 
 
 		 721 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  22.7 
 
 		 714 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  23.01 
 
 		 755 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  20.92 
 
 		 773 aa  66.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0754  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.01 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.643559  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  23.99 
 
 		 840 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>