More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3048 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3048  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 608 aa  1257    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0267526  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3186  UvrD/REP helicase  57.02 
 
 		 603 aa  723    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.985169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0672  UvrD/REP helicase  61.15 
 
 		 595 aa  746    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0183847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3055  UvrD/REP helicase  92.76 
 
 		 608 aa  1166    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1515  UvrD/REP helicase  37.62 
 
 		 575 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0347716  hitchhiker  2.10005e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4163  UvrD/REP helicase  38.28 
 
 		 550 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.533051  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2458  UvrD/REP helicase  33.55 
 
 		 586 aa  288  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411519  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0546  UvrD/REP helicase  31.85 
 
 		 569 aa  239  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 		 845 aa  93.2  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  24.87 
 
 		 739 aa  91.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  24.59 
 
 		 741 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 715 aa  84.7  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1133  UvrD/REP helicase  25.33 
 
 		 688 aa  84  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  23.64 
 
 		 743 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  25.4 
 
 		 735 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1279  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.33 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1346  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.07 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1146  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.07 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1127  ATP-dependent DNA helicase  25.07 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1239  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.07 
 
 		 657 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1384  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.07 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00158737  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.51 
 
 		 734 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  27.84 
 
 		 1032 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0795  UvrD/REP helicase  27.99 
 
 		 639 aa  80.9  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.790736  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  22 
 
 		 749 aa  80.9  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  26.25 
 
 		 656 aa  80.5  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1307  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.07 
 
 		 688 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000490806 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1120  ATP-dependent DNA helicase  25.07 
 
 		 688 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.8 
 
 		 662 aa  79.7  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  23.16 
 
 		 743 aa  80.1  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4063  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  24.8 
 
 		 688 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  21.75 
 
 		 666 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  27.18 
 
 		 678 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.13 
 
 		 748 aa  78.6  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  26.15 
 
 		 741 aa  78.2  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  24.27 
 
 		 684 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.79 
 
 		 741 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.33 
 
 		 659 aa  75.9  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 725 aa  76.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  24.42 
 
 		 666 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.82 
 
 		 729 aa  75.5  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.42 
 
 		 671 aa  74.3  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.67 
 
 		 753 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  24.55 
 
 		 659 aa  73.9  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  24.26 
 
 		 706 aa  73.6  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.67 
 
 		 747 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.67 
 
 		 751 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  24.67 
 
 		 753 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  24.67 
 
 		 751 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  23.78 
 
 		 714 aa  73.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.4 
 
 		 730 aa  73.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.67 
 
 		 747 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  23.26 
 
 		 773 aa  73.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.67 
 
 		 751 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.25 
 
 		 758 aa  73.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.4 
 
 		 730 aa  73.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.67 
 
 		 751 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.67 
 
 		 753 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  25.5 
 
 		 787 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.84 
 
 		 732 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  25.73 
 
 		 655 aa  72.8  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.12 
 
 		 672 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  25.48 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.02 
 
 		 743 aa  72.4  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 630 aa  72.4  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  25.5 
 
 		 840 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.99 
 
 		 766 aa  73.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  22.5 
 
 		 724 aa  72.8  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.48 
 
 		 759 aa  72  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.07 
 
 		 932 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  25.66 
 
 		 755 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.21 
 
 		 726 aa  72  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.21 
 
 		 787 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  29.11 
 
 		 743 aa  72  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1089 aa  72  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  25.21 
 
 		 846 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  23.53 
 
 		 688 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.89 
 
 		 731 aa  71.6  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  24.08 
 
 		 726 aa  71.6  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  25.21 
 
 		 787 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  25.21 
 
 		 787 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  27.31 
 
 		 787 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  27.31 
 
 		 787 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  27.31 
 
 		 787 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.61 
 
 		 755 aa  71.2  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  26.04 
 
 		 778 aa  71.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.8 
 
 		 745 aa  70.9  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  25.84 
 
 		 668 aa  70.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 783 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0641  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 		 602 aa  70.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.81 
 
 		 725 aa  70.5  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  24.67 
 
 		 735 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.42 
 
 		 783 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 		 648 aa  70.5  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  26.94 
 
 		 787 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  26.94 
 
 		 787 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  24.1 
 
 		 789 aa  70.5  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 		 648 aa  70.5  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  26.94 
 
 		 787 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  26.94 
 
 		 787 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>